22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0034 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0034  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  718    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.922588  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24340  hypothetical protein  39.11 
 
 
398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.49719  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2292  hypothetical protein  37.87 
 
 
374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594734  normal  0.0250211 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1397  hypothetical protein  39.16 
 
 
400 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2140  hypothetical protein  37.33 
 
 
374 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1124  hypothetical protein  34.64 
 
 
418 aa  172  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3418  hypothetical protein  36.14 
 
 
377 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22370  hypothetical protein  34.47 
 
 
368 aa  155  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.439522  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4176  hypothetical protein  34.22 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.777473  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0160  hypothetical protein  36.61 
 
 
361 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01810  hypothetical protein  31.83 
 
 
366 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3407  hypothetical protein  32.05 
 
 
368 aa  137  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.741833  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2566  hypothetical protein  33.69 
 
 
356 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.581205  normal  0.605973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2775  hypothetical protein  32.28 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.365016  normal  0.921974 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2789  hypothetical protein  32.28 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3090  hypothetical protein  30.75 
 
 
367 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.241646  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2745  hypothetical protein  32.28 
 
 
366 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1404  hypothetical protein  30.26 
 
 
368 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12648  hypothetical protein  28.46 
 
 
374 aa  107  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5401  hypothetical protein  32.66 
 
 
308 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.370495  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2128  hypothetical protein  25.91 
 
 
382 aa  76.6  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2945  hypothetical protein  29.38 
 
 
379 aa  74.3  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>