30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0067 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0067  integral membrane protein  100 
 
 		 188 aa  350  7e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3703  hypothetical protein  53.85 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8067  hypothetical protein  41.67 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3247  integral membrane protein  39.29 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3236  integral membrane protein  38.69 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.687326  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3298  integral membrane protein  38.69 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.172548  normal  0.0280313 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3501  integral membrane protein  40.97 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.543403  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37820  hypothetical protein  38.92 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.156933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3005  integral membrane protein  36.02 
 
 		 172 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0295794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1394  integral membrane protein  36 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.070776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0595  putative integral membrane protein  36.11 
 
 		 167 aa  65.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00342772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2147  hypothetical protein  30.46 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1828  hypothetical protein  31.1 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.47902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0322  hypothetical protein  31.55 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.751848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0832  integral membrane protein  31.78 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000357641  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3441  hypothetical protein  32.89 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal  0.878549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3626  integral membrane protein  40.23 
 
 		 171 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6111  hypothetical protein  28.16 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0307  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.17 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5906  putative tricarboxylic transport membrane protein  32.88 
 
 		 160 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.896471  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4162  hypothetical protein  32.32 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0836389  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4256  putative tricarboxylic transport membrane protein  29.32 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.313811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3335  hypothetical protein  32.33 
 
 		 163 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.122468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00850  hypothetical protein  31.35 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00463032  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3103  hypothetical protein  32.94 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.531887  normal  0.721362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3314  putative tricarboxylic transport membrane protein  31.67 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.188099  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3635  hypothetical protein  27.82 
 
 		 163 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1352  membrane protein TctB, putative  30.95 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1454  putative tricarboxylic transport membrane protein  30.89 
 
 		 151 aa  42.7  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3550  hypothetical protein  29.63 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>