13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0070 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0070  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  494  1e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.510417 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1991  PRC-barrel domain protein  41.18 
 
 
300 aa  64.3  2e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  36.27 
 
 
307 aa  64.3  2e-09  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0521  PRC-barrel domain protein  39.13 
 
 
322 aa  54.3  2e-06  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0475225 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  34.15 
 
 
283 aa  52  9e-06  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1161  hypothetical protein  37.04 
 
 
158 aa  52  9e-06  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4905e-10 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  30.63 
 
 
2449 aa  51.2  2e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  31.87 
 
 
301 aa  50.1  3e-05  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  28.57 
 
 
366 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  30.25 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23200  hypothetical protein  30.59 
 
 
273 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.738381  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  29.77 
 
 
1112 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.91 
 
 
1888 aa  43.1  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>