228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0180 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0180  Alkaline phosphatase  100 
 
 
671 aa  1367    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245482  normal  0.47349 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1289  alkaline phosphatase  45.14 
 
 
580 aa  449  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0302462  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0605  alkaline phosphatase  44.73 
 
 
584 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6455  alkaline phosphatase  43.59 
 
 
609 aa  430  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3920  Alkaline phosphatase  43.75 
 
 
581 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4114  Alkaline phosphatase  43.58 
 
 
581 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.904627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4230  Alkaline phosphatase  43.48 
 
 
584 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0380845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3906  Alkaline phosphatase  43.3 
 
 
584 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.290232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0089  alkaline phosphatase  43.36 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0714  alkaline phosphatase  43.72 
 
 
589 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.818593 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1592  alkaline phosphatase  41.25 
 
 
581 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0396  Alkaline phosphatase  43.76 
 
 
585 aa  389  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0030  alkaline phosphatase  42.36 
 
 
582 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152567  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3156  Alkaline phosphatase  40.45 
 
 
585 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.7511  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3306  hypothetical protein  40.45 
 
 
585 aa  372  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0346312  normal  0.32021 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2364  alkaline phosphatase  40.53 
 
 
575 aa  366  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0542806  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3000  alkaline phosphatase  40.45 
 
 
575 aa  350  6e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2187  alkaline phosphatase family protein  34.32 
 
 
689 aa  275  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.838845  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02493  extracellular phytase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14030)  30.32 
 
 
663 aa  231  5e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.468824 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0098  putative alkaline phosphatase signal peptide protein  35.6 
 
 
467 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4085  alkaline phosphatase  36.99 
 
 
467 aa  208  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000151439  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3330  Alkaline phosphatase  37.04 
 
 
464 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5567  alkaline phosphatase  35.11 
 
 
518 aa  206  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.495635  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0106  alkaline phosphatase family protein  36.23 
 
 
467 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.115439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3074  alkaline phosphatase family protein  36.23 
 
 
467 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2020  alkaline phosphatase family protein  36.23 
 
 
467 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0385  alkaline phosphatase family protein  36.44 
 
 
467 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0405  alkaline phosphatase family protein  36.44 
 
 
467 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2266  alkaline phosphatase family protein  36.23 
 
 
467 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.277921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0568  alkaline phosphatase family protein  36.44 
 
 
467 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3653  Alkaline phosphatase  36.83 
 
 
464 aa  204  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3331  Alkaline phosphatase  35.29 
 
 
485 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.971304  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0982  alkaline phosphatase  35.79 
 
 
480 aa  201  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1041  Alkaline phosphatase  36.27 
 
 
478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3654  Alkaline phosphatase  35.26 
 
 
485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2852  alkaline phosphatase  35.46 
 
 
463 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757142  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0333  alkaline phosphatase family protein  35.61 
 
 
466 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4084  alkaline phosphatase  33.94 
 
 
486 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0795005  normal  0.541541 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5568  alkaline phosphatase  35.05 
 
 
470 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0485487  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0981  alkaline phosphatase  36.36 
 
 
471 aa  191  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.681601  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1040  Alkaline phosphatase  35.19 
 
 
468 aa  183  8.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0097  putative alkaline phosphatase lipoprotein transmembrane  34.43 
 
 
483 aa  182  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2853  alkaline phosphatase  34.92 
 
 
478 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3691  alkaline phosphatase  38.95 
 
 
545 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0686  Alkaline phosphatase  38.95 
 
 
545 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33820  Alkaline phosphatase  32.77 
 
 
548 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055185  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0696  alkaline phosphatase  38.95 
 
 
545 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1349  alkaline phosphatase  34.02 
 
 
543 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.29054  decreased coverage  0.000000619726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0665  alkaline phosphatase  38.95 
 
 
545 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0770  alkaline phosphatase  33.41 
 
 
434 aa  176  9e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3369  alkaline phosphatase  38.95 
 
 
546 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0584  alkaline phosphatase  38.95 
 
 
546 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0793  alkaline phosphatase  33.76 
 
 
434 aa  173  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3539  alkaline phosphatase  38.66 
 
 
546 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0332  alkaline phosphatase family protein  33.46 
 
 
557 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1249  alkaline phosphatase  33.05 
 
 
543 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.837433  normal  0.877858 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1206  alkaline phosphatase  31.38 
 
 
505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.43523  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1157  alkaline phosphatase  33.6 
 
 
545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00798229 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0685  Alkaline phosphatase  29.58 
 
 
501 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3249  alkaline phosphatase  35.39 
 
 
471 aa  163  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0984857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0664  alkaline phosphatase  29.58 
 
 
498 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0695  alkaline phosphatase  29.58 
 
 
498 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3692  alkaline phosphatase  29.58 
 
 
498 aa  163  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0384  alkaline phosphatase family protein  33.47 
 
 
479 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0404  alkaline phosphatase family protein  33.88 
 
 
476 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0567  alkaline phosphatase family protein subfamily, putative  33.47 
 
 
509 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0451  alkaline phosphatase  34.52 
 
 
471 aa  161  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00330  bacterial alkaline phosphatase  35.2 
 
 
471 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.744596  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00334  hypothetical protein  35.2 
 
 
471 aa  161  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.644931  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3225  Alkaline phosphatase  34.83 
 
 
471 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0457  alkaline phosphatase  34.83 
 
 
471 aa  160  8e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0410  alkaline phosphatase  34.83 
 
 
471 aa  160  8e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3073  alkaline phosphatase family protein  33.01 
 
 
577 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2021  alkaline phosphatase family protein  33.47 
 
 
476 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2265  alkaline phosphatase family protein  33.47 
 
 
476 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.113868  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0413  alkaline phosphatase  34.55 
 
 
471 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1144  alkaline phosphatase  34.21 
 
 
535 aa  160  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.342169  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2543  alkaline phosphatase  34.19 
 
 
640 aa  159  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.365989  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1376  alkaline phosphatase  36.79 
 
 
558 aa  158  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0116315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0854  alkaline phosphatase  34.94 
 
 
471 aa  158  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0691432 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3057  alkaline phosphatase  30 
 
 
557 aa  157  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.290343  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1350  alkaline phosphatase  29.01 
 
 
496 aa  157  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000312808 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3370  alkaline phosphatase  30.15 
 
 
498 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2890  Alkaline phosphatase  30.14 
 
 
568 aa  156  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0583  alkaline phosphatase  29.94 
 
 
498 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3932  alkaline phosphatase family protein  29.37 
 
 
527 aa  155  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1145  alkaline phosphatase  33.24 
 
 
499 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1241  Alkaline phosphatase  32.33 
 
 
455 aa  154  4e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3540  peptidoglycan glycosyltransferase  30.14 
 
 
498 aa  154  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0198  Alkaline phosphatase  34.76 
 
 
541 aa  154  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2542  alkaline phosphatase  30.6 
 
 
532 aa  154  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.22423  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002902  alkaline phosphatase  35.31 
 
 
525 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21410  alkaline phosphatase  35.47 
 
 
476 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0022288  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3027  alkaline phosphatase  35.29 
 
 
501 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.943732 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43722  vacuolar alkaline phosphatase  33.98 
 
 
501 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.563768  normal  0.0682876 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1250  alkaline phosphatase  28.72 
 
 
496 aa  152  3e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.895246 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1602  alkaline phosphatase  32.34 
 
 
565 aa  151  4e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0754  alkaline phosphatase  31.11 
 
 
433 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2208  alkaline phosphatase family protein  30.08 
 
 
489 aa  150  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.463635  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1158  alkaline phosphatase  31.99 
 
 
502 aa  150  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0069994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>