295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2009 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2009  flagellar biosynthetic protein FliR  100 
 
 		 253 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31040  flagellar biosynthetic protein FliR  56.57 
 
 		 252 aa  278  5e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.567657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2974  flagellar biosynthetic protein FliR  50.6 
 
 		 252 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1668  flagellar biosynthetic protein FliR  43.64 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0291924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0741  flagellar biosynthetic protein FliR  38.31 
 
 		 253 aa  171  6.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2329  type III secretion system inner membrane R protein  41.34 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0502064  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0960  flagellar biosynthetic protein FliR  43.48 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0859  type III secretion system inner membrane R protein  34.68 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  32.87 
 
 		 260 aa  122  7e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  34.93 
 
 		 259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  35.32 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  27.13 
 
 		 265 aa  118  9e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  28.02 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1750  flagellar biosynthetic protein FliR  35.78 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  38.86 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  31.93 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0068  flagellar biosynthetic protein FliR  33.98 
 
 		 266 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.981811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  30.12 
 
 		 258 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  32.91 
 
 		 262 aa  106  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1317  flagellar biosynthetic protein FliR  32.54 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  30.96 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  25.83 
 
 		 260 aa  102  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  31.6 
 
 		 265 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1128  flagellar biosynthesis protein FliR  33.01 
 
 		 257 aa  102  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  33.65 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 		 256 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  27.56 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  31.75 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  30.3 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  30.3 
 
 		 262 aa  99.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  33.64 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0867  flagellar biosynthetic protein FliR  29.95 
 
 		 253 aa  99.4  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  32.41 
 
 		 261 aa  98.6  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  30.14 
 
 		 264 aa  97.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  32.23 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  33.02 
 
 		 256 aa  96.3  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  33.02 
 
 		 247 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  28.95 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  27.27 
 
 		 264 aa  95.5  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  29.11 
 
 		 261 aa  95.5  8e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  30.38 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1798  flagellar biosynthesis protein FliR  28.16 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  31.42 
 
 		 260 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.46 
 
 		 258 aa  92.8  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  30.38 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  29.28 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  30.53 
 
 		 256 aa  92  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  28.22 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  32.64 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1438  flagellar biosynthesis protein FliR  29.95 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1091  flagellar biosynthesis protein FliR  28.69 
 
 		 256 aa  90.1  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3473  flagellar biosynthetic protein FliR  29.13 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  26.16 
 
 		 260 aa  89.4  5e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 260 aa  89  6e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3432  flagellar biosynthetic protein FliR  29.22 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  30.6 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0704  flagellar biosynthetic protein FliR  28.39 
 
 		 259 aa  88.6  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0720093  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2697  flagellar biosynthetic protein FliR  27.49 
 
 		 255 aa  88.2  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.838221  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0241  flagellar biosynthetic protein FliR  29.24 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.306618  normal  0.0171126 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  30.77 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 		 260 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  25.81 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  30.17 
 
 		 260 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  29.91 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  27.47 
 
 		 261 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  34.26 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000412821  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  32.86 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000910874  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.55 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2260  type III secretion system inner membrane R protein  30.43 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  34.26 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000259397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  34.26 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  34.26 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000709328  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  34.26 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000114634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  32.86 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  30.43 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  29.44 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  31.02 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  33.03 
 
 		 261 aa  84.3  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000309979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  32.86 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  32.86 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000555568  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  30.4 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  32.86 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3749  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29.44 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.514144  normal  0.0208478 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4742  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.795706 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4220  type III secretion protein SpaR/YscT/HrcT  29 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0190073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0085  flagellar biosynthetic protein FliR  27.85 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.402163 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0624  flagellar biosynthetic protein FliR  27.97 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  26.94 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  27.4 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4424  flagellar biosynthetic protein FliR  30.08 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.926319 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001178  flagellar biosynthesis protein FliR  29.44 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.795861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  28.99 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  27.31 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>