More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0065 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  100 
 
 
529 aa  1004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.633378  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  59 
 
 
527 aa  515  1e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8065  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  44.53 
 
 
583 aa  330  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8198  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.81 
 
 
538 aa  317  5e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5077  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.6 
 
 
558 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.669392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4414  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.46 
 
 
558 aa  292  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5600  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.38 
 
 
549 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0363476  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2258  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.51 
 
 
542 aa  283  8e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0498367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3869  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.43 
 
 
540 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0780654  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1396  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.96 
 
 
556 aa  275  2e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0792453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.6 
 
 
524 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4697  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.78 
 
 
527 aa  256  7e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.269439  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1041  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.94 
 
 
563 aa  256  8e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37840  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.4 
 
 
527 aa  255  1e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.183307 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3300  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.41 
 
 
539 aa  255  1e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.814205  hitchhiker  0.00983464 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3238  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.41 
 
 
539 aa  255  1e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.698752  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3249  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.41 
 
 
539 aa  254  2e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.710576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4399  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.19 
 
 
525 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262296  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3596  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.49 
 
 
519 aa  248  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4243  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.53 
 
 
525 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0209492  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4177  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  38.53 
 
 
525 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0530735  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25730  PAS domain S-box  37.32 
 
 
520 aa  246  8e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2898  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.36 
 
 
553 aa  239  6e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2789  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.98 
 
 
536 aa  239  9e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3003  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.87 
 
 
503 aa  237  4e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0343689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1162  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  39.72 
 
 
528 aa  235  1e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.308176  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0044  sensory histidine kinase DcuS  31.69 
 
 
542 aa  236  1e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0038  sensory histidine kinase DcuS  31.5 
 
 
542 aa  234  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3503  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.36 
 
 
546 aa  233  7e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.243231 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4311  sensory histidine kinase DcuS  30.64 
 
 
533 aa  233  9e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.12968e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1004  sensor histidine kinase  30.11 
 
 
529 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.68776e-61 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4699  sensory histidine kinase DcuS  30.87 
 
 
543 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1959  sensory histidine kinase DcuS  30.43 
 
 
533 aa  229  7e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516955 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0516  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  43.39 
 
 
551 aa  229  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.494756  normal  0.0577704 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4650  sensory histidine kinase DcuS  30.87 
 
 
543 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3991  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.81 
 
 
553 aa  228  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00164194  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4650  sensory histidine kinase DcuS  30.87 
 
 
543 aa  229  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.414572  normal  0.461897 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0472  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.08 
 
 
532 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.05 
 
 
543 aa  228  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.802881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0837  sensor histidine kinase  29.61 
 
 
529 aa  227  4e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0639  sensory histidine kinase DcuS  29.14 
 
 
534 aa  226  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0496  sensory histidine kinase DcuS  30.19 
 
 
528 aa  226  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0489  sensory histidine kinase DcuS  28.87 
 
 
534 aa  226  9e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4559  sensory histidine kinase DcuS  30.68 
 
 
543 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0595  sensor protein CitS  28.08 
 
 
533 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0614  sensory histidine kinase DcuS  29.14 
 
 
534 aa  225  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4567  sensory histidine kinase DcuS  30.68 
 
 
543 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1009  sensor histidine kinase  29.05 
 
 
529 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0965  sensor histidine kinase  30.04 
 
 
529 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3624  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  41.96 
 
 
534 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0487  sensory histidine kinase DcuS  29 
 
 
534 aa  224  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0632  sensory histidine kinase DcuS  28.68 
 
 
534 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0559  sensor histidine kinase  27.88 
 
 
536 aa  223  5e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0527  sensor histidine kinase  27.88 
 
 
536 aa  223  5e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0688  sensor histidine kinase  28.08 
 
 
534 aa  222  1e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0470  sensor histidine kinase  27.69 
 
 
536 aa  222  1e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.974367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0620  sensor histidine kinase  28.88 
 
 
536 aa  221  2e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0490  sensory histidine kinase DcuS  28.95 
 
 
534 aa  221  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1089  sensor histidine kinase  29.42 
 
 
529 aa  220  4e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0615  sensor histidine kinase  27.88 
 
 
534 aa  220  4e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0876  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.73 
 
 
537 aa  221  4e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0923  sensor histidine kinase  29.24 
 
 
529 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0869  sensor histidine kinase  29.24 
 
 
529 aa  220  5e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3910  sensory histidine kinase DcuS  29.03 
 
 
537 aa  220  5e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0576  sensory histidine kinase DcuS  28.3 
 
 
534 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4725  sensory histidine kinase DcuS  28.57 
 
 
534 aa  220  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.678206  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0545  sensory histidine kinase DcuS  28.3 
 
 
534 aa  220  6e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.847766  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0928  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.36 
 
 
537 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0938  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.36 
 
 
537 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.101589 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4744  sensor protein CitS  28.29 
 
 
533 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0904  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.36 
 
 
537 aa  218  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3096  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.36 
 
 
537 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4346  sensor histidine kinase  29.98 
 
 
529 aa  218  2e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.149156  hitchhiker  1.86115e-13 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3432  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.17 
 
 
537 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0811  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.8 
 
 
529 aa  217  4e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0470  sensor histidine kinase  27.88 
 
 
536 aa  217  5e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.398861  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2036  ATP-binding region ATPase domain protein  37.3 
 
 
536 aa  216  1e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4679  sensory histidine kinase DcuS  29.34 
 
 
543 aa  213  5e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4592  sensory histidine kinase DcuS  29.34 
 
 
543 aa  213  5e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4366  sensory histidine kinase DcuS  29.34 
 
 
543 aa  213  5e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.206477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3902  sensory histidine kinase DcuS  29.34 
 
 
543 aa  213  6e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5639  sensory histidine kinase DcuS  29.34 
 
 
543 aa  213  6e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3867  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.15 
 
 
543 aa  213  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4102  sensory histidine kinase DcuS  29.8 
 
 
537 aa  212  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1529  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  35.47 
 
 
569 aa  206  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.08522e-06 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1377  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.03 
 
 
525 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0515  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.33 
 
 
526 aa  205  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4645  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  29.27 
 
 
529 aa  203  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010254  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1350  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.18 
 
 
543 aa  201  2e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2441  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.3 
 
 
540 aa  198  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0700  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.33 
 
 
543 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2555  sensory histidine kinase DcuS  29.14 
 
 
538 aa  196  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1304  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.64 
 
 
591 aa  189  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0304206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02431  sensor kinase CitA  29.87 
 
 
541 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1347  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.35 
 
 
575 aa  185  2e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38026e-11 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0355  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  37.61 
 
 
544 aa  184  4e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.514706 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0834  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.54 
 
 
540 aa  182  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0952704  normal  0.0982471 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.17 
 
 
541 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.76458e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0511  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  40.88 
 
 
521 aa  181  3e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0671541  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1210  putative sensor kinase citA  29.4 
 
 
538 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000551679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>