144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2531 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2531  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  624  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1339  hypothetical protein  39.01 
 
 
262 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.334499  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0726  hypothetical protein  32.97 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0597  hypothetical protein  32.52 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2364  hypothetical protein  35.19 
 
 
299 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31410  hypothetical protein  35.29 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.372839  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3354  hypothetical protein  31.86 
 
 
374 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1897  hypothetical protein  36.19 
 
 
317 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221334  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0955  hypothetical protein  36.4 
 
 
307 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1976  hypothetical protein  32.63 
 
 
336 aa  101  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000667209 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4768  protein of unknown function DUF559  37.5 
 
 
259 aa  100  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.146214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2158  hypothetical protein  34.57 
 
 
321 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1355  hypothetical protein  34.39 
 
 
335 aa  99.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0634709  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1181  hypothetical protein  32.53 
 
 
267 aa  91.7  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.59676 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13588  hypothetical protein  33.82 
 
 
289 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0436638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0740  hypothetical protein  40.29 
 
 
337 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16880  hypothetical protein  33.22 
 
 
327 aa  90.5  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.38822  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0735  hypothetical protein  32.13 
 
 
305 aa  86.7  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4153  hypothetical protein  33.06 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4228  hypothetical protein  33.06 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.331823  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4502  hypothetical protein  32.83 
 
 
325 aa  84  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.414331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4384  hypothetical protein  32.66 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.88032  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3899  hypothetical protein  35.93 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1050  hypothetical protein  31.86 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4808  hypothetical protein  32.64 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5044  hypothetical protein  29.3 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2384  hypothetical protein  29.03 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4303  hypothetical protein  31.91 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.670084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4792  hypothetical protein  33.88 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.79958  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0638  hypothetical protein  28.57 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0651  hypothetical protein  28.57 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.617524  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0631  hypothetical protein  28.57 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0729308 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0608  hypothetical protein  27.35 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.876444  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0621  hypothetical protein  27.35 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.568124  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0599  hypothetical protein  27.35 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1289  hypothetical protein  29.41 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17962  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11511  hypothetical protein  30.54 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.494625 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20280  hypothetical protein  31.15 
 
 
330 aa  75.1  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0096  hypothetical protein  32.26 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1169  hypothetical protein  28.57 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0105  hypothetical protein  32.26 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1186  hypothetical protein  28.57 
 
 
320 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0991  hypothetical protein  31.54 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4094  hypothetical protein  32.86 
 
 
339 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.811217  normal  0.0134077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16560  hypothetical protein  32.33 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3623  hypothetical protein  31.36 
 
 
293 aa  72.4  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.510989  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0138  hypothetical protein  30.77 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0147  hypothetical protein  30.77 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.857188 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0128  hypothetical protein  30.77 
 
 
300 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4654  hypothetical protein  28.5 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.397587  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15480  hypothetical protein  31.65 
 
 
335 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.44382  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18420  hypothetical protein  28 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.056172  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3967  hypothetical protein  29.46 
 
 
329 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28800  hypothetical protein  30.67 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4353  hypothetical protein  28.78 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4439  hypothetical protein  28.78 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100384 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4733  hypothetical protein  28.78 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.545142  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13746  hypothetical protein  30.26 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00180958  normal  0.465684 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1165  hypothetical protein  28.62 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000066316 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20040  hypothetical protein  31.86 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29770  hypothetical protein  30.58 
 
 
275 aa  69.3  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.548604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0497  hypothetical protein  31.17 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1196  hypothetical protein  29.34 
 
 
320 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0446823 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3059  hypothetical protein  30.53 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.169206  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4275  hypothetical protein  28.7 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0774352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4629  hypothetical protein  30.94 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4361  hypothetical protein  28.7 
 
 
289 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0126978 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4717  hypothetical protein  30.94 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.247054  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11091  hypothetical protein  28.21 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0879835  normal  0.520247 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5011  hypothetical protein  30.49 
 
 
277 aa  67.4  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.938275  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5155  protein of unknown function DUF559  29.93 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1656  hypothetical protein  32.8 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02360  hypothetical protein  32.53 
 
 
310 aa  64.7  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.81063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1071  hypothetical protein  30.45 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05730  hypothetical protein  27.43 
 
 
297 aa  64.3  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0971  hypothetical protein  28 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0989  hypothetical protein  28 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0711273  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0999  hypothetical protein  28 
 
 
320 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0086  hypothetical protein  26.76 
 
 
278 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329246 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13550  hypothetical protein  28.96 
 
 
279 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000138397  hitchhiker  0.00000300083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2902  hypothetical protein  27.24 
 
 
319 aa  62.4  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.883902  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1630  hypothetical protein  26 
 
 
307 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3039  hypothetical protein  26.61 
 
 
289 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000250216  hitchhiker  0.00216931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1730  hypothetical protein  25.81 
 
 
288 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.432935  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5526  hypothetical protein  26.56 
 
 
298 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1942  hypothetical protein  29.41 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.116952 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5135  hypothetical protein  28.1 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3520  hypothetical protein  28.42 
 
 
314 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.051391  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3137  hypothetical protein  28.27 
 
 
347 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4824  hypothetical protein  27.02 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.319514 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12277  hypothetical protein  25.47 
 
 
295 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000026926  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3541  hypothetical protein  26.67 
 
 
347 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000177029  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1723  hypothetical protein  29.31 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0541732 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18620  hypothetical protein  28.19 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.178834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1560  hypothetical protein  27.88 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426763  normal  0.775986 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4812  hypothetical protein  24.77 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00673201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1335  hypothetical protein  27.24 
 
 
293 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.402305 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1237  hypothetical protein  32.44 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0539  hypothetical protein  27.06 
 
 
303 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2611  hypothetical protein  26.01 
 
 
319 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00285658 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>