More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0249 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0249  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 431 aa  869    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00955912  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3184  seryl-tRNA synthetase  73.54 
 
 		 426 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  normal  0.0407515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3242  seryl-tRNA synthetase  72.3 
 
 		 424 aa  592  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01270  seryl-tRNA synthetase  69.72 
 
 		 421 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.380237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0123  seryl-tRNA synthetase  69.25 
 
 		 418 aa  588  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01720  seryl-tRNA synthetase  72.04 
 
 		 422 aa  586  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0140  seryl-tRNA synthetase  68.93 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0118  seryl-tRNA synthetase  70.21 
 
 		 416 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0142  Serine--tRNA ligase  66.67 
 
 		 420 aa  572  1.0000000000000001e-162  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0180  seryl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 419 aa  572  1.0000000000000001e-162  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0285  seryl-tRNA synthetase  68.69 
 
 		 426 aa  569  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.125117 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0379  seryl-tRNA synthetase  70.74 
 
 		 423 aa  568  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.490455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0265  seryl-tRNA synthetase  68.54 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.540225  normal  0.498344 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01690  seryl-tRNA synthetase  69.72 
 
 		 426 aa  570  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.335303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0072  seryl-tRNA synthetase  68.32 
 
 		 421 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01150  seryl-tRNA synthetase  69.6 
 
 		 427 aa  558  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0149  seryl-tRNA synthetase  68.4 
 
 		 417 aa  560  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1150  seryl-tRNA synthetase  68.4 
 
 		 445 aa  552  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113089  normal  0.0626526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6170  seryl-tRNA synthetase  69.27 
 
 		 422 aa  549  1e-155  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0245  seryl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 425 aa  544  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5410  seryl-tRNA synthetase  69.43 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192116  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5029  seryl-tRNA synthetase  69.43 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.88851  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5272  seryl-tRNA synthetase  65.65 
 
 		 436 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0719173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5117  seryl-tRNA synthetase  69.43 
 
 		 417 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5659  seryl-tRNA synthetase  68.72 
 
 		 419 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.466733  normal  0.143562 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06830  seryl-tRNA synthetase  67.37 
 
 		 423 aa  538  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623726  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0031  seryl-tRNA synthetase  68.16 
 
 		 422 aa  532  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0231  seryl-tRNA synthetase  67.29 
 
 		 420 aa  528  1e-148  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13868  seryl-tRNA synthetase  67.38 
 
 		 419 aa  521  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.458781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0357  serine--tRNA ligase  61.27 
 
 		 428 aa  523  1e-147  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2104  seryl-tRNA synthetase  63.76 
 
 		 420 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.433049 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1760  seryl-tRNA synthetase  58.69 
 
 		 428 aa  510  1e-143  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.683795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0174  seryl-tRNA synthetase  62.74 
 
 		 424 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0278  seryl-tRNA synthetase  62.03 
 
 		 433 aa  502  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.494659  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1145  seryl-tRNA synthetase  46.52 
 
 		 411 aa  341  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1382  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 425 aa  330  4e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.346171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  40.85 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1086  seryl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 424 aa  306  3e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  38.79 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  42.04 
 
 		 424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 423 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  38.24 
 
 		 428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  38.72 
 
 		 428 aa  302  7.000000000000001e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 427 aa  302  7.000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 426 aa  302  8.000000000000001e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  39.58 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 426 aa  300  3e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  38.03 
 
 		 422 aa  300  3e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0731  seryl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  39.35 
 
 		 427 aa  299  5e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  39.43 
 
 		 424 aa  299  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1511  seryl-tRNA synthetase  35.8 
 
 		 421 aa  299  7e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0147208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  39.19 
 
 		 424 aa  297  2e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 425 aa  298  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  39.81 
 
 		 423 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  38.41 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  37 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 424 aa  296  4e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  40.05 
 
 		 423 aa  296  5e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0979  seryl-tRNA synthetase  39.38 
 
 		 423 aa  296  6e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0594  seryl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 430 aa  295  1e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  39.63 
 
 		 428 aa  294  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2507  seryl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 425 aa  294  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.781035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  39.57 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  39.12 
 
 		 427 aa  294  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0842  seryl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 452 aa  294  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 425 aa  293  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  39.34 
 
 		 426 aa  293  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 425 aa  293  6e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 427 aa  292  1e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  39.62 
 
 		 420 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0533  seryl-tRNA synthetase  38.37 
 
 		 411 aa  290  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 425 aa  291  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37135  predicted protein  39.16 
 
 		 502 aa  291  2e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000503836  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  40.98 
 
 		 424 aa  290  4e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  38.3 
 
 		 423 aa  289  7e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0231  seryl-tRNA synthetase  35.6 
 
 		 425 aa  288  1e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0372  seryl-tRNA synthetase  37.88 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  38.81 
 
 		 425 aa  287  2e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  37.77 
 
 		 422 aa  288  2e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  37.29 
 
 		 422 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0573  seryl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 425 aa  286  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  39.86 
 
 		 423 aa  286  5.999999999999999e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3636  seryl-tRNA synthetase  38.48 
 
 		 413 aa  285  8e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000529029 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 423 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  37.5 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  39.72 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 421 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>