More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0250 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  100 
 
 		 266 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  57.14 
 
 		 295 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  57.53 
 
 		 265 aa  265  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  53.67 
 
 		 274 aa  259  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  53.49 
 
 		 275 aa  252  5.000000000000001e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  54.44 
 
 		 269 aa  252  5.000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  50.77 
 
 		 284 aa  249  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  49.42 
 
 		 259 aa  237  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  48.84 
 
 		 288 aa  228  9e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  47.81 
 
 		 282 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  45.8 
 
 		 311 aa  210  2e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  43.46 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.454773 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  42.15 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  37.41 
 
 		 271 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  36.67 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  36.67 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  35.19 
 
 		 267 aa  125  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  34.94 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  35.82 
 
 		 271 aa  113  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  34.56 
 
 		 277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  33.46 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  34.96 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  35.09 
 
 		 264 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  36.36 
 
 		 273 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  33.96 
 
 		 265 aa  106  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  35.16 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  33.21 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 279 aa  102  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.7 
 
 		 290 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  36.74 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.97 
 
 		 278 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  29.04 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  33.21 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 266 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  31.29 
 
 		 277 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  26.12 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  33.08 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1746  Cof-like hydrolase  28.62 
 
 		 262 aa  92.4  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  31.87 
 
 		 268 aa  92  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  32.71 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  28.67 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  26.22 
 
 		 267 aa  90.1  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1162  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.27 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.352736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  31.97 
 
 		 267 aa  89.4  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  30.85 
 
 		 285 aa  89  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1218  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3885  HAD superfamily hydrolase  27.97 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3990  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.97 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3717  HAD superfamily hydrolase  27.97 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1882  HAD superfamily hydrolase  26.39 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4188  HAD superfamily hydrolase  27.97 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1446  Cof-like hydrolase  25.75 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4024  HAD superfamily hydrolase  26.92 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1001  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.16 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4095  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.92 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603342  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  30.57 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3733  HAD superfamily hydrolase  26.54 
 
 		 257 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4078  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.52 
 
 		 257 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00227623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  28.04 
 
 		 268 aa  85.9  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  27.38 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.38 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  27.38 
 
 		 273 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  33.83 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  34.07 
 
 		 259 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2176  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  26.64 
 
 		 258 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.685473  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  27.01 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.01 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  27.01 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  27.01 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  27.01 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  32.25 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  27.01 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  23.93 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3802  Cof-like hydrolase  25.77 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.438125  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl513  HAD-superfamily cof-like hydrolase  25.95 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2677  Cof-like hydrolase  27.57 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00196441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.98 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  23.05 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.98 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  23.05 
 
 		 274 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  26.64 
 
 		 269 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.98 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.64 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  26.88 
 
 		 273 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  30.08 
 
 		 271 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1028  Cof-like hydrolase  26.9 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  28.74 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  24.73 
 
 		 274 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.01 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1419  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00926207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1392  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 		 267 aa  80.5  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000626489  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  27.11 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  26.28 
 
 		 269 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  32.26 
 
 		 285 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  26.74 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>