89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0015 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0015  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 		 484 aa  891    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0748813  normal  0.0202346 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6089  virulence factor MVIN family protein  32.76 
 
 		 554 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.53676  decreased coverage  0.00127568 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0565  integral membrane protein MviN  24.42 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  20.49 
 
 		 523 aa  76.3  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  25.06 
 
 		 512 aa  73.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  29.05 
 
 		 526 aa  72  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2355  integral membrane protein MviN  22.59 
 
 		 514 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  27.99 
 
 		 526 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0114  integral membrane protein MviN  26.03 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000331362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  22.19 
 
 		 515 aa  62.4  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  23.42 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1495  integral membrane protein MviN  23.35 
 
 		 497 aa  60.5  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0850  integral membrane protein MviN  26.34 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  27.19 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  28.73 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3026  putative transmembrane protein  28.77 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0122  uncharacterized membrane protein, putative virulence factor  23.16 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000511918  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2766  virulence factor MVIN-like  25.76 
 
 		 516 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  26.59 
 
 		 517 aa  57  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  28.51 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  28.51 
 
 		 517 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  24.88 
 
 		 521 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2384  integral membrane protein MviN  28.07 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1296  integral membrane protein MviN  27.14 
 
 		 538 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1480  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 		 535 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2557  MVIN_ECOLI homolog transmembrane protein  26.07 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0307884  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  27.08 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2123  integral membrane protein MviN  26.48 
 
 		 545 aa  53.9  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0227966  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  27.08 
 
 		 512 aa  53.9  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1575  integral membrane protein MviN  27.84 
 
 		 535 aa  53.5  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.337983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3000  hypothetical protein  32.95 
 
 		 469 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  25.75 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  27.38 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  22.01 
 
 		 506 aa  53.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 		 521 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2182  integral membrane protein MviN  27.9 
 
 		 573 aa  52.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.219689  normal  0.591704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2905  integral membrane protein MviN  24.94 
 
 		 534 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  25.71 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  26.71 
 
 		 528 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0670  integral membrane protein MviN  27.55 
 
 		 520 aa  52  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1455  integral membrane protein MviN  27.04 
 
 		 517 aa  51.6  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1077  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 		 533 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.61808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  25.12 
 
 		 521 aa  51.6  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  26.85 
 
 		 512 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0314  integral membrane protein MviN  30.68 
 
 		 562 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2426  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 521 aa  50.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1048  integral membrane protein MviN  26.28 
 
 		 533 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2999  integral membrane protein MviN  27.44 
 
 		 532 aa  50.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.31906  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  24.82 
 
 		 529 aa  50.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2468  integral membrane protein MviN  33.06 
 
 		 529 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2833  integral membrane protein MviN  24.7 
 
 		 530 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2427  integral membrane protein MviN  25.24 
 
 		 530 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.985407 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3604  integral membrane protein MviN  27.96 
 
 		 512 aa  48.5  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35620  hypothetical protein  32.84 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.721682  hitchhiker  0.000000722537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  24.42 
 
 		 522 aa  49.3  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  25.16 
 
 		 495 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  25.67 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1472  integral membrane protein MviN  25.35 
 
 		 517 aa  48.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5900  integral membrane protein MviN  27.92 
 
 		 509 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  24.26 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  24.65 
 
 		 528 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  24.77 
 
 		 531 aa  47.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  27.49 
 
 		 528 aa  47.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.64 
 
 		 522 aa  47  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  26.94 
 
 		 512 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  25.3 
 
 		 522 aa  47  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3828  integral membrane protein MviN  25.96 
 
 		 525 aa  47  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.831164  normal  0.0288471 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1168  integral membrane protein MviN  27.74 
 
 		 545 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  24.79 
 
 		 537 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02881  hypothetical protein  25.57 
 
 		 535 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.46375  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1684  integral membrane protein MviN  27.3 
 
 		 556 aa  46.6  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  19.38 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  24.43 
 
 		 511 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1172  virulence factor mviN protein  26.15 
 
 		 521 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2014  integral membrane protein MviN  29.6 
 
 		 525 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00478097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  28.37 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1273  integral membrane protein MviN  19.4 
 
 		 507 aa  44.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2048  integral membrane protein MviN  24.39 
 
 		 521 aa  44.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.767053  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  25.29 
 
 		 511 aa  44.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1483  integral membrane protein MviN  27.62 
 
 		 541 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.441389 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  24.35 
 
 		 513 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  24.34 
 
 		 511 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0216  integral membrane protein MviN  24.59 
 
 		 533 aa  44.3  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0372  integral membrane protein MviN  24.8 
 
 		 519 aa  43.9  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.23269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  24.12 
 
 		 511 aa  43.9  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  23.27 
 
 		 512 aa  43.5  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3004  integral membrane protein MviN  29.17 
 
 		 521 aa  43.5  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  23.35 
 
 		 530 aa  43.5  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>