More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0064 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0064  response regulator receiver and unknown domain protein  100 
 
 
238 aa  462  1e-129  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.803731  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3706  response regulator receiver and unknown domain protein  55.46 
 
 
226 aa  216  3e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8064  response regulator of citrate/malate metabolism  55.02 
 
 
224 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4415  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  48.29 
 
 
241 aa  190  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8199  response regulator receiver and unknown domain protein  47.62 
 
 
226 aa  185  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37850  response regulator of citrate/malate metabolism  47.62 
 
 
227 aa  185  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.277898 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1397  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  47.41 
 
 
228 aa  180  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362742  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0598  response regulator receiver and unknown domain protein  46.05 
 
 
223 aa  173  2e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00972259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1528  response regulator receiver and unknown domain protein  44.12 
 
 
237 aa  171  8e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.18963e-07 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25720  response regulator of citrate/malate metabolism  46.9 
 
 
231 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3868  putative response regulator ofcitrate/malate metabolism  46.49 
 
 
223 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.017891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3623  response regulator receiver and unknown domain protein  50.43 
 
 
232 aa  170  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.796239  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0508  response regulator receiver and unknown domain protein  46.49 
 
 
224 aa  168  5e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.957096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0517  two component transcriptional regulator, Fis family  47.16 
 
 
231 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.169907  normal  0.0442424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1528  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  43.4 
 
 
236 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0514  response regulator receiver and unknown domain protein  39.47 
 
 
227 aa  166  3e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5599  response regulator receiver and unknown domain protein  44.81 
 
 
243 aa  165  6e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0782544  normal  0.532525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3002  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.74 
 
 
221 aa  164  9e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0266393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3504  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.18 
 
 
221 aa  164  1e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0894605 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5078  response regulator receiver and unknown domain protein  48.4 
 
 
228 aa  164  1e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.763511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1040  response regulator receiver and unknown domain protein  44.87 
 
 
228 aa  164  2e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3301  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.02 
 
 
220 aa  162  5e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0147948 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3239  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  46.02 
 
 
220 aa  162  5e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3250  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  45.58 
 
 
220 aa  160  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.237703  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2259  response regulator receiver and unknown domain protein  47.37 
 
 
223 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00555688  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2968  response regulator receiver and unknown domain protein  45.18 
 
 
228 aa  157  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33413  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1163  response regulator receiver and unknown domain protein  40.27 
 
 
231 aa  155  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14110  response regulator of citrate/malate metabolism  45.68 
 
 
238 aa  154  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0325971  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1376  response regulator receiver and unknown domain protein  39.21 
 
 
226 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3357  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  47.19 
 
 
251 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1769  response regulator receiver and unknown domain-containing protein  47.37 
 
 
223 aa  149  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.870814  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3992  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.55 
 
 
231 aa  145  6e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  2.5564e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0512  two-component response regulator  33.04 
 
 
222 aa  145  7e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0501  two-component response regulator  33.04 
 
 
222 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0835  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  44.89 
 
 
233 aa  141  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.256612  normal  0.0817521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4644  response regulator receiver and unknown domain protein  34.33 
 
 
231 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2788  response regulator receiver and unknown domain protein  32.61 
 
 
230 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4400  Fis family transcriptional regulator  37.87 
 
 
233 aa  139  4e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.328489  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4244  Fis family transcriptional regulator  37.87 
 
 
233 aa  139  4e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0391426  normal  0.137126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4178  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.87 
 
 
233 aa  139  4e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0312835  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02430  response regulator  35.65 
 
 
228 aa  139  5e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3597  response regulator receiver and unknown domain protein  41.88 
 
 
228 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0615  response regulator  31.3 
 
 
235 aa  136  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0497  response regulator receiver  29.78 
 
 
235 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1209  response regulator  35.96 
 
 
228 aa  136  3e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000538312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0520  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.49 
 
 
272 aa  136  3e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1958  DNA-binding transcriptional activator DcuR  38.79 
 
 
237 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0209132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0491  response regulator receiver  30 
 
 
235 aa  135  7e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0490  response regulator  30.87 
 
 
235 aa  135  7e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00461557  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2899  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.09 
 
 
228 aa  135  8e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0546  response regulator  30.87 
 
 
235 aa  134  1e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000213708  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003320  transcriptional regulatory protein CitB  34.65 
 
 
228 aa  134  2e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0633  response regulator  30.43 
 
 
235 aa  134  2e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0640  response regulator  30.43 
 
 
235 aa  133  2e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0488  response regulator  30.43 
 
 
235 aa  134  2e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4724  response regulator  30.43 
 
 
235 aa  133  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240866  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0039  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.9 
 
 
240 aa  132  4e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3868  response regulator receiver and unknown domain protein  34.05 
 
 
239 aa  130  2e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03956  hypothetical protein  34.05 
 
 
239 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03995  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with DcuS  34.05 
 
 
239 aa  130  2e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5638  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.05 
 
 
239 aa  130  2e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4591  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.05 
 
 
239 aa  130  2e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4365  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.05 
 
 
239 aa  130  2e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.414132  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4678  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.05 
 
 
239 aa  130  2e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3903  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.05 
 
 
239 aa  130  2e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.71711  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1346  response regulator receiver and unknown domain protein  37.95 
 
 
220 aa  129  5e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.67941e-12 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4743  response regulator  32.46 
 
 
230 aa  128  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4310  response regulator receiver and unknown domain protein  31.76 
 
 
241 aa  128  9e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.53171e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0473  response regulator receiver  32.02 
 
 
230 aa  127  1e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3909  DNA-binding transcriptional activator DcuR  35.9 
 
 
240 aa  128  1e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0045  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.62 
 
 
240 aa  127  2e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0596  response regulator  32.02 
 
 
230 aa  127  2e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0471  response regulator  32.02 
 
 
230 aa  127  2e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1864  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  34.62 
 
 
230 aa  127  2e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.134891  normal  0.12527 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0616  response regulator  32.02 
 
 
230 aa  125  4e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0689  response regulator  32.46 
 
 
230 aa  126  4e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2556  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.63 
 
 
239 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.109677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4101  DNA-binding transcriptional activator DcuR  34.19 
 
 
240 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4558  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.77 
 
 
239 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2442  response regulator receiver and unknown domain protein  36.68 
 
 
227 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.77 
 
 
239 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4566  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.77 
 
 
239 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4649  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.77 
 
 
239 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.420528  normal  0.899721 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4698  DNA-binding transcriptional activator DcuR  33.77 
 
 
239 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0577  response regulator  30.14 
 
 
224 aa  121  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1239  response regulator receiver and unknown domain protein  31.44 
 
 
225 aa  121  9e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0291668  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4698  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.61 
 
 
229 aa  120  1e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.423451  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0621  DNA-binding response regulator  31.14 
 
 
230 aa  119  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2037  response regulator receiver  37.61 
 
 
237 aa  119  4e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1303  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.93 
 
 
220 aa  119  4e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0321774  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1452  response regulator receiver and unknown domain protein  32.75 
 
 
224 aa  117  1e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2186  HTH-type transcriptional regulator, two-component response regulator  33.77 
 
 
224 aa  117  2e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0317  transcriptional regulator CitB  31.14 
 
 
230 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1922  response regulator  29 
 
 
229 aa  114  1e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0812  response regulator receiver  29.52 
 
 
225 aa  114  2e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4345  response regulator  29.52 
 
 
225 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158783  hitchhiker  4.67704e-12 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1005  response regulator  29.52 
 
 
225 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.38637e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1090  response regulator  29.52 
 
 
225 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0354  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  38.26 
 
 
217 aa  109  4e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.435973 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  30.53 
 
 
226 aa  109  4e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>