More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0140 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2152  putative transcriptional regulator, MerR family  62.5 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  53.66 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  60.75 
 
 		 116 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2176  transcriptional regulator, MerR family  59.81 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0135147  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1003  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 		 125 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2458  transcriptional regulator, MerR family  49.56 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  47.86 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  48.7 
 
 		 125 aa  98.2  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  45.13 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  47.79 
 
 		 138 aa  94.4  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  47.32 
 
 		 147 aa  89.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  43.51 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0486  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.277411  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  40.31 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1885  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.375979 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 		 135 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3524  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7954  putative transcriptional regulator, MerR family  40.71 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  44.44 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  42.99 
 
 		 112 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  40 
 
 		 114 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4283  MerR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.85164  normal  0.1781 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  39.23 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  37.17 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4735  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  39.8 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4970  MerR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  41.22 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5281  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5294  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4871  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5339  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5264  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27770  predicted transcriptional regulator  35.71 
 
 		 145 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0224211  normal  0.538153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4856  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 122 aa  67  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5026  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 151 aa  67  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5407  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9086  putative transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 162 aa  67  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  38.53 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5663  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  40.82 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1319  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.026746 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1569  MerR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.418349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.18 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2773  MerR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1754  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.164418 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4471  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  37.61 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00882257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1782  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0943  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3439  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.408622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4984  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1868  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.158881  hitchhiker  0.000791021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.67 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1429  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271555  decreased coverage  0.000928648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0947  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1844  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.051898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0085  transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 		 118 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  35.78 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4267  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  31.5 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0440  transcriptional regulator, MerR family  31.19 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.394631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  38.26 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 173 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>