More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2072 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 431 aa  872    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  69.28 
 
 		 433 aa  623  1e-177  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  68.6 
 
 		 428 aa  604  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  68.15 
 
 		 434 aa  600  1e-170  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  56.36 
 
 		 436 aa  437  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  45.35 
 
 		 427 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  46.21 
 
 		 424 aa  361  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  47.58 
 
 		 429 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  45.34 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  42.27 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  41.36 
 
 		 435 aa  316  5e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  40 
 
 		 432 aa  298  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  40.38 
 
 		 443 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  37.19 
 
 		 495 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  37.31 
 
 		 427 aa  243  3e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  36.19 
 
 		 435 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  33.7 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  34.25 
 
 		 419 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  33 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  32.34 
 
 		 434 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 420 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  28.1 
 
 		 435 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  30.21 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 422 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  32.83 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  29.88 
 
 		 435 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  29.95 
 
 		 442 aa  117  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  27.66 
 
 		 424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 451 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  31.72 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  25.73 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 448 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.27 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.4 
 
 		 438 aa  103  4e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 		 441 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  27 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  31.95 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.75 
 
 		 435 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 427 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 444 aa  92.4  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 470 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  27.41 
 
 		 439 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.75 
 
 		 399 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  26.75 
 
 		 413 aa  90.1  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  22.03 
 
 		 424 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  25.51 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.84 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 412 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  25.26 
 
 		 423 aa  83.6  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  27.25 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  30.07 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  26.44 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2983  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2703  extracellular solute-binding protein family 1  28.27 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.830349  normal  0.531916 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  27.89 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  27.79 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6971  extracellular solute-binding protein family 1  25.47 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.487837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  22.58 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5441  extracellular solute-binding protein family 1  24.56 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2783  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 		 431 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  23.5 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.85 
 
 		 429 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3815  extracellular solute-binding protein  22.62 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.725217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3858  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000022263  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.68 
 
 		 428 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1218  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 444 aa  73.2  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3494  extracellular solute-binding protein  30.22 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2415  extracellular solute-binding protein family 1  25.63 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  23.08 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  27.54 
 
 		 419 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1243  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  28.06 
 
 		 417 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00790  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.17 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.312494  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  31.1 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6265  extracellular solute-binding protein family 1  26.29 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0059  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 439 aa  70.1  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16660  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.32 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.613471  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1306  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 445 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  25.52 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.88 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  26.2 
 
 		 429 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2652  extracellular solute-binding protein family 1  30.81 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.142803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  26.56 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1317  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 426 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.12099 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  28.65 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  24.39 
 
 		 427 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  29.9 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  21.89 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2590  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 464 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>