153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0265 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  100 
 
 
453 aa  899    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  52.06 
 
 
460 aa  415  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  47.14 
 
 
485 aa  383  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  48.35 
 
 
447 aa  380  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  50.45 
 
 
457 aa  352  8e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  50 
 
 
410 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 
466 aa  349  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  46.54 
 
 
465 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  31.93 
 
 
460 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  33.85 
 
 
461 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  35.38 
 
 
435 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  31.81 
 
 
440 aa  226  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  29.01 
 
 
459 aa  225  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  35.33 
 
 
437 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  35.33 
 
 
437 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  31.28 
 
 
436 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  30.43 
 
 
440 aa  219  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  35.89 
 
 
461 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  31.13 
 
 
416 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  30.11 
 
 
440 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  34.55 
 
 
422 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
433 aa  208  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  33.11 
 
 
419 aa  199  7e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  30.79 
 
 
447 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  29.84 
 
 
436 aa  197  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  29.06 
 
 
441 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  29.96 
 
 
441 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  29.96 
 
 
441 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  29.4 
 
 
441 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  29.4 
 
 
441 aa  192  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  29.4 
 
 
441 aa  193  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  29.4 
 
 
441 aa  192  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  29.4 
 
 
441 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  29.4 
 
 
441 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  29.74 
 
 
441 aa  192  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  30.15 
 
 
440 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  29.4 
 
 
441 aa  192  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  29.52 
 
 
441 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  32.03 
 
 
424 aa  190  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  29.41 
 
 
442 aa  176  6e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  30.32 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  30.8 
 
 
453 aa  171  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  29.67 
 
 
450 aa  171  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  29.76 
 
 
450 aa  171  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  29.67 
 
 
450 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  29.67 
 
 
450 aa  170  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  29.78 
 
 
455 aa  169  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  29.3 
 
 
450 aa  169  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 
450 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  29.07 
 
 
450 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  31.4 
 
 
427 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  28.72 
 
 
451 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  28.72 
 
 
451 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  29.98 
 
 
450 aa  168  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  28.51 
 
 
451 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  28.51 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  28.51 
 
 
451 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  27.6 
 
 
451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  26.86 
 
 
415 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 
415 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  28.09 
 
 
468 aa  161  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
440 aa  154  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.68 
 
 
440 aa  150  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  26.8 
 
 
442 aa  150  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  27.68 
 
 
440 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  27.68 
 
 
440 aa  149  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  27.92 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.1 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.47 
 
 
440 aa  146  8.000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  25.88 
 
 
442 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  25.11 
 
 
438 aa  137  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  28.29 
 
 
446 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  25.42 
 
 
442 aa  136  9e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4139  glycoside hydrolase family protein  27.27 
 
 
490 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  28.19 
 
 
439 aa  124  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  26 
 
 
435 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5121  alpha-galactosidase  26.8 
 
 
490 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.642601  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5908  glycoside hydrolase family 4  27.03 
 
 
488 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  28.33 
 
 
447 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6878  glycoside hydrolase family 4  26.88 
 
 
488 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.036749  normal  0.397906 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  26.46 
 
 
462 aa  111  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  24.22 
 
 
441 aa  110  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  23.73 
 
 
441 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  25.05 
 
 
435 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  25.95 
 
 
432 aa  105  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0769  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 
440 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4644  alpha-galactosidase  26.36 
 
 
451 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  26.36 
 
 
451 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5633  alpha-galactosidase  26.08 
 
 
451 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4360  alpha-galactosidase  25.74 
 
 
451 aa  103  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3873  glycoside hydrolase family 4  25.74 
 
 
451 aa  103  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  26.36 
 
 
451 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  26.27 
 
 
432 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03990  alpha-galactosidase, NAD(P)-binding  26.03 
 
 
451 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03951  hypothetical protein  26.03 
 
 
451 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4585  alpha-galactosidase  25.85 
 
 
451 aa  103  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4644  alpha-galactosidase  26.14 
 
 
451 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4693  alpha-galactosidase  26.14 
 
 
451 aa  103  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.44607  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3908  glycoside hydrolase family protein  25.51 
 
 
451 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>