43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0039 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  100 
 
 		 306 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  58.13 
 
 		 664 aa  208  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  52.8 
 
 		 654 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  52.48 
 
 		 407 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  41.2 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  51.2 
 
 		 475 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  49.28 
 
 		 695 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  59.38 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.4 
 
 		 846 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  43.55 
 
 		 396 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  44.44 
 
 		 928 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.16 
 
 		 892 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  42.72 
 
 		 595 aa  148  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  43.4 
 
 		 967 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  44.29 
 
 		 546 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  41.87 
 
 		 780 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  37.64 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  40.74 
 
 		 617 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  37.55 
 
 		 1040 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  38.21 
 
 		 867 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  38.01 
 
 		 879 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  50.91 
 
 		 300 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  44.7 
 
 		 205 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  31.9 
 
 		 708 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  46.6 
 
 		 186 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  42.15 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 		 496 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  37.34 
 
 		 344 aa  79.7  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  29.57 
 
 		 686 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  43.22 
 
 		 370 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  31.9 
 
 		 699 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  40 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  36.05 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  27.78 
 
 		 705 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  27.78 
 
 		 706 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  40 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  40 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  27.78 
 
 		 754 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  40 
 
 		 537 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  38.18 
 
 		 539 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  42.17 
 
 		 541 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  44.64 
 
 		 221 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  44.64 
 
 		 221 aa  42.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>