More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2104 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4744  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.61 
 
 		 669 aa  726    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000616135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0702  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.55 
 
 		 684 aa  876    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.23 
 
 		 671 aa  724    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.066161 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2895  Mername-AA223 peptidase  57.45 
 
 		 682 aa  739    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.17 
 
 		 760 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0559  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.48 
 
 		 801 aa  642    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0616  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.36 
 
 		 662 aa  704    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0313  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.94 
 
 		 743 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2104  ATP-dependent metalloprotease FtsH  100 
 
 		 677 aa  1369    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.27 
 
 		 793 aa  644    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9175  Microtubule-severing ATPase  59.45 
 
 		 656 aa  744    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0314  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.76 
 
 		 687 aa  853    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12800  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.13 
 
 		 704 aa  771    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.113847  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4314  Mername-AA223 peptidase  63.28 
 
 		 753 aa  696    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.492417 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1848  ATP-dependent Zn protease  60.78 
 
 		 697 aa  733    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0298  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.58 
 
 		 753 aa  690    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01240  membrane protease FtsH catalytic subunit  65.47 
 
 		 696 aa  842    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8426  ATP-dependent metalloprotease FtsH  62.46 
 
 		 672 aa  786    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.38 
 
 		 685 aa  704    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.259213 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4770  Mername-AA223 peptidase  56.12 
 
 		 783 aa  656    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0538  ATP-dependent metalloprotease FtsH  67.09 
 
 		 659 aa  803    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0673684  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35650  membrane protease FtsH catalytic subunit  54.94 
 
 		 798 aa  711    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.399414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0835  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.77 
 
 		 671 aa  713    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0343776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2987  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.95 
 
 		 669 aa  911    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.832035  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5156  Mername-AA223 peptidase  56.43 
 
 		 784 aa  659    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24780  membrane protease FtsH catalytic subunit  62.43 
 
 		 698 aa  787    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0627  ATP-dependent metalloprotease FtsH  72.02 
 
 		 682 aa  890    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0250398  normal  0.798069 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32090  membrane protease FtsH catalytic subunit  77.97 
 
 		 684 aa  987    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0151  Mername-AA223 peptidase  68.86 
 
 		 689 aa  855    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3447  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.06 
 
 		 679 aa  719    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.311187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4505  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.54 
 
 		 672 aa  700    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1416  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.99 
 
 		 794 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0495193  normal  0.256654 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0204  Mername-AA223 peptidase  58.36 
 
 		 654 aa  704    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.176031  normal  0.159439 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1132  ATP-dependent metallopeptidase HflB  57.92 
 
 		 769 aa  714    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0444  Mername-AA223 peptidase  59.16 
 
 		 681 aa  746    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4856  Mername-AA223 peptidase  56.12 
 
 		 783 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5372  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.05 
 
 		 781 aa  667    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13642  cell division protein ftsH (membrane-bound protease)  55.85 
 
 		 760 aa  653    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1673  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.85 
 
 		 653 aa  610  1e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.720537  normal  0.0669803 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.99 
 
 		 615 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0860215  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.76 
 
 		 602 aa  593  1e-168  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.4 
 
 		 643 aa  591  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2185  FtsH-2 peptidase  56.78 
 
 		 627 aa  590  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2896  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.84 
 
 		 750 aa  585  1.0000000000000001e-165  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02180  membrane protease FtsH catalytic subunit  57.73 
 
 		 759 aa  581  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.203861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.84 
 
 		 639 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1806  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.3 
 
 		 651 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.266956  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.18 
 
 		 611 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000170708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.64 
 
 		 608 aa  570  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.73 
 
 		 657 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000285756  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  57.35 
 
 		 499 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0391  peptidase M41, FtsH  49.67 
 
 		 662 aa  566  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150338  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3355  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.2 
 
 		 647 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0224278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.82 
 
 		 604 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0159  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.85 
 
 		 614 aa  565  1.0000000000000001e-159  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.794037  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0463  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.3 
 
 		 662 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  57.89 
 
 		 614 aa  558  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.23 
 
 		 635 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000323168  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.5 
 
 		 676 aa  561  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  55.41 
 
 		 693 aa  560  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0533  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.58 
 
 		 697 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.37995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.41 
 
 		 620 aa  560  1e-158  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0546  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.58 
 
 		 697 aa  559  1e-158  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.44 
 
 		 632 aa  559  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0426  FtsH peptidase  55.65 
 
 		 652 aa  558  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.405966  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0150  cell division protein FtsH, putative  50 
 
 		 700 aa  558  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0063  cell division protein FtsH  58.39 
 
 		 633 aa  555  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  51.36 
 
 		 651 aa  558  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.91 
 
 		 650 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.87 
 
 		 637 aa  555  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0358  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.42 
 
 		 652 aa  558  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0780  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.16 
 
 		 643 aa  556  1e-157  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0715854 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02030  membrane protease FtsH catalytic subunit  56.62 
 
 		 783 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000829689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.33 
 
 		 639 aa  558  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0206  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.91 
 
 		 617 aa  557  1e-157  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5244  cell division protein FtsH  58.19 
 
 		 633 aa  553  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.293032 
 
 
-
 
NC_004310  BR1691  cell division protein FtsH  51.02 
 
 		 644 aa  553  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0064  cell division protein FtsH  58.39 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.651636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0060  cell division protein  58.39 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0060  cell division protein  58.39 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.527958  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.19 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0073  cell division protein FtsH  58.39 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.755624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1722  peptidase M41, FtsH  55.65 
 
 		 631 aa  553  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.139159 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1890  FtsH peptidase  57.31 
 
 		 608 aa  554  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000186964  hitchhiker  0.0000000000919555 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5308  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.42 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.496993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0064  cell division protein FtsH  58.39 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.550597  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0076  cell division protein FtsH  58.39 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0454651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0072  cell division protein FtsH  58.4 
 
 		 633 aa  554  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.12055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0095  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.83 
 
 		 599 aa  553  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.02 
 
 		 608 aa  553  1e-156  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  52.24 
 
 		 673 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1784  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.74 
 
 		 660 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0518301 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1736  ATP-dependent metalloprotease FtsH  49.05 
 
 		 630 aa  555  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.195499  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  47.96 
 
 		 642 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.18 
 
 		 610 aa  549  1e-155  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.64 
 
 		 626 aa  550  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1990  ATP-dependent metalloprotease FtsH  48.68 
 
 		 659 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.144891  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0868  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.15 
 
 		 607 aa  549  1e-155  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3506  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50.96 
 
 		 638 aa  551  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>