43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0039 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0039  LGFP repeat protein  100 
 
 
306 aa  616  1e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  58.13 
 
 
664 aa  208  7e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3877  LGFP repeat protein  52.8 
 
 
654 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.200487  normal  0.0193324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3878  LGFP repeat protein  52.48 
 
 
407 aa  195  6e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0449633 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  41.2 
 
 
351 aa  191  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0967  SCP-like extracellular  51.2 
 
 
475 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0383584 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4447  LGFP repeat protein  49.28 
 
 
695 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1965  LGFP repeat protein  59.38 
 
 
316 aa  185  1e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.4 
 
 
846 aa  183  4e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.889959 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3028  LGFP repeat protein  43.55 
 
 
396 aa  172  6e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4329  LGFP repeat protein  44.44 
 
 
928 aa  162  8e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36860  glucose/sorbosone dehydrogenase  45.16 
 
 
892 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.095894  normal  0.0512972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1717  LGFP repeat-containing protein  42.72 
 
 
595 aa  148  9e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.2949 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4327  LGFP repeat protein  43.4 
 
 
967 aa  147  2e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.343026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0168  putative esterase  44.29 
 
 
546 aa  143  3e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4038  LGFP repeat protein  41.87 
 
 
780 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.046638 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2701  LGFP repeat protein  37.64 
 
 
322 aa  142  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4368  LGFP repeat protein  37.55 
 
 
1040 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4171  LGFP repeat protein  40.74 
 
 
617 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2380  LGFP repeat protein  38.21 
 
 
867 aa  117  2e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.729285  normal  0.0240945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2379  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family 2  38.01 
 
 
879 aa  98.6  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2298  hypothetical protein  50.91 
 
 
300 aa  96.3  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.181107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1016  LGFP repeat protein  44.7 
 
 
205 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3957  LGFP repeat-containing protein  31.9 
 
 
708 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420458  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2269  LGFP repeat protein  46.6 
 
 
186 aa  87.4  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6068  glycoside hydrolase family protein  42.15 
 
 
399 aa  82  1e-14  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.646816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0562  glycoside hydrolase family protein  37.59 
 
 
496 aa  80.1  4e-14  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2503  LGFP repeat-containing protein  37.34 
 
 
344 aa  79.7  6e-14  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272639  normal  0.0821052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2440  LGFP repeat-containing protein  29.57 
 
 
686 aa  78.2  2e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199605  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4477  LGFP repeat-containing protein  43.22 
 
 
370 aa  75.1  2e-12  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12735  hypothetical protein  31.9 
 
 
699 aa  72.8  7e-12  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.724333 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13845  hypothetical protein  40 
 
 
539 aa  71.6  1e-11  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.280356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2565  LGFP repeat protein  36.05 
 
 
312 aa  71.6  2e-11  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.387749  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2213  LGFP repeat-containing protein  27.78 
 
 
705 aa  70.5  3e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0467397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2156  LGFP repeat-containing protein  27.78 
 
 
706 aa  70.9  3e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00337154 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5110  LGFP repeat-containing protein  40 
 
 
537 aa  70.5  4e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.667896 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5403  LGFP repeat-containing protein  40 
 
 
537 aa  70.5  4e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.116536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5022  LGFP  40 
 
 
537 aa  70.5  4e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2167  LGFP  27.78 
 
 
754 aa  70.5  4e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5652  LGFP repeat-containing protein  38.18 
 
 
539 aa  68.2  2e-10  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.786051  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1157  LGFP repeat-containing protein  42.17 
 
 
541 aa  63.2  5e-09  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0583206  normal  0.0991304 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  44.64 
 
 
221 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  44.64 
 
 
221 aa  42.7  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>