More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2196 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2196  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 349 aa  708    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32640  predicted dehydrogenase  62.54 
 
 		 358 aa  399  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0243292  normal  0.909317 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0574  oxidoreductase domain protein  56.33 
 
 		 334 aa  371  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.884725  hitchhiker  0.000686075 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0658  oxidoreductase domain protein  51.14 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.725124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0352  oxidoreductase domain protein  54.3 
 
 		 352 aa  332  7.000000000000001e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.688596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32630  predicted dehydrogenase  52.19 
 
 		 379 aa  301  7.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00591325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4438  oxidoreductase domain protein  46.31 
 
 		 354 aa  263  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.494898 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0246  oxidoreductase domain protein  45.23 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0369  oxidoreductase domain-containing protein  47.71 
 
 		 338 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0090  oxidoreductase domain protein  39.7 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50150  oxidoreductase family, NAD-binding Rossmann fold domain protein  39.37 
 
 		 345 aa  242  7.999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0569  oxidoreductase domain-containing protein  43.38 
 
 		 342 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5149  oxidoreductase domain-containing protein  39.58 
 
 		 329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.376342  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2822  oxidoreductase-like protein  39.22 
 
 		 328 aa  231  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.340246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3898  oxidoreductase domain-containing protein  40.85 
 
 		 329 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3215  oxidoreductase domain-containing protein  38.86 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0771835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0477  oxidoreductase domain protein  39.57 
 
 		 332 aa  222  7e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4310  oxidoreductase domain protein  40.9 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272092  hitchhiker  0.00106684 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1593  oxidoreductase domain-containing protein  39.63 
 
 		 332 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1099  oxidoreductase domain-containing protein  37.72 
 
 		 356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0834  oxidoreductase domain protein  39.27 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26160  predicted dehydrogenase  40.06 
 
 		 358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0688077  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5998  oxidoreductase domain protein  35.76 
 
 		 321 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3508  oxidoreductase domain-containing protein  37.27 
 
 		 354 aa  213  4.9999999999999996e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.739595 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2666  oxidoreductase domain-containing protein  36.73 
 
 		 327 aa  210  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.104428  hitchhiker  0.00352653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1175  oxidoreductase domain protein  37.43 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000136533 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1103  oxidoreductase domain-containing protein  37.89 
 
 		 323 aa  207  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05123  dimeric dihydrodiol dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07520)  34.4 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00036  conserved hypothetical protein  35.79 
 
 		 366 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.448897  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1672  putative oxidoreductase  38.37 
 
 		 333 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4427  oxidoreductase domain-containing protein  39.2 
 
 		 341 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4661  oxidoreductase domain-containing protein  33.91 
 
 		 352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.158835  normal  0.486703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0476  oxidoreductase domain protein  39.38 
 
 		 338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0789  oxidoreductase domain protein  37.96 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  33.03 
 
 		 327 aa  196  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3992  oxidoreductase domain-containing protein  35.91 
 
 		 336 aa  194  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1918  dehydrogenase  35.14 
 
 		 351 aa  188  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2095  oxidoreductase domain protein  38.77 
 
 		 338 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0327  oxidoreductase domain-containing protein  38.7 
 
 		 322 aa  188  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.36589  hitchhiker  0.000842403 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0817  oxidoreductase domain protein  33.53 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1298  oxidoreductase-like  33.52 
 
 		 349 aa  181  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.132661  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1475  oxidoreductase domain protein  32.3 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0697456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2141  oxidoreductase domain-containing protein  31.35 
 
 		 320 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.718247  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25422  predicted protein  31.49 
 
 		 374 aa  176  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6528  oxidoreductase domain protein  32.37 
 
 		 667 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.125495 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29330  oxidoreductase (Bacterial)  30.7 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6116  oxidoreductase domain protein  32.85 
 
 		 667 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.409557 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0454  oxidoreductase domain-containing protein  32.86 
 
 		 362 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04900  conserved hypothetical protein  34.07 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0984  oxidoreductase domain protein  33.43 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0788377  normal  0.0273723 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4102  oxidoreductase domain protein  33.73 
 
 		 329 aa  166  4e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00563248  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00010  conserved hypothetical protein  33.79 
 
 		 381 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00020  conserved hypothetical protein  32.79 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1125  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5310  oxidoreductase domain-containing protein  30.46 
 
 		 667 aa  156  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.400493 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3164  oxidoreductase domain protein  31.23 
 
 		 327 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1474  oxidoreductase domain protein  33.24 
 
 		 667 aa  153  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1455  oxidoreductase family protein  29.79 
 
 		 323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00550696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3633  oxidoreductase-like  28.61 
 
 		 359 aa  152  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04820  conserved hypothetical protein  32.99 
 
 		 394 aa  150  2e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1257  oxidoreductase, NAD-binding  29.48 
 
 		 324 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000523838  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1543  dehydrogenase related protein  31.12 
 
 		 331 aa  151  2e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3188  oxidoreductase domain-containing protein  40.31 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0099  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.62 
 
 		 349 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0048  dehydrogenase or related protein  30.56 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0110  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.62 
 
 		 349 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.128068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4235  oxidoreductase domain-containing protein  32.75 
 
 		 356 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3322  oxidoreductase domain protein  31.33 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19270  predicted oxidoreductase, aryl-alcohol dehydrogenase like protein  32.47 
 
 		 670 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.200754  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1891  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  30.95 
 
 		 327 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0368363  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4693  oxidoreductase  32.76 
 
 		 328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.454342  normal  0.794513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1809  oxidoreductase domain-containing protein  26.67 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598739  normal  0.127398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1276  hypothetical protein  30.74 
 
 		 342 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1517  oxidoreductase domain-containing protein  31.2 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0557  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 		 665 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2419  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1527  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1578  oxidoreductase-like protein  32.49 
 
 		 327 aa  126  5e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0063536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1071  oxidoreductase-like  31.94 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1551  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 		 328 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05344  NAD-dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0125  oxidoreductase domain protein  30 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2618  oxidoreductase domain protein  29.47 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1275  hypothetical protein  29.23 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0842  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.31 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0559  oxidoreductase domain-containing protein  27.27 
 
 		 331 aa  122  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1098  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.27 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.949991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1666  oxidoreductase domain-containing protein  32.94 
 
 		 334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0263052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0535  oxidoreductase domain protein  27.16 
 
 		 332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0497  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.27 
 
 		 331 aa  120  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0752  oxidoreductase domain protein  26.57 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.434934  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2511  oxidoreductase  29.85 
 
 		 348 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.352919 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1452  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0347  oxidoreductase domain protein  30.63 
 
 		 325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1473  oxidoreductase domain-containing protein  33.14 
 
 		 328 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4316  oxidoreductase domain-containing protein  26.36 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2075  Trans-1,2-dihydrobenzene-1,2-diol dehydrogenase  26.32 
 
 		 332 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0178  oxidoreductase domain protein  29.1 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1210  putative NADP or NAD utilising oxidoreductase  28.79 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1726  oxidoreductase domain protein  30.18 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>