150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2486 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 462 aa  903    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  40.75 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  38.9 
 
 		 499 aa  233  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  38.33 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  39.78 
 
 		 479 aa  229  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  39.32 
 
 		 491 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4011  protoporphyrinogen oxidase  44.84 
 
 		 504 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  36.42 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  33.77 
 
 		 487 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 		 492 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  30.99 
 
 		 488 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 470 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  31.77 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  28.89 
 
 		 479 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  30.11 
 
 		 482 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  32.3 
 
 		 482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  30.48 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  26.39 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  29.02 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  25.81 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  22.77 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  22.77 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  26.52 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  25.31 
 
 		 473 aa  104  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 		 460 aa  103  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  29.4 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  29.53 
 
 		 463 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  22.92 
 
 		 473 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  24.84 
 
 		 479 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  21.49 
 
 		 482 aa  98.6  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  29.8 
 
 		 421 aa  98.2  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  29.83 
 
 		 453 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  29.17 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  22.43 
 
 		 473 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  29.27 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  28.25 
 
 		 473 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  26.06 
 
 		 509 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 		 452 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  21.41 
 
 		 473 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  21.41 
 
 		 473 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  21.41 
 
 		 473 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  21.83 
 
 		 473 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  28.45 
 
 		 473 aa  90.9  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  21.36 
 
 		 463 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  21.56 
 
 		 473 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  21.77 
 
 		 473 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  29.86 
 
 		 488 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  21.28 
 
 		 473 aa  89  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  21.77 
 
 		 466 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  21.07 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  21.24 
 
 		 466 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  28.7 
 
 		 475 aa  87.4  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 		 454 aa  86.7  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  21.56 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  23.67 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  25.87 
 
 		 470 aa  85.9  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  21 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  21.31 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  28.85 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.8 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  21.36 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  21.36 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  21.15 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  19.35 
 
 		 441 aa  83.6  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  25.87 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  22.8 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  28.33 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  26.34 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  23.92 
 
 		 491 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  20.88 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  20.41 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  29.22 
 
 		 469 aa  75.1  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.77 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  25.18 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 		 447 aa  72  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  24.09 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  22.36 
 
 		 495 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  25.36 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  25 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  25.8 
 
 		 482 aa  60.8  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  22.94 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  28.72 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  24.38 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  43.48 
 
 		 324 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  20.61 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  27.07 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  25.48 
 
 		 446 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  25.48 
 
 		 446 aa  54.3  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  21.24 
 
 		 467 aa  53.5  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0728  FAD dependent oxidoreductase  23.73 
 
 		 570 aa  52.8  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0404381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  24.23 
 
 		 469 aa  52.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  25.44 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  34.67 
 
 		 647 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2774  amine oxidase  22.59 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.858792  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  25.28 
 
 		 463 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  38.89 
 
 		 320 aa  50.1  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>