More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2538 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2538  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  100 
 
 		 352 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.655107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1863  cysteine synthase  41.99 
 
 		 340 aa  229  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4292  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  45.37 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.713465  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11413  putative cysteine synthase  38.24 
 
 		 325 aa  214  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.63655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0366  cysteine synthase  44.34 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0500011 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3877  Cysteine synthase  41.61 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0417  cysteine synthase A protein  40.86 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0440499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1117  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, subunit beta  40.73 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000129584  normal  0.764642 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0107  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.88 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000822794  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0103  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  35.88 
 
 		 326 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000135752  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6948  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  40.33 
 
 		 333 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2960  pyridoxal-phosphate dependent enzyme family/ornithine cyclodeaminase family protein  38.98 
 
 		 707 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.76325  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0590  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  34.88 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2745  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit:ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.63 
 
 		 685 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.278132  normal  0.0380808 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1672  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  35.62 
 
 		 330 aa  170  3e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4156  cystathionine beta-synthase  33.22 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.884438 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3071  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  36.84 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1884  Cysteine synthase  35.27 
 
 		 333 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171295  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0908  cystathionine beta-synthase  38.17 
 
 		 469 aa  155  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4907  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.23 
 
 		 479 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4422  cystathionine beta-synthase  35.87 
 
 		 455 aa  151  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2600  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.24 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0422691  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0339  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  34.56 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.793635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0978  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  33.44 
 
 		 307 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2195  cysteine synthase A  38 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000876073 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0771  cysteine synthase A  32.26 
 
 		 312 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1990  pyridoxal-5'-phosphate-dependent enzyme, beta subunit  32.8 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4209  cystathionine beta-synthase  36.73 
 
 		 464 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1150  cysteine synthase A  32.88 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.197095  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4380  cystathionine beta-synthase  36.01 
 
 		 464 aa  146  5e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.558337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1048  cystathionine beta-synthase  36.5 
 
 		 455 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4149  cystathionine beta-synthase  36.01 
 
 		 464 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0798519  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2446  cysteine synthase  37.33 
 
 		 311 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00671922  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4224  cystathionine beta-synthase  36.01 
 
 		 464 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3085  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.23 
 
 		 307 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.520498  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4674  cystathionine beta-synthase  35.67 
 
 		 464 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202958 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2297  cysteine synthases  34.69 
 
 		 308 aa  144  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2475  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.45 
 
 		 307 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2043  cystathionine beta-synthase  35.16 
 
 		 464 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  0.388176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1617  cystathionine beta-synthase  35.49 
 
 		 464 aa  142  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1207  cysteine synthase  33.81 
 
 		 322 aa  142  8e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.243759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4506  O-acetylserine lyase  31.02 
 
 		 307 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0207318  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1718  cysteine synthase A  34.69 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000370956  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0234  cysteine synthase K/M/A  36.27 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0787  cystathionine beta-synthase  34.5 
 
 		 454 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.40993  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3152  cystathionine beta-synthase  35.26 
 
 		 460 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676366  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3718  cystathionine beta-synthase  31.95 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000446047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05220  cystathionine beta-synthase  32.26 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6424  cystathionine beta-synthase  34.98 
 
 		 463 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.510477  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4269  O-acetylserine lyase  30.69 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4106  cysteine synthase  30.69 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4453  O-acetylserine lyase  30.69 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4117  cysteine synthase  30.69 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8566  cystathionine beta-synthase  34.58 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4601  O-acetylserine lyase  30.69 
 
 		 307 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1082  cystathionine beta-synthase  34.95 
 
 		 454 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2830  cystathionine beta-synthase  33.54 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.908849  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4455  O-acetylserine lyase  30.69 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0203  cysteine synthase  33.02 
 
 		 372 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000292068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0744  O-acetylserine lyase  30.69 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03155  cystathionine beta-synthase  33.02 
 
 		 464 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.140599  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0700  cystathionine beta-synthase  36.08 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4492  O-acetylserine lyase  30.69 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.986798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0488  Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  32.06 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4220  pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit  30.69 
 
 		 307 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0499  cystathionine beta-synthase  31.94 
 
 		 457 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4743  cysteine synthase  34.92 
 
 		 305 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0964  cysteine synthase  33.78 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_953  cysteine synthase  33.45 
 
 		 320 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000343054  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26180  cysteine synthase  38.44 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3398  cysteine synthase A  33.56 
 
 		 307 aa  138  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0450  cysteine synthase  34.92 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.865285 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0939  cystathionine beta-synthase  33.12 
 
 		 462 aa  138  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24430  cysteine synthase  35.91 
 
 		 311 aa  137  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.653671  normal  0.574826 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0081  cysteine synthase A  31.29 
 
 		 301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.130263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1671  cysteine synthase A  35.12 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.422965  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1210  cysteine synthase  33.79 
 
 		 305 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.473529  normal  0.609276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0083  cystathionine beta-synthase  33.54 
 
 		 458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2671  cystathionine beta-synthase  34.76 
 
 		 468 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11095  cystathionine beta-synthase CBS  34.92 
 
 		 464 aa  135  9e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000328093  normal  0.348251 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0717  cysteine synthase A  31.29 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00067142  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0865  cysteine synthase  34.8 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0162  cysteine synthase  36.64 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1706  cysteine synthase  35.37 
 
 		 306 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000550718  normal  0.263535 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2103  cysteine synthase  32.76 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0401259  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1135  cysteine synthase A  33.22 
 
 		 320 aa  134  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0019697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0855  cystathionine beta-synthase  34.63 
 
 		 456 aa  134  3e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0877269 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3445  cysteine synthase A  32.53 
 
 		 305 aa  134  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31890  cystathionine beta-synthase  34.6 
 
 		 457 aa  133  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.499085  normal  0.354911 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1770  cystathionine beta-synthase  32.25 
 
 		 456 aa  133  3.9999999999999996e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00709311  hitchhiker  0.000202602 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1541  cysteine synthase A  33.44 
 
 		 330 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1560  cystathionine beta-synthase (acetylserine-dependent)  34.02 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.180171  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3248  cystathionine beta-synthase  30.97 
 
 		 479 aa  133  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0925  cystathionine beta-synthase  33.44 
 
 		 468 aa  133  5e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.731257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0912  cystathionine beta-synthase  34.07 
 
 		 456 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3280  cysteine synthase A  34.21 
 
 		 302 aa  133  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1045  cysteine synthases  32.77 
 
 		 306 aa  133  6e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.801481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3118  cystathionine beta-synthase  34.47 
 
 		 456 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000273151 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5286  cystathionine beta-synthase  31.02 
 
 		 459 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.153908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3859  cysteine synthase A  32.65 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000825635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>