268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2450 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2450  protein of unknown function DUF58  100 
 
 		 298 aa  591  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.675441  decreased coverage  0.00731515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35710  hypothetical protein  56.61 
 
 		 299 aa  332  4e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3958  protein of unknown function DUF58  51.71 
 
 		 308 aa  287  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.4032 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3076  protein of unknown function DUF58  49.79 
 
 		 321 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0154289  decreased coverage  0.0000000391545 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19010  hypothetical protein  38.87 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.359114  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2373  hypothetical protein  41.71 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2130  protein of unknown function DUF58  36.64 
 
 		 297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000676568 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5164  hypothetical protein  35.71 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5253  hypothetical protein  35.71 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5545  hypothetical protein  35.71 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0040  hypothetical protein  34.55 
 
 		 286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.659881  normal  0.473933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0878  hypothetical protein  30.37 
 
 		 286 aa  107  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.627027  normal  0.715968 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0218  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000041699  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2205  hypothetical protein  26.49 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129755  normal  0.0892574 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000308  DUF58 domain-containing protein  27.88 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2321  protein of unknown function DUF58  29.81 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.768334  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4477  hypothetical protein  31.55 
 
 		 353 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3494  hypothetical protein  28.17 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0713  hypothetical protein  29.36 
 
 		 313 aa  93.2  5e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.689852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1809  protein of unknown function DUF58  33 
 
 		 294 aa  92.4  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2441  protein of unknown function DUF58  28.47 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1780  protein of unknown function DUF58  31.25 
 
 		 296 aa  89.4  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.226086 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4903  hypothetical protein  30.56 
 
 		 295 aa  89  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0112  von Willebrand factor, type A  26.46 
 
 		 309 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0547  protein of unknown function DUF58  29.9 
 
 		 310 aa  86.7  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1807  protein of unknown function DUF58  29.63 
 
 		 295 aa  86.3  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.451702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1690  hypothetical protein  27.46 
 
 		 299 aa  85.1  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2294  protein of unknown function DUF58  28.5 
 
 		 297 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.675434  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0602  hypothetical protein  30.73 
 
 		 295 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.462717  normal  0.0608138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2299  hypothetical protein  31.31 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0560687  hitchhiker  0.00265878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0223  protein of unknown function DUF58  27.01 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0556027  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1242  protein of unknown function DUF58  32.54 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2088  protein of unknown function DUF58  26.41 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3057  hypothetical protein  29.65 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4334  hypothetical protein  31.28 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0520  hypothetical protein  31.29 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0868  von Willebrand factor type A  23.48 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.721273  hitchhiker  0.00379424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  35.03 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2343  von Willebrand factor type A  25.7 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4773  hypothetical protein  25.93 
 
 		 304 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2653  hypothetical protein  25.52 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4278  hypothetical protein  24.9 
 
 		 303 aa  78.2  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3750  protein of unknown function DUF58  33.84 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.237776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3209  hypothetical protein  31.79 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154962 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1836  hypothetical protein  31.37 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.255887  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1580  hypothetical protein  25.26 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4026  hypothetical protein  32.79 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0725636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1563  hypothetical protein  30.1 
 
 		 314 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1591  hypothetical protein  30.26 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0395753  hitchhiker  0.000012927 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02160  hypothetical protein  22.46 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3848  protein of unknown function DUF58  32.93 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2031  hypothetical protein  30.1 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.439807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1248  hypothetical protein  25.82 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3760  hypothetical protein  30.54 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.227641  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0036  protein of unknown function DUF58  30.92 
 
 		 444 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.764731  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38380  hypothetical protein  33.15 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1642  hypothetical protein  24.66 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3711  hypothetical protein  30.1 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13724  hypothetical protein  34.47 
 
 		 454 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1336  hypothetical protein  34.13 
 
 		 440 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.429273 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3911  hypothetical protein  34.38 
 
 		 430 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0824882  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2501  hypothetical protein  33.33 
 
 		 433 aa  75.9  0.0000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2454  hypothetical protein  28.11 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.842306  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1720  hypothetical protein  32.14 
 
 		 314 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0850  hypothetical protein  31 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0826312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0414  hypothetical protein  32.29 
 
 		 458 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1802  protein of unknown function DUF58  28.71 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2508  hypothetical protein  30.58 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2120  hypothetical protein  30.58 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.526996  normal  0.0698278 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1062  hypothetical protein  31.16 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0716  hypothetical protein  22.12 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4444  hypothetical protein  30.65 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0725807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1844  hypothetical protein  28.57 
 
 		 436 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2519  protein of unknown function DUF58  33.33 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.938144  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0175  hypothetical protein  25.38 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2930  hypothetical protein  29.38 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2087  protein of unknown function DUF58  30.29 
 
 		 350 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56170  hypothetical protein  32.45 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5502  hypothetical protein  29.11 
 
 		 338 aa  73.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.1137  normal  0.0744833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3036  protein of unknown function DUF58  25.91 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.200505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22370  hypothetical protein  28.08 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0420947  normal  0.470335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0432  hypothetical protein  21.58 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4904  hypothetical protein  30.31 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.259886  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4892  hypothetical protein  32.45 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.645052  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04945  hypothetical protein  20.87 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24420  hypothetical protein  28.62 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3246  hypothetical protein  30.2 
 
 		 328 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3844  hypothetical protein  22.91 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182191  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0565  hypothetical protein  25.56 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1315  hypothetical protein  25.33 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.629782  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5847  hypothetical protein  38.25 
 
 		 432 aa  72.4  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.426804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09290  hypothetical protein  31.22 
 
 		 430 aa  72.4  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11509  hypothetical protein  29.3 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.169529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1407  hypothetical protein  31.34 
 
 		 455 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707739  decreased coverage  0.00764846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3388  hypothetical protein  25.94 
 
 		 331 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.413537 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1687  protein of unknown function DUF58  25.77 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6105  hypothetical protein  25.59 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.907552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0758  hypothetical protein  36.81 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.877651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3558  hypothetical protein  25.56 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711455 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1104  hypothetical protein  31.63 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>