74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0118 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05306  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  44.41 
 
 		 1429 aa  701    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2877  alpha-L-rhamnosidase  52.92 
 
 		 855 aa  817    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.287147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3580  alpha-L-rhamnosidase  41.22 
 
 		 918 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0618383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2708  alpha-L-rhamnosidase  54.21 
 
 		 931 aa  844    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000130197  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0689  alpha-L-rhamnosidase  46.75 
 
 		 935 aa  726    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28340  alpha-L-rhamnosidase  55.65 
 
 		 872 aa  848    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2047  alpha-L-rhamnosidase  56.37 
 
 		 859 aa  813    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.666145  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3887  alpha-L-rhamnosidase  39.74 
 
 		 904 aa  637    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3620  alpha-L-rhamnosidase  51.46 
 
 		 880 aa  734    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0426  alpha-L-rhamnosidase  50.74 
 
 		 763 aa  689    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.432012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3063  alpha-L-rhamnosidase  45.45 
 
 		 941 aa  693    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.813349  hitchhiker  0.00138683 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4669  alpha-L-rhamnosidase  53.7 
 
 		 829 aa  721    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0430  alpha-L-rhamnosidase  53.37 
 
 		 844 aa  775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2533  alpha-L-rhamnosidase  53.49 
 
 		 851 aa  704    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0119  alpha-L-rhamnosidase  52.82 
 
 		 757 aa  691    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0916317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0118  alpha-L-rhamnosidase  100 
 
 		 901 aa  1769    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.00141088  normal  0.763429 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07151  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  43.14 
 
 		 905 aa  711    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00711  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  45.35 
 
 		 1507 aa  716    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.210101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2783  alpha-L-rhamnosidase  44.48 
 
 		 941 aa  647    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.666994  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1838  alpha-L-rhamnosidase  48.6 
 
 		 832 aa  675    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4188  alpha-L-rhamnosidase  39.22 
 
 		 909 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0297646  normal  0.0625599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29670  alpha-L-rhamnosidase  49.19 
 
 		 774 aa  615  9.999999999999999e-175  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00310  alfa-L-rhamnosidase, putative  40.93 
 
 		 858 aa  607  9.999999999999999e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2735  alpha-L-rhamnosidase  41.99 
 
 		 899 aa  587  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.133276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1874  alpha-L-rhamnosidase  41.87 
 
 		 895 aa  577  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1249  alpha-L-rhamnosidase  34.85 
 
 		 951 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0242132 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0435  alpha-L-rhamnosidase  38.48 
 
 		 910 aa  534  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2265  rhamnosidase A  32.99 
 
 		 860 aa  531  1e-149  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.357027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2019  alfa-L-rhamnosidase  32.77 
 
 		 860 aa  523  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2347  alfa-L-rhamnosidase  32.77 
 
 		 860 aa  526  1e-147  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000365922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2019  alfa-L-rhamnosidase  31.83 
 
 		 860 aa  510  1e-143  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6551  alpha-L-rhamnosidase  43.86 
 
 		 1061 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.585079  hitchhiker  0.000045666 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0243  alpha-L-rhamnosidase  42.28 
 
 		 971 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.625341  normal  0.342916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8237  alpha-L-rhamnosidase  41.58 
 
 		 868 aa  484  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675022 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2781  alpha-L-rhamnosidase  30.94 
 
 		 910 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4080  alpha-L-rhamnosidase  30.3 
 
 		 916 aa  443  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1682  alpha-L-rhamnosidase  32.01 
 
 		 876 aa  437  1e-121  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000411087  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0172  alpha-L-rhamnosidase  32.58 
 
 		 894 aa  432  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.192026 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5609  alpha-L-rhamnosidase  38.02 
 
 		 776 aa  432  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6531  alpha-L-rhamnosidase  36.68 
 
 		 773 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.771829  normal  0.0306523 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1807  alpha-L-rhamnosidase  29.5 
 
 		 1251 aa  418  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0999515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1840  alpha-L-rhamnosidase  36.98 
 
 		 776 aa  416  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4893  hypothetical protein  40.69 
 
 		 873 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.284914  normal  0.489713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3741  alpha-L-rhamnosidase  32.84 
 
 		 1107 aa  402  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00158847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0156  alpha-L-rhamnosidase  36.29 
 
 		 1084 aa  396  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4085  alpha-L-rhamnosidase  25.19 
 
 		 926 aa  352  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.394304  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2759  alpha-L-rhamnosidase  27.61 
 
 		 916 aa  340  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.534251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1729  alpha-L-rhamnosidase  30.96 
 
 		 774 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1811  alpha-L-rhamnosidase  29.08 
 
 		 923 aa  323  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.770356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14240  alpha-L-rhamnosidase  33.02 
 
 		 761 aa  258  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.674959 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08465  alpha-rhamnosidase (Eurofung)  23.68 
 
 		 914 aa  215  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.638531  normal  0.620989 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1049  alpha-L-rhamnosidase  20.45 
 
 		 882 aa  160  7e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3899  alpha-L-rhamnosidase domain protein  27.58 
 
 		 910 aa  152  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.019543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3118  alpha-L-rhamnosidase  26.46 
 
 		 1118 aa  105  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1969  alpha-L-rhamnosidase  27.11 
 
 		 1188 aa  105  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.783425  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3974  alpha-L-rhamnosidase  22.73 
 
 		 733 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3716  alpha-L-rhamnosidase  23.44 
 
 		 801 aa  79  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0168  alpha-L-rhamnosidase  26.9 
 
 		 883 aa  77.8  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.950856  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6430  alpha-L-rhamnosidase  27.56 
 
 		 757 aa  72.4  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2737  alpha-L-rhamnosidase  19.75 
 
 		 734 aa  65.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000503167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2903  alpha-L-rhamnosidase  23.33 
 
 		 839 aa  64.3  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.839074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2039  alpha-L-rhamnosidase  23.18 
 
 		 955 aa  63.9  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6131  alpha-L-rhamnosidase  27.64 
 
 		 755 aa  61.2  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4246  alpha-L-rhamnosidase  21.49 
 
 		 793 aa  61.6  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5663  Ricin B lectin  22.11 
 
 		 1187 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3681  alpha-L-rhamnosidase  26.57 
 
 		 949 aa  58.5  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.500239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4105  alpha-L-rhamnosidase  20.37 
 
 		 728 aa  57  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0964  alpha-L-rhamnosidase  21.46 
 
 		 770 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2294  alpha-L-rhamnosidase  21.87 
 
 		 831 aa  57  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.690248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2773  alpha-L-rhamnosidase  19.39 
 
 		 734 aa  53.1  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00141117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2303  alpha-L-rhamnosidase  20.92 
 
 		 572 aa  49.7  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158323  normal  0.125431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0921  alpha-L-rhamnosidase  24.12 
 
 		 775 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0532  alpha-L-rhamnosidase  24.37 
 
 		 936 aa  47.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4418  alpha-L-rhamnosidase  30.67 
 
 		 826 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.475292  normal  0.531658 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>