237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0068 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0068  protein of unknown function DUF112 transmembrane  100 
 
 		 518 aa  983    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3702  protein of unknown function DUF112 transmembrane  73.43 
 
 		 507 aa  609  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.863091  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0363  hypothetical protein  62.19 
 
 		 499 aa  558  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4255  hypothetical protein  60.55 
 
 		 505 aa  551  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.921544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1418  TRAP-T family transporter large inner membrane subunit  60.16 
 
 		 505 aa  545  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.221692  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3488  hypothetical protein  59.96 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0306  hypothetical protein  60.36 
 
 		 505 aa  546  1e-154  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5907  hypothetical protein  61.95 
 
 		 500 aa  540  9.999999999999999e-153  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.586249  normal  0.273775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2511  hypothetical protein  59.83 
 
 		 495 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0347112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3315  hypothetical protein  62.92 
 
 		 505 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.331598  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0831  hypothetical protein  63.01 
 
 		 504 aa  537  1e-151  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0103108  normal  0.527438 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3634  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.82 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3136  hypothetical protein  63.34 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.218269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8068  hypothetical protein  65.32 
 
 		 499 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.806841 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3073  hypothetical protein  60.04 
 
 		 499 aa  535  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36789 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3334  protein of unknown function DUF112 transmembrane  58.63 
 
 		 505 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6112  hypothetical protein  58.24 
 
 		 505 aa  533  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3602  hypothetical protein  60.58 
 
 		 489 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0423966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3006  hypothetical protein  59.88 
 
 		 513 aa  528  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0383827 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3500  hypothetical protein  61.13 
 
 		 513 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0583954  normal  0.298668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37810  hypothetical protein  63.58 
 
 		 504 aa  521  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133674 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1393  hypothetical protein  64.86 
 
 		 539 aa  516  1.0000000000000001e-145  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0764737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3442  protein of unknown function DUF112 transmembrane  63.06 
 
 		 511 aa  511  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0513015  normal  0.755379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3431  hypothetical protein  56.16 
 
 		 504 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.714006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3627  protein of unknown function DUF112 transmembrane  65.38 
 
 		 538 aa  505  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.854154  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3009  hypothetical protein  58.35 
 
 		 504 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.790814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1644  hypothetical protein  55.97 
 
 		 509 aa  505  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0974084  normal  0.013666 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3919  hypothetical protein  58.91 
 
 		 514 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3551  hypothetical protein  55.58 
 
 		 504 aa  503  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2567  hypothetical protein  58.69 
 
 		 495 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0343225 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3235  hypothetical protein  64.14 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3246  hypothetical protein  64.14 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.442644  normal  0.739387 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3297  hypothetical protein  64.14 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0388463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0996  protein of unknown function DUF112 transmembrane  56.24 
 
 		 513 aa  496  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2070  protein of unknown function DUF112 transmembrane  55.97 
 
 		 509 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3104  hypothetical protein  54.79 
 
 		 520 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.893861  normal  0.627849 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1236  hypothetical protein  57.32 
 
 		 507 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0594  protein of unknown function DUF112 transmembrane  62.67 
 
 		 512 aa  493  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.006033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2520  hypothetical protein  54.85 
 
 		 504 aa  485  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0500979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0397  hypothetical protein  59.06 
 
 		 497 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.331622  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2011  hypothetical protein  54.56 
 
 		 501 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3008  protein of unknown function DUF112 transmembrane  55.23 
 
 		 504 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6183  protein of unknown function DUF112 transmembrane  59.87 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4161  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.2 
 
 		 503 aa  463  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2146  protein of unknown function DUF112 transmembrane  50.1 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1827  protein of unknown function DUF112 transmembrane  52.99 
 
 		 518 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.349111 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00860  hypothetical protein  49.18 
 
 		 501 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0201156  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0321  protein of unknown function DUF112 transmembrane  51.31 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0793  hypothetical protein  45.69 
 
 		 500 aa  425  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3964  hypothetical protein  47.13 
 
 		 500 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.454339  normal  0.0362473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3644  hypothetical protein  47.1 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0805741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0740  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.06 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0810  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.09 
 
 		 500 aa  413  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2034  hypothetical protein  45.73 
 
 		 505 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.32397  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1721  hypothetical protein  44.29 
 
 		 500 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5730  hypothetical protein  47.4 
 
 		 500 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.673797  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3357  hypothetical protein  45.05 
 
 		 504 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0972974  hitchhiker  0.00431658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0844  hypothetical protein  45.31 
 
 		 500 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.828853  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3268  hypothetical protein  46.84 
 
 		 505 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.625282  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0825  hypothetical protein  45.06 
 
 		 500 aa  398  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0559407 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3089  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.86 
 
 		 536 aa  392  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3290  hypothetical protein  44.59 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4009  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.76 
 
 		 504 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7083  hypothetical protein  45.88 
 
 		 502 aa  389  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1439  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.65 
 
 		 500 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6101  hypothetical protein  45.69 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5393  hypothetical protein  44.04 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0732  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.63 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0015815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2745  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.26 
 
 		 503 aa  385  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2503  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.8 
 
 		 536 aa  379  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.835777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0355  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.41 
 
 		 519 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4102  hypothetical protein  46.81 
 
 		 501 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.574512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2790  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.58 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3411  hypothetical protein  44.04 
 
 		 503 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1319  hypothetical protein  42.74 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  0.48738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3166  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.71 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.508884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3457  protein of unknown function DUF112 transmembrane  44.71 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2387  hypothetical protein  43.49 
 
 		 496 aa  379  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0474916  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4402  hypothetical protein  44.53 
 
 		 502 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00944962  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1070  hypothetical protein  45.11 
 
 		 503 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0156  protein of unknown function DUF112 transmembrane  40.61 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6378  protein of unknown function DUF112 transmembrane  45.4 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0718351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4417  hypothetical protein  44.7 
 
 		 503 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1515  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.54 
 
 		 501 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.921221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1332  hypothetical protein  45.04 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3880  hypothetical protein  46.09 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.516145  normal  0.506281 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3299  hypothetical protein  45.03 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3056  putative transmembrane protein  45.06 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.325513  normal  0.65412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2563  protein of unknown function DUF112 transmembrane  46.67 
 
 		 500 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2895  hypothetical protein  42.69 
 
 		 508 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0852317  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0622  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.28 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1975  protein of unknown function DUF112 transmembrane  42.08 
 
 		 503 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0301079  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3421  hypothetical protein  45.86 
 
 		 502 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255924  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4452  hypothetical protein  41.92 
 
 		 507 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697965 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3237  hypothetical protein  45.45 
 
 		 503 aa  365  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0768479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2050  putative tricarboxylic transporter, TctA (12TM)subunit  45.2 
 
 		 515 aa  365  1e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0238317  normal  0.472976 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2190  integral membrane protein  40.77 
 
 		 508 aa  362  6e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1827  hypothetical protein  40.96 
 
 		 500 aa  362  8e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0875  hypothetical protein  40.24 
 
 		 506 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.85337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1801  hypothetical protein  42.71 
 
 		 506 aa  360  4e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.292075  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>