133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0085 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  100 
 
 		 536 aa  1081    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  56.64 
 
 		 535 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  53.14 
 
 		 520 aa  499  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  43.9 
 
 		 557 aa  427  1e-118  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  41.67 
 
 		 524 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  40.93 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  35.77 
 
 		 516 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  35.77 
 
 		 516 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  39.77 
 
 		 531 aa  319  9e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  37.34 
 
 		 528 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  37.13 
 
 		 535 aa  310  5e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  39.11 
 
 		 530 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  37.59 
 
 		 519 aa  300  4e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  38.03 
 
 		 532 aa  298  1e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  40.16 
 
 		 531 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  35.58 
 
 		 526 aa  293  6e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  36.11 
 
 		 533 aa  293  7e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  35.36 
 
 		 537 aa  289  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  34.69 
 
 		 541 aa  278  2e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  34.2 
 
 		 533 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  36.03 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  35.19 
 
 		 527 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  34.89 
 
 		 507 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  30.16 
 
 		 529 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  28.39 
 
 		 638 aa  193  7e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  27.76 
 
 		 646 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  30.68 
 
 		 492 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  25.47 
 
 		 644 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.46 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.46 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  28.35 
 
 		 478 aa  140  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  28 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.02 
 
 		 491 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.57 
 
 		 478 aa  124  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.67 
 
 		 478 aa  123  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 485 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  25 
 
 		 482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  24.64 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 		 482 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  25 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.36 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.46 
 
 		 478 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.9 
 
 		 487 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  25 
 
 		 482 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  25.77 
 
 		 478 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.44 
 
 		 490 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  24.79 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.29 
 
 		 523 aa  108  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  24.91 
 
 		 564 aa  106  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  29.8 
 
 		 418 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  31.29 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  23.39 
 
 		 573 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  32.93 
 
 		 624 aa  62.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  25.48 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.86 
 
 		 495 aa  59.7  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  25.2 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.55 
 
 		 647 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.55 
 
 		 647 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  23.49 
 
 		 454 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  32.41 
 
 		 647 aa  51.6  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  50 
 
 		 479 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  33.64 
 
 		 645 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  60.98 
 
 		 463 aa  50.4  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  31.62 
 
 		 495 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  25.87 
 
 		 685 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  24.35 
 
 		 515 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  32.45 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  58.54 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  32.39 
 
 		 431 aa  48.5  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  53.49 
 
 		 445 aa  48.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  39.78 
 
 		 503 aa  48.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  48.21 
 
 		 492 aa  47.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  50 
 
 		 624 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  33.33 
 
 		 519 aa  47.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  50 
 
 		 625 aa  47  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.47 
 
 		 496 aa  47  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  32.06 
 
 		 493 aa  47  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3575  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  53.85 
 
 		 736 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  55.56 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  44.68 
 
 		 353 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  57.5 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  57.5 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  31.19 
 
 		 639 aa  45.8  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  28.49 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  33.04 
 
 		 496 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2889  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.14 
 
 		 496 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.693571  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  45.71 
 
 		 465 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2964  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  56.1 
 
 		 689 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08359  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01470)  42.11 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  43.86 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  43.86 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  41.82 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6655  putative oxidoreductase  35.79 
 
 		 445 aa  44.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.349895  normal  0.0132597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  30.3 
 
 		 575 aa  45.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  28.1 
 
 		 459 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  39.19 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  29.93 
 
 		 508 aa  44.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>