More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0010 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0010  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 		 333 aa  647    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283039 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1291  ATPase central domain-containing protein  41.28 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262565  normal  0.0615786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4254  AAA ATPase central domain protein  43.03 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.656455  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  42.38 
 
 		 326 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  41.95 
 
 		 328 aa  231  9e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  43.49 
 
 		 336 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  40.18 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  40.31 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2857  ATPase central domain-containing protein  40.66 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  36.73 
 
 		 327 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0086  ATPase  36.87 
 
 		 335 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0386  AAA ATPase central domain protein  34.55 
 
 		 327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.156492 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  36.67 
 
 		 328 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  33.95 
 
 		 329 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3852  AAA ATPase central domain protein  34.91 
 
 		 335 aa  195  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  33.64 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2089  AAA ATPase  38.11 
 
 		 336 aa  193  4e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0961  ATPase central domain-containing protein  38.48 
 
 		 336 aa  191  1e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  34.44 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  34.44 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5489  AAA ATPase central domain protein  37.8 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3671  ATPase central domain-containing protein  36.11 
 
 		 330 aa  186  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3536  ATPase central domain-containing protein  34.76 
 
 		 336 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.22928 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1073  AAA ATPase central domain protein  33.54 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.984194  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  32.23 
 
 		 325 aa  161  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2254  ATPase of the AAA+ class  31.8 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  30.15 
 
 		 326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  26.57 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5901  AAA ATPase central domain protein  37.06 
 
 		 352 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4460  ATPase central domain-containing protein  31.73 
 
 		 320 aa  102  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  25.32 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3109  putative ATPase  30.51 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1467  AAA ATPase, central region  30.12 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1490  ATPase central domain-containing protein  30.12 
 
 		 332 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0097  ATPase central domain-containing protein  27.39 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2640  ATPase central domain-containing protein  27.56 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.288063  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  26.8 
 
 		 308 aa  96.7  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2522  ATPase central domain-containing protein  32.96 
 
 		 324 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0449  AAA ATPase, central region  29.3 
 
 		 335 aa  94  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5573  AAA ATPase, central region  34.86 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.292045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5976  ATPase central domain-containing protein  34.86 
 
 		 323 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3738  ATPase central domain-containing protein  31.79 
 
 		 387 aa  90.9  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3822  ATPase central domain-containing protein  29.17 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0247422 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2659  AAA ATPase central domain protein  29.81 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000788626  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0747  AAA ATPase central domain protein  27.6 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.425262  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2442  ATPase central domain-containing protein  31.52 
 
 		 388 aa  87.4  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  26.4 
 
 		 425 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5696  AAA ATPase, central region  29.32 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0529  cell division cycle protein 48-like protein  26.58 
 
 		 426 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1081  AAA ATPase, central region  25.56 
 
 		 360 aa  82.8  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  35.71 
 
 		 369 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00636  ATPase, AAA family  28.9 
 
 		 325 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.113631  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1955  AAA ATPase  26.34 
 
 		 430 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  26.46 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1971  ATPase central domain-containing protein  27.75 
 
 		 390 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.68669  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  29.82 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2326  ATPase central domain-containing protein  26.79 
 
 		 419 aa  76.6  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4836  Microtubule-severing ATPase  32.28 
 
 		 641 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7319  ATPase central domain-containing protein  27.78 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  0.136646 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16611  predicted protein  34.71 
 
 		 589 aa  75.1  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1247  cell division protein CDC48  28.51 
 
 		 732 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292363  normal  0.0692611 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3059  ATPase central domain-containing protein  22.61 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.96383  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  22.86 
 
 		 424 aa  74.3  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37796  predicted protein  29.23 
 
 		 636 aa  73.9  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2338  AAA ATPase, central region  27.56 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  28.51 
 
 		 620 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  28.05 
 
 		 787 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  27.4 
 
 		 493 aa  73.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2215  AAA ATPase central domain protein  25.12 
 
 		 451 aa  72.8  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0998186  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2583  AAA ATPase central domain protein  29.21 
 
 		 419 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.450798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  27.59 
 
 		 659 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  24.75 
 
 		 477 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1017  hypothetical protein  25.2 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  25.13 
 
 		 459 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  26.01 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  24.62 
 
 		 478 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1196  cell division protein FtsH  24.81 
 
 		 648 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30.73 
 
 		 666 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.302131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1842  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.78 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.78 
 
 		 640 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  29.43 
 
 		 639 aa  70.1  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  29.05 
 
 		 783 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  29.05 
 
 		 783 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2108  AAA ATPase central domain protein  26.34 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.347982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.21 
 
 		 655 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0908  cell division control protein 48  25.12 
 
 		 754 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.247323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1795  ATP-dependent M41 family peptidase  27.62 
 
 		 1301 aa  69.7  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  28.16 
 
 		 466 aa  69.3  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1168  FtsH-2 peptidase  30 
 
 		 605 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.747317  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44478  predicted protein  27.5 
 
 		 549 aa  69.3  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  29.61 
 
 		 793 aa  69.3  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1033  proteasome-activating nucleotidase  26.36 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2293  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30 
 
 		 615 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6418  AAA ATPase, central region  32.69 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.255051  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2234  FtsH-2 peptidase  29.93 
 
 		 645 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0163354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1438  FtsH peptidase  27.36 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.226378  normal  0.078862 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09061  cell division protein FtsH4  26.82 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0625866  hitchhiker  0.0000226946 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  30 
 
 		 605 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.365345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  24.52 
 
 		 239 aa  68.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3258  AAA ATPase central domain protein  32.39 
 
 		 412 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.69388  normal  0.0190721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>