More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0086 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0086  NmrA family protein  100 
 
 		 276 aa  534  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.143465  normal  0.0664825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36580  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  56.2 
 
 		 282 aa  268  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2683  NmrA family protein  56.89 
 
 		 304 aa  266  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.522631 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4578  NmrA family protein  57.25 
 
 		 288 aa  258  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3747  NmrA family protein  54.41 
 
 		 284 aa  254  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3950  NmrA family protein  53.65 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3112  NmrA family protein  52.17 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.949438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0033  NmrA family protein  54.04 
 
 		 301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.230657  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1047  hypothetical protein  47.99 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3320  NmrA family protein  52.14 
 
 		 295 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4570  NmrA family protein  52.84 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2380  NmrA family protein  41.03 
 
 		 294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27260  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.99 
 
 		 283 aa  150  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0212552  normal  0.143456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0640  NmrA family protein  34.49 
 
 		 291 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.698851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3036  NmrA family protein  36.92 
 
 		 281 aa  138  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137458  normal  0.0657403 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2808  NmrA-like  36.27 
 
 		 305 aa  135  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0843954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0253  NmrA family protein  29.97 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4664  NmrA family protein  42.92 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.715131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1727  NmrA family protein  39.3 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1619  NmrA family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2844  NmrA family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.570812  normal  0.211731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0086  hypothetical protein  35.09 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2414  NmrA family protein  38.21 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0724287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2311  hypothetical protein  35.54 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.869826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2877  NmrA family protein  37.81 
 
 		 285 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4611  NmrA family protein  34.87 
 
 		 283 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2507  hypothetical protein  34.4 
 
 		 285 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.246112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0551  NmrA family protein  36.57 
 
 		 271 aa  125  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4294  NmrA family protein  37.99 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4290  NmrA family protein  35.96 
 
 		 283 aa  124  2e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0025  NmrA family protein  35.36 
 
 		 287 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3550  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  34.41 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2793  hypothetical protein  33.1 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.184352  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1893  NmrA family protein  34.86 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.730888  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5728  NmrA family protein  32.36 
 
 		 286 aa  122  6e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.045756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4690  NmrA family protein  33.21 
 
 		 286 aa  122  9e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1972  NmrA family protein  33.45 
 
 		 295 aa  122  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2467  NmrA family protein  32.62 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.311321 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2104  NmrA family protein  33.21 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1883  NmrA family protein  34.93 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0607449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0421  NmrA family protein  37.55 
 
 		 285 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.798128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3782  NmrA family protein  32.36 
 
 		 286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3195  NmrA family protein  37.5 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04083  NAD(P)H:quinone oxidoreductase  32 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04046  hypothetical protein  32 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.288336  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4764  hypothetical protein  32.62 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3795  NmrA family protein  32 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6609  NmrA family protein  36.79 
 
 		 310 aa  119  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4669  hypothetical protein  32.26 
 
 		 282 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4679  hypothetical protein  31.9 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0639006  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4466  NmrA family protein  32.36 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.176692  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4780  NmrA family protein  32.36 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00502438  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4819  hypothetical protein  31.9 
 
 		 282 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3095  oxidoreductase  38.6 
 
 		 303 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4752  NmrA family protein  31.64 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4799  hypothetical protein  32.26 
 
 		 282 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3290  NmrA family protein  37.13 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.196739  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3219  NmrA family protein  38.77 
 
 		 285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2655  NmrA family protein  38.79 
 
 		 290 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4022  NmrA family protein  35.42 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.144571  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0383  NmrA family protein  34.75 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1512  NmrA family protein  38.05 
 
 		 284 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0499787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3622  NmrA family protein  34.89 
 
 		 289 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.163414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3899  NmrA family protein  38.41 
 
 		 287 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2013  NmrA family protein  37.4 
 
 		 285 aa  112  7.000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2611  NmrA family protein  37.82 
 
 		 279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.799657  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2665  hypothetical protein  34.16 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0499799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5083  NmrA family protein  32.23 
 
 		 292 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.624172  normal  0.697102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0622  NmrA family protein  38.17 
 
 		 284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0483  NmrA family protein  32.14 
 
 		 295 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1180  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  37.04 
 
 		 293 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1070  NmrA family protein  37.05 
 
 		 290 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1295  NmrA family protein  39.58 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0707892  normal  0.716609 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0005  NmrA family protein  32.49 
 
 		 281 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.761277  hitchhiker  0.0000000000896871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4590  NmrA family protein  33.08 
 
 		 283 aa  108  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4244  NmrA family protein  27.46 
 
 		 288 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.610502  normal  0.878819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5395  NmrA family protein  36.88 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.116097  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0581  NmrA family protein  31.77 
 
 		 288 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0691446 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2059  NmrA family protein  31.18 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.50688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3935  NmrA family protein  30.69 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00694182 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0404  NmrA family protein  33.69 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2017  NmrA family protein  37.27 
 
 		 303 aa  106  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2763  NmrA family protein  33.57 
 
 		 291 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2766  NmrA family protein  32.17 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251287  normal  0.56391 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6230  NmrA family protein  37.39 
 
 		 284 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.365966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3737  NmrA family protein  27.65 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6399  NmrA-like  37.83 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6632  NmrA family protein  37.83 
 
 		 284 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0862  NmrA family protein  38.27 
 
 		 282 aa  103  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0311672  normal  0.748824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1385  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.27 
 
 		 285 aa  102  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1439  NmrA family protein  33.45 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3920  NmrA family protein  35.14 
 
 		 284 aa  102  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0185  NmrA family protein  33.81 
 
 		 293 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0098  NmrA family protein  32.62 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153556  normal  0.0803508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3166  NmrA family protein  30.18 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4391  NmrA family protein  35.79 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.149608 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0209  hypothetical protein  33.45 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2575  NmrA family protein  32.98 
 
 		 295 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4018  NmrA family protein  34.4 
 
 		 285 aa  99.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6538  NmrA family protein  33.57 
 
 		 300 aa  99.4  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0326575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>