More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0061 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0061  threonine dehydratase  100 
 
 
313 aa  601  1e-171  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.983835  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3496  threonine dehydratase  63.99 
 
 
310 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2783  threonine dehydratase  65.03 
 
 
302 aa  305  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3420  threonine dehydratase  66.99 
 
 
309 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4798  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  57.49 
 
 
336 aa  276  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2589  threonine dehydratase  57.24 
 
 
303 aa  261  9e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0492304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1610  threonine dehydratase  52.92 
 
 
318 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.346941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3768  threonine dehydratase  53.99 
 
 
313 aa  218  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2234  threonine dehydratase  46.91 
 
 
308 aa  214  1e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4030  threonine dehydratase  48.51 
 
 
320 aa  209  6e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2922  threonine dehydratase  49.03 
 
 
313 aa  207  2e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3011  threonine dehydratase  46.98 
 
 
317 aa  197  2e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.302173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0952  threonine dehydratase  46.96 
 
 
313 aa  195  7e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.322135 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  38.78 
 
 
405 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3336  threonine dehydratase  46.86 
 
 
314 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.175409  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1756  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  47.37 
 
 
310 aa  172  9e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.72893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1622  Threonine ammonia-lyase  47.33 
 
 
307 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00676892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  38.26 
 
 
509 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1741  threonine dehydratase  50 
 
 
310 aa  169  5e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0307895  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1970  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.68 
 
 
322 aa  166  3e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal  0.218028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  36.45 
 
 
403 aa  167  3e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  37.18 
 
 
403 aa  165  8e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0175  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  39.49 
 
 
320 aa  164  2e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.165744  normal  0.392847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  37.74 
 
 
403 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2738  threonine dehydratase  39.81 
 
 
317 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  36.59 
 
 
399 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  32.48 
 
 
403 aa  161  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.21864e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  37.1 
 
 
403 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  39.3 
 
 
403 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  39.24 
 
 
514 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  35.99 
 
 
403 aa  159  8e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  37.05 
 
 
522 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  33.87 
 
 
402 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  4.2395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3081  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.27 
 
 
320 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  33.76 
 
 
401 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  34.54 
 
 
418 aa  157  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0405  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  42.49 
 
 
315 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0956264  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  29.62 
 
 
402 aa  156  5e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  39.43 
 
 
415 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  39.69 
 
 
414 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  36.62 
 
 
401 aa  155  9e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  36.62 
 
 
401 aa  155  9e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4405  hypothetical protein  36.93 
 
 
321 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.167206  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3678  threonine dehydratase  30.89 
 
 
437 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376781  normal  0.173616 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  36.33 
 
 
408 aa  155  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  28.8 
 
 
403 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  36.31 
 
 
402 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  37.73 
 
 
412 aa  154  3e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  29.11 
 
 
403 aa  153  3e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  46.47 
 
 
412 aa  154  3e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0748  hypothetical protein  36.59 
 
 
321 aa  152  6e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0137711  normal  0.534378 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  35.74 
 
 
400 aa  152  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  33.75 
 
 
403 aa  152  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  36.33 
 
 
537 aa  152  9e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  36.1 
 
 
507 aa  151  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  29.94 
 
 
403 aa  152  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  28.48 
 
 
403 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0687  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein subunit beta  36.86 
 
 
304 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  39.1 
 
 
415 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2353  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  37.5 
 
 
304 aa  151  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  28.16 
 
 
403 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1852  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.81 
 
 
307 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  37.22 
 
 
402 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0056  threonine dehydratase  37.46 
 
 
344 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.595  hitchhiker  0.00751641 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  34.19 
 
 
402 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  34.55 
 
 
395 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3492  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.69 
 
 
338 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.510498 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4417  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.59 
 
 
323 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.936913  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  29.43 
 
 
402 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  7.1198e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  35.28 
 
 
402 aa  149  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0008  hypothetical protein  35.84 
 
 
320 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2084  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.81 
 
 
332 aa  148  1e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.432383  normal  0.0544348 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  33.97 
 
 
402 aa  148  1e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  35.67 
 
 
400 aa  148  1e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3798  hypothetical protein  35.84 
 
 
320 aa  148  1e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1147  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  43.28 
 
 
332 aa  147  2e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0356763  normal  0.422182 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1068  threonine dehydratase  34.54 
 
 
509 aa  147  2e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08511  threonine dehydratase  34.42 
 
 
514 aa  147  2e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.306662  hitchhiker  0.00240564 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  43.81 
 
 
409 aa  147  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4146  hypothetical protein  35.49 
 
 
320 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  37.38 
 
 
416 aa  146  4e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0733  threonine dehydratase  33.81 
 
 
515 aa  146  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.880513  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  31.65 
 
 
400 aa  145  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  35.99 
 
 
403 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  38 
 
 
411 aa  145  7e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  31.46 
 
 
401 aa  145  8e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  41.19 
 
 
401 aa  145  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  37.46 
 
 
506 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3864  threonine dehydratase  36.79 
 
 
330 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4135  threonine dehydratase, biosynthetic  35.02 
 
 
501 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0273942  hitchhiker  3.59898e-09 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1558  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  38.49 
 
 
322 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.813791  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09911  threonine dehydratase  31.43 
 
 
513 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  37.09 
 
 
505 aa  144  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  40.13 
 
 
406 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09711  threonine dehydratase  32.25 
 
 
511 aa  143  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.139009  normal  0.177122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3899  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  39.56 
 
 
310 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.492177  normal  0.232429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  35.99 
 
 
406 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6145  threonine dehydratase  38.51 
 
 
323 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4294  threonine dehydratase  36.65 
 
 
425 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1638  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.83 
 
 
322 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>