More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0148 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0148  Gamma-glutamyltransferase  100 
 
 
601 aa  1181    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0170697  normal  0.326932 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0896  gamma-glutamyltransferase  72.3 
 
 
615 aa  834    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0049  Gamma-glutamyltransferase  59.23 
 
 
593 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00700  gamma-glutamyltransferase 2  57.21 
 
 
594 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.303259 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1089  Gamma-glutamyltransferase  57 
 
 
607 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.19053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6122  Gamma-glutamyltransferase  56.46 
 
 
597 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0223308  normal  0.010406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2852  putative gamma-glutamyltranspeptidase  53.54 
 
 
600 aa  575  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0574  gamma-glutamyltranspeptidase  54.13 
 
 
601 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5360  gamma-glutamyltransferase  51.1 
 
 
594 aa  562  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4106  Gamma-glutamyltransferase  50 
 
 
594 aa  555  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2965  gamma-glutamyltransferase  50.58 
 
 
599 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3779  Gamma-glutamyltransferase  50.76 
 
 
593 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.909409 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4674  gamma-glutamyltransferase  53.24 
 
 
592 aa  526  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310466  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4046  gamma-glutamyltranspeptidase  49.34 
 
 
624 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358962  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3965  gamma-glutamyltransferase  50 
 
 
609 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.322229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3004  Gamma-glutamyltransferase  54.17 
 
 
612 aa  511  1e-143  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114415  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0464  Gamma-glutamyltransferase  51.29 
 
 
616 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0782147  normal  0.0485525 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4650  Gamma-glutamyltransferase  47.33 
 
 
594 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3531  gamma-glutamyltransferase  48.03 
 
 
613 aa  493  9.999999999999999e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2757  Gamma-glutamyltransferase  35.6 
 
 
586 aa  226  9e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.147984 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0999  gamma-glutamyltransferase  31.1 
 
 
564 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000130628 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5278  Gamma-glutamyltransferase  29.1 
 
 
642 aa  220  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3327  gamma-glutamyltransferase  31.98 
 
 
590 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.265631  normal  0.459611 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3514  gamma-glutamyltransferase 2  31.1 
 
 
570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3690  gamma-glutamyltransferase  30.94 
 
 
570 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.923878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3632  gamma-glutamyltransferase  30.77 
 
 
570 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0609  gamma-glutamyltransferase 2  31.1 
 
 
570 aa  213  9e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3042  gamma-glutamyltransferase  32.1 
 
 
630 aa  212  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3344  gamma-glutamyltransferase 2  30.94 
 
 
570 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1509  gamma-glutamyltransferase 2  33.85 
 
 
534 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.648349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0741  gamma-glutamyltranspeptidase  30.77 
 
 
545 aa  211  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3026  gamma-glutamyltransferase  33.44 
 
 
553 aa  211  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3814  gamma-glutamyltransferase  30.6 
 
 
570 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3224  gamma-glutamyltransferase  30.18 
 
 
570 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0604  gamma-glutamyltransferase  30.6 
 
 
570 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0669  gamma-glutamyltransferase  30.17 
 
 
568 aa  210  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0948  gamma-glutamyltransferase  30.63 
 
 
563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00481  gamma-glutamyltranspeptidase  31.31 
 
 
563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6136  gamma-glutamyltransferase  31.03 
 
 
573 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.898849 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3078  gamma-glutamyltransferase 2  32.47 
 
 
562 aa  200  7e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.588204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7627  putative gamma-glutamyltranspeptidase  33.16 
 
 
527 aa  198  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.376883  normal  0.693973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2683  gamma-glutamyltransferase  28.82 
 
 
565 aa  195  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.186681  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3343  gamma-glutamyltransferase  30.93 
 
 
579 aa  192  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0725574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1305  Gamma-glutamyltransferase  28.35 
 
 
643 aa  190  5e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.82304 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5078  gamma-glutamyltransferase  32.21 
 
 
533 aa  189  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908371  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3397  Gamma-glutamyltransferase  31.51 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2546  gamma-glutamyltransferase  31.74 
 
 
593 aa  183  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0295  gamma-glutamyltransferase 2  34.37 
 
 
543 aa  182  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0464  gamma-glutamyltransferase  29.53 
 
 
541 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0756  gamma-glutamyltransferase  30.56 
 
 
533 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.78639  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7242  gamma-glutamyltransferase  31.88 
 
 
531 aa  176  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2904  gamma-glutamyltransferase  31.22 
 
 
525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.46249 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2623  Gamma-glutamyltransferase  31.56 
 
 
533 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.337021  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2575  gamma-glutamyltransferase  32.03 
 
 
525 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3285  Gamma-glutamyltransferase  29.44 
 
 
534 aa  171  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.975122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0064  gamma-glutamyltransferase 2  29.8 
 
 
525 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0211818  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3710  gamma-glutamyltranspeptidase  32.76 
 
 
525 aa  169  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2529  Gamma-glutamyltransferase  32.42 
 
 
536 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.594827  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0079  Gamma-glutamyltransferase  33.21 
 
 
538 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2481  gamma-glutamyltransferase  27.79 
 
 
587 aa  166  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.566525  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1740  gamma-glutamyltransferase  30.83 
 
 
539 aa  166  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1464  gamma-glutamyltransferase 2  27.09 
 
 
561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.413745  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0787  gamma-glutamyltranspeptidase  27.84 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1019  gamma-glutamyltransferase  26.97 
 
 
586 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02050  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30.96 
 
 
538 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.388133 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0062  gamma-glutamyltransferase  27.46 
 
 
592 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2148  gamma-glutamyltranspeptidase  30.41 
 
 
576 aa  163  7e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3269  gamma-glutamyltransferase  27.49 
 
 
587 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.546804  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0691  gamma-glutamyltranspeptidase  28.65 
 
 
575 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0042  gamma-glutamyltransferase  26.22 
 
 
556 aa  162  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0926  gamma-glutamyltransferase  28.14 
 
 
534 aa  162  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000976792  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3730  gamma-glutamyltransferase  33.14 
 
 
542 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.647488  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0067  gamma-glutamyltransferase  26.26 
 
 
556 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2809  gamma-glutamyltransferase 2. Threonine peptidase. MEROPS family T03  28.69 
 
 
537 aa  161  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10788  bifunctional acylase ggtA: cephalosporin acylase + gamma-glutamyltranspeptidase  31.36 
 
 
512 aa  161  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1410  gamma-glutamyltranspeptidase  32.82 
 
 
601 aa  160  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3128  gamma-glutamyltransferase  27.32 
 
 
587 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6704  putative gamma-glutamyltranspeptidase  31.38 
 
 
557 aa  160  9e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0450418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0068  gamma-glutamyltransferase  27.12 
 
 
597 aa  159  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1057  gamma-glutamyltransferase  26.09 
 
 
587 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0278286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2556  gamma-glutamyltransferase  32.64 
 
 
525 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0244  putative gamma-glutamyltranspeptidase  30.13 
 
 
538 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1456  gamma-glutamyltransferase  27.22 
 
 
587 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05658  gamma-glutamyltranspeptidase (AFU_orthologue; AFUA_4G13580)  29.34 
 
 
606 aa  158  3e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.124875 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2329  gamma-glutamyltransferase  27.27 
 
 
576 aa  158  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0339697  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5529  gamma-glutamyltransferase  27.74 
 
 
583 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.383086  normal  0.95621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0996  gamma-glutamyltransferase 1  27.36 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1655  gamma-glutamyltransferase  26.73 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000129294  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3613  gamma-glutamyltransferase  27.74 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4754  gamma-glutamyltransferase  27.74 
 
 
583 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.436981 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1932  gamma-glutamyltransferase  32.25 
 
 
526 aa  157  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0274  gamma-glutamyltranspeptidase signal peptide protein  28.04 
 
 
578 aa  157  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0457705  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3565  gamma-glutamyltransferase 1  27.77 
 
 
575 aa  157  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.297566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1497  gamma-glutamyltransferase  32.7 
 
 
542 aa  157  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.915158  normal  0.24861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2158  gamma-glutamyltransferase  27.34 
 
 
576 aa  156  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.148613  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3386  gamma-glutamyltransferase  27.57 
 
 
579 aa  156  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4299  gamma-glutamyltransferase  27.26 
 
 
576 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264665  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4409  gamma-glutamyltransferase  27.26 
 
 
576 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0300  gamma-glutamyltransferase  30.68 
 
 
596 aa  155  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.791613  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3041  gamma-glutamyltransferase  30.26 
 
 
574 aa  155  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>