More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2019 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 
397 aa  785    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  69.02 
 
 
394 aa  526  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  58.94 
 
 
390 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  54.09 
 
 
398 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  53.51 
 
 
408 aa  385  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  44.66 
 
 
417 aa  342  8e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.81 
 
 
462 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  43.89 
 
 
440 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.17 
 
 
454 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  38.68 
 
 
463 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  38.34 
 
 
442 aa  276  3e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40 
 
 
415 aa  272  6e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  37.39 
 
 
475 aa  271  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  38.06 
 
 
441 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  36.74 
 
 
479 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.14 
 
 
431 aa  250  3e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.01 
 
 
426 aa  247  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  39.86 
 
 
409 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  37.35 
 
 
413 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  37.83 
 
 
399 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  35.2 
 
 
419 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  36.13 
 
 
419 aa  226  7e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1773  flagellar hook protein FlgE  35.17 
 
 
407 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  37.95 
 
 
401 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  37.12 
 
 
404 aa  216  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1570  flagellar hook protein FlgE  34.62 
 
 
407 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.370708  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1829  flagellar hook protein FlgE  35.25 
 
 
407 aa  216  8e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.162311  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  36.45 
 
 
405 aa  215  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  37.32 
 
 
401 aa  215  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1720  flagellar hook protein FlgE  34.38 
 
 
407 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  37.47 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  37.47 
 
 
401 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3626  flagellar hook protein FlgE  34.38 
 
 
407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 
403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 
403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.2 
 
 
413 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.19 
 
 
423 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  36.99 
 
 
402 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.96 
 
 
428 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 
404 aa  211  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1568  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
437 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.874042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1686  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
437 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  36.99 
 
 
402 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  36.99 
 
 
402 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  37.14 
 
 
402 aa  210  4e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.83 
 
 
428 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  35.83 
 
 
425 aa  209  6e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1541  flagellar hook protein FlgE  32.81 
 
 
437 aa  209  7e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  34.29 
 
 
407 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  34.29 
 
 
407 aa  207  3e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  34.13 
 
 
408 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  36.24 
 
 
413 aa  204  3e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  33.25 
 
 
407 aa  204  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  34.75 
 
 
408 aa  202  7e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1530  flagellar hook protein FlgE  32.35 
 
 
437 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1751  flagellar hook protein FlgE  32.35 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  34.81 
 
 
410 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  34.57 
 
 
417 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  36.93 
 
 
404 aa  199  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  36.47 
 
 
407 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  37.47 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  35.55 
 
 
413 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  35.93 
 
 
405 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
414 aa  196  6e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 
410 aa  196  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  34.95 
 
 
418 aa  196  7e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 
413 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
414 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 
414 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 
414 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  35.34 
 
 
402 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  35.53 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  35.53 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 
415 aa  193  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  32.12 
 
 
428 aa  193  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.9 
 
 
435 aa  193  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  32.12 
 
 
428 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  32.12 
 
 
428 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  34.28 
 
 
405 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  33.55 
 
 
442 aa  190  4e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.86 
 
 
401 aa  189  5.999999999999999e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  34.1 
 
 
420 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 
405 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1366  flagellar hook protein FlgE  32.07 
 
 
467 aa  189  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  35.94 
 
 
428 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 
402 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 
402 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  34.66 
 
 
414 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  33.56 
 
 
433 aa  188  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  33.17 
 
 
387 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  36.15 
 
 
413 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  36.15 
 
 
413 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  36.15 
 
 
413 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  36.15 
 
 
413 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  36.15 
 
 
413 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  36.15 
 
 
413 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>