More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2118 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  100 
 
 		 259 aa  524  1e-148  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  82.13 
 
 		 264 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  74.06 
 
 		 255 aa  337  8e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  69.17 
 
 		 288 aa  330  9e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  73.28 
 
 		 302 aa  330  2e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  68.02 
 
 		 312 aa  322  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  64.81 
 
 		 253 aa  317  1e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  63.87 
 
 		 256 aa  316  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  64.17 
 
 		 256 aa  315  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  63.37 
 
 		 247 aa  315  6e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  63.14 
 
 		 264 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  62.82 
 
 		 258 aa  312  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  64.26 
 
 		 455 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  61.67 
 
 		 277 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 262 aa  307  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  63.95 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  63.48 
 
 		 266 aa  305  4.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  60.08 
 
 		 255 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  62.07 
 
 		 261 aa  304  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  60.26 
 
 		 271 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  62.98 
 
 		 277 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  61.48 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  61 
 
 		 279 aa  301  9e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  64.73 
 
 		 445 aa  300  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  63.79 
 
 		 252 aa  300  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  62.34 
 
 		 255 aa  298  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  61.47 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  60.34 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  59.92 
 
 		 274 aa  295  5e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  63.6 
 
 		 244 aa  294  8e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  65.32 
 
 		 253 aa  294  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  61.54 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  59.32 
 
 		 258 aa  292  4e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  61.28 
 
 		 247 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  63.35 
 
 		 250 aa  290  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  59.49 
 
 		 263 aa  290  2e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  58.97 
 
 		 280 aa  288  5.0000000000000004e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  64.16 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  58.97 
 
 		 258 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  59.32 
 
 		 255 aa  279  3e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  57.08 
 
 		 243 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  60 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  59.05 
 
 		 277 aa  271  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  54.74 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 266 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  55.04 
 
 		 279 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  54.39 
 
 		 245 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 249 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.04 
 
 		 245 aa  261  6e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  56.5 
 
 		 252 aa  260  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  56.6 
 
 		 293 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  57.14 
 
 		 257 aa  254  8e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  53.81 
 
 		 255 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  56.42 
 
 		 243 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  53.42 
 
 		 256 aa  248  7e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  51.81 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  53.68 
 
 		 241 aa  241  7.999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  50.43 
 
 		 253 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  53.33 
 
 		 272 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  48.07 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.82 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 279 aa  231  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  54.17 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.48 
 
 		 266 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  48.62 
 
 		 227 aa  224  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2781  ABC transporter related  46.19 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  55.51 
 
 		 249 aa  223  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2724  ABC transporter related  46.19 
 
 		 252 aa  223  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  47.71 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  56.16 
 
 		 224 aa  222  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  47.71 
 
 		 225 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  44.16 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  48.02 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0118  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 256 aa  217  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0119  ABC transporter  43.2 
 
 		 256 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.393598  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  43.58 
 
 		 226 aa  218  1e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  48.21 
 
 		 259 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.05 
 
 		 230 aa  215  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  50.41 
 
 		 247 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  46.12 
 
 		 229 aa  214  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0021  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 252 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  44.39 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 231 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  43.18 
 
 		 230 aa  213  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  44.1 
 
 		 246 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1162  ABC transporter, ATP-binding protein  47.06 
 
 		 231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0787551  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2175  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 274 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  48.51 
 
 		 239 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0492  ABC transporter related  45.54 
 
 		 238 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.925941  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4805  ABC transporter related protein  51.24 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.318308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3264  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 229 aa  210  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0987  ABC transporter related  46.12 
 
 		 229 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.891984 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0892  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.84 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03360  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  47.53 
 
 		 255 aa  209  3e-53  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.922204 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.99 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1427  ABC transporter related  45.87 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4268  ABC transporter-related protein  46.88 
 
 		 238 aa  209  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  45.37 
 
 		 252 aa  208  6e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1792  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.153543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1079  ABC transporter related  48.18 
 
 		 276 aa  208  8e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>