132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0069 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0069  UspA domain protein  100 
 
 		 132 aa  263  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3622  UspA domain protein  56.59 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0593  UspA domain protein  51.94 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00912023 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1392  UspA domain-containing protein  50.39 
 
 		 130 aa  112  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0407082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0629  hypothetical protein  44.19 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.210248  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2967  UspA domain-containing protein  47.69 
 
 		 133 aa  104  4e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.377799  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3499  UspA domain-containing protein  47.66 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.142026  normal  0.22977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2387  UspA domain protein  49.22 
 
 		 129 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.485221  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1530  UspA domain protein  46.15 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.292242  hitchhiker  0.00792009 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0356  UspA domain protein  44.19 
 
 		 134 aa  96.7  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16700  universal stress protein UspA-like protein  45.99 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.944045  normal  0.0341272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3007  UspA domain-containing protein  44.09 
 
 		 130 aa  94.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0455737 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2996  UspA domain-containing protein  40.31 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.415336  normal  0.638683 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2423  UspA domain protein  40.31 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.637502  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15870  universal stress protein UspA-like protein  44.85 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419674  normal  0.122814 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2058  UspA domain protein  45.31 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00862608  normal  0.687942 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3245  UspA domain-containing protein  41.27 
 
 		 130 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.411528  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1428  UspA domain protein  40.3 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.345166  normal  0.561125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3234  hypothetical protein  41.27 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3296  UspA domain-containing protein  41.27 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1020  hypothetical protein  38.76 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116113  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30450  universal stress protein UspA-like protein  40.31 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14340  universal stress protein UspA-like protein  44.62 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1992  UspA domain protein  42.64 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0324  UspA domain protein  41.3 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.324258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1913  UspA domain protein  52.5 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013645 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0738  UspA domain protein  37.98 
 
 		 143 aa  72  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.776623 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0905  UspA domain protein  37.98 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27210  universal stress protein UspA-like protein  40 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0515061  normal  0.419364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0160  UspA domain-containing protein  33.85 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000438875  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24960  universal stress family protein  34.65 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2484  UspA domain protein  34.59 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4334  UspA domain protein  34.78 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.67759  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2585  UspA domain protein  35.48 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0829  UspA domain protein  48.65 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4215  UspA domain protein  38.35 
 
 		 165 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3071  UspA domain protein  47.83 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1019  UspA domain protein  44.16 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2519  UspA domain protein  44 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.216844 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00830  universal stress protein UspA-like protein  50 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0639857  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2510  UspA domain protein  46.38 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.274926  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4363  UspA domain protein  37.14 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0756254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3006  UspA domain protein  44 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4188  UspA domain protein  43.24 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0572657  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0044  UspA domain protein  44.29 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.34339  normal  0.0217028 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1122  UspA domain protein  51.02 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.86 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.86 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3629  UspA domain protein  49.06 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.479844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2895  UspA domain protein  36.36 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4101  UspA domain protein  37.84 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  32.87 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  35.71 
 
 		 280 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3524  UspA domain protein  39.71 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2624  UspA domain protein  41.43 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1570  UspA domain protein  48.05 
 
 		 134 aa  51.2  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4404  UspA domain protein  46 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.11427  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3304  UspA domain protein  38.95 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4681  UspA domain protein  49.02 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.43423  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4351  UspA domain protein  33.62 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0863717  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3934  UspA domain protein  44.44 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0977  UspA domain protein  45.83 
 
 		 173 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.133496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  28.19 
 
 		 169 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2767  UspA domain protein  29.66 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3300  UspA domain protein  30.16 
 
 		 284 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176121  normal  0.0128083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 293 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29.93 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  35.14 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1801  UspA domain protein  28.26 
 
 		 373 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00612057  normal  0.112863 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3533  UspA domain protein  30.22 
 
 		 287 aa  46.2  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0361  UspA domain protein  34.06 
 
 		 293 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1335  UspA domain-containing protein  38.24 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1111  UspA domain protein  32.87 
 
 		 321 aa  45.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213436  normal  0.375797 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0002  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 201 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  39.29 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0221  UspA domain protein  39.19 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0564509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 		 170 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4829  universal stress protein  26.53 
 
 		 285 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  24.83 
 
 		 288 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  30.88 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0519  hypothetical protein  36.9 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581709  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1415  UspA domain-containing protein  29.71 
 
 		 295 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  29.21 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  43.14 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  43.14 
 
 		 157 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  32.91 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19290  universal stress protein UspA-like protein  38.17 
 
 		 178 aa  42.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.401097  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  36.47 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  36.92 
 
 		 280 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 151 aa  42  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4469  hypothetical protein  38.46 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.155394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28.68 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3628  UspA domain protein  38.95 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3655  UspA domain protein  43.75 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.850888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.79 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1386  UspA domain-containing protein  29.2 
 
 		 293 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.36 
 
 		 150 aa  42  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  33.33 
 
 		 143 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>