157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2238 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  78.64 
 
 
206 aa  343  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  73.79 
 
 
206 aa  304  6e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  66.5 
 
 
206 aa  289  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  62.86 
 
 
210 aa  275  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  57.28 
 
 
205 aa  246  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  57.14 
 
 
210 aa  244  6e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  55.83 
 
 
205 aa  240  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4258  hypothetical protein  54.85 
 
 
205 aa  237  6.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  55.34 
 
 
206 aa  236  1e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  55.34 
 
 
205 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  54.37 
 
 
205 aa  235  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  53.88 
 
 
205 aa  228  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  51.94 
 
 
205 aa  221  4e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  44.98 
 
 
282 aa  192  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  44.5 
 
 
208 aa  190  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  44.29 
 
 
209 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  41.18 
 
 
204 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  39.22 
 
 
205 aa  150  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  39.6 
 
 
208 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  36.27 
 
 
205 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  34.48 
 
 
205 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000131524  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  38.73 
 
 
206 aa  141  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  35.96 
 
 
205 aa  141  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  35.78 
 
 
205 aa  141  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  35.96 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  36.54 
 
 
209 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0368  putative Pit accessory protein  32.2 
 
 
206 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  36.06 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  37.44 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0207  putative Pit accessory protein  30.1 
 
 
230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  32.2 
 
 
209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  34.47 
 
 
208 aa  115  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  30.1 
 
 
214 aa  112  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  33.99 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  31.13 
 
 
215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  35.71 
 
 
212 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  33.82 
 
 
211 aa  111  9e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  31.6 
 
 
215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  36.69 
 
 
204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  35.27 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  33.17 
 
 
211 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000497448  hitchhiker  0.00000000694622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  33.01 
 
 
208 aa  108  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  33.01 
 
 
208 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  30.19 
 
 
215 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  30.19 
 
 
215 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  29.58 
 
 
212 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000112514  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  33.98 
 
 
208 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  30.66 
 
 
215 aa  107  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  32.52 
 
 
208 aa  106  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  33.17 
 
 
211 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  29.25 
 
 
215 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3016  hypothetical protein  31.28 
 
 
215 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.25831  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  33.5 
 
 
209 aa  107  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  33.17 
 
 
211 aa  106  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  29.74 
 
 
206 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  0.0000000000851308 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  31.58 
 
 
208 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  29.74 
 
 
206 aa  105  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000152766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  33.5 
 
 
208 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  32.04 
 
 
208 aa  105  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  30.19 
 
 
214 aa  105  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  29.23 
 
 
206 aa  105  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0716  hypothetical protein  31.28 
 
 
214 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.68785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  29.23 
 
 
206 aa  104  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000193859  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  29.23 
 
 
206 aa  104  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000652491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  29.23 
 
 
206 aa  104  9e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502331  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1415  hypothetical protein  28.5 
 
 
214 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  31.58 
 
 
209 aa  103  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  27.4 
 
 
210 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  30.1 
 
 
206 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000750489  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  28.72 
 
 
206 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000180581  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  28.72 
 
 
206 aa  102  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  28.72 
 
 
206 aa  102  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  32.37 
 
 
207 aa  102  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  28.72 
 
 
206 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000312847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  29.72 
 
 
215 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  27.8 
 
 
209 aa  102  4e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  32.87 
 
 
209 aa  101  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1677  hypothetical protein  27.8 
 
 
218 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3606  hypothetical protein  31.55 
 
 
390 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113159 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  31.07 
 
 
208 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  26.92 
 
 
210 aa  99.8  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  29.95 
 
 
208 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000548446  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8017  protein of unknown function DUF47  30.1 
 
 
214 aa  99  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.938753  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  30.58 
 
 
208 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0677  hypothetical protein  29.38 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  30.58 
 
 
208 aa  99  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  27.45 
 
 
206 aa  99  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>