28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0271 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0271  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  984    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  decreased coverage  0.00169568 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1567  hypothetical protein  33.01 
 
 		 522 aa  242  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2222  hypothetical protein  36.92 
 
 		 499 aa  229  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17220  hypothetical protein  34.97 
 
 		 477 aa  222  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.96015  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2029  hypothetical protein  37.39 
 
 		 490 aa  217  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22890  Methyl-accepting chemotaxis protein  29.91 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3740  hypothetical protein  27.61 
 
 		 485 aa  83.6  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0065  hypothetical protein  26.26 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.950662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0870  hypothetical protein  23.97 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.282403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03537  hypothetical protein  26.47 
 
 		 490 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.206866  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26590  hypothetical protein  25.12 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3942  hypothetical protein  24.86 
 
 		 482 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3164  hypothetical protein  24.26 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2296  hypothetical protein  27.09 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.357562  normal  0.109764 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4005  hypothetical protein  25.37 
 
 		 489 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0110668 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2278  hypothetical protein  25.54 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03600  hypothetical protein  27.3 
 
 		 510 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0737  hypothetical protein  25 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.509556  normal  0.0133056 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2185  hypothetical protein  24.31 
 
 		 510 aa  57  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0780  hypothetical protein  25.58 
 
 		 481 aa  54.3  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1630  hypothetical protein  27.53 
 
 		 486 aa  53.9  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1446  hypothetical protein  25.51 
 
 		 482 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1123  hypothetical protein  23.2 
 
 		 488 aa  51.6  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.963285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0017  hypothetical protein  23.62 
 
 		 484 aa  50.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0838  hypothetical protein  25 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0518  hypothetical protein  22.74 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.566512  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0901  hypothetical protein  25.51 
 
 		 483 aa  47  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0797032  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03250  hypothetical protein  23.74 
 
 		 538 aa  43.5  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127047  unclonable  2.10051e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>