More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2522 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2522  ribosomal protein L9  100 
 
 
150 aa  293  5e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.559663  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  67.81 
 
 
149 aa  197  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37780  LSU ribosomal protein L9P  64.38 
 
 
149 aa  188  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.236654  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3352  ribosomal protein L9  64 
 
 
151 aa  184  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.600621  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4336  50S ribosomal protein L9  56.55 
 
 
150 aa  164  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  54 
 
 
151 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  53.42 
 
 
149 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2130  50S ribosomal protein L9  55.86 
 
 
149 aa  155  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.929246  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26560  LSU ribosomal protein L9P  58.62 
 
 
148 aa  152  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199017 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  52.05 
 
 
148 aa  149  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31750  LSU ribosomal protein L9P  49.32 
 
 
157 aa  149  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  50 
 
 
148 aa  146  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  54.79 
 
 
150 aa  147  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4178  ribosomal protein L9  58.5 
 
 
151 aa  146  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  53.42 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  51.37 
 
 
148 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  50.68 
 
 
148 aa  142  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  52.74 
 
 
153 aa  141  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0311  ribosomal protein L9  50.67 
 
 
148 aa  141  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0979697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  52.08 
 
 
148 aa  140  5e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  51.68 
 
 
151 aa  138  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1216  50S ribosomal protein L9  49.33 
 
 
148 aa  137  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  49.32 
 
 
148 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  48.97 
 
 
148 aa  137  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  48.28 
 
 
148 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  51.03 
 
 
148 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 
148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4166  ribosomal protein L9  47.3 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7042  ribosomal protein L9  47.95 
 
 
151 aa  124  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0877  50S ribosomal protein L9  46.98 
 
 
151 aa  121  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4737  ribosomal protein L9  45.95 
 
 
150 aa  120  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  43.15 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6031  50S ribosomal protein L9  47.37 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.827335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5743  50S ribosomal protein L9  45.33 
 
 
152 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.245852 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5367  50S ribosomal protein L9  45.33 
 
 
152 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5456  50S ribosomal protein L9  45.33 
 
 
152 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.166119  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  40.43 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  39.16 
 
 
147 aa  111  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.62 
 
 
150 aa  111  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39420  LSU ribosomal protein L9P  40.67 
 
 
152 aa  110  5e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.567165 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  40.82 
 
 
159 aa  110  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5366  ribosomal protein L9  42.95 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  34.67 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  38.36 
 
 
149 aa  107  4.0000000000000004e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  39.16 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10055  50S ribosomal protein L9  41.18 
 
 
152 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95125e-19  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
153 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  38.78 
 
 
148 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  38.1 
 
 
151 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
168 aa  101  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2780  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  102  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000928974  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 
209 aa  100  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  38.36 
 
 
146 aa  100  7e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  41.09 
 
 
147 aa  100  7e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  38.51 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  40.82 
 
 
148 aa  99  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  40.54 
 
 
149 aa  99  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4790  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.131212  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4754  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0190714  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4812  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0162172  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  38.1 
 
 
150 aa  97.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  36.62 
 
 
193 aa  97.8  4e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4672  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00136692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  37.58 
 
 
147 aa  97.8  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4662  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0630658  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  33.57 
 
 
189 aa  97.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  40 
 
 
152 aa  97.1  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  33.57 
 
 
189 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  41.5 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
167 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1675  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
199 aa  96.3  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000107335  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0011  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
150 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.557694  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
171 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  36.3 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  38.78 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0023  ribosomal protein L9  38.89 
 
 
174 aa  95.5  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.725827  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  38.46 
 
 
199 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  39.6 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  34.44 
 
 
151 aa  94.7  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  31.47 
 
 
189 aa  95.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
149 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 
165 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  38.52 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.800649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>