More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1991 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 450 aa  905    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  70.07 
 
 		 452 aa  598  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  64.88 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  65.64 
 
 		 456 aa  568  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  63.59 
 
 		 426 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  59.38 
 
 		 432 aa  483  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  51.4 
 
 		 428 aa  422  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  52.36 
 
 		 446 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  51.08 
 
 		 457 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  53.67 
 
 		 413 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  50.87 
 
 		 446 aa  408  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  53.67 
 
 		 413 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  53.67 
 
 		 413 aa  411  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  49.22 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  53.32 
 
 		 402 aa  402  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  53.3 
 
 		 412 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  52.25 
 
 		 405 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  53.61 
 
 		 416 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  54.16 
 
 		 416 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  51.73 
 
 		 419 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  51.11 
 
 		 418 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  51.99 
 
 		 441 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  52.01 
 
 		 419 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  52.28 
 
 		 418 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  50.39 
 
 		 404 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  53.49 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  47.58 
 
 		 413 aa  359  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 420 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  49.25 
 
 		 461 aa  356  3.9999999999999996e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  46.46 
 
 		 414 aa  352  7e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  48.65 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  45.69 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  46.96 
 
 		 476 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  49.73 
 
 		 403 aa  333  5e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  51.32 
 
 		 452 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  41.96 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  50.54 
 
 		 442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  41 
 
 		 425 aa  316  6e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  46.9 
 
 		 429 aa  315  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  43.85 
 
 		 453 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  41.77 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  46.51 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 426 aa  299  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 450 aa  297  2e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  43.67 
 
 		 417 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  45.31 
 
 		 412 aa  289  8e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  42.82 
 
 		 431 aa  289  8e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  40.14 
 
 		 494 aa  283  5.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  41.41 
 
 		 441 aa  279  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  40.1 
 
 		 435 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  40.71 
 
 		 509 aa  269  8.999999999999999e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  44.02 
 
 		 491 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 431 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  39.15 
 
 		 429 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  42.08 
 
 		 475 aa  260  4e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  39.47 
 
 		 436 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  41.08 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  38.73 
 
 		 442 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  34.81 
 
 		 426 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  36.22 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  37.77 
 
 		 421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  35.18 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  36.88 
 
 		 433 aa  229  5e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  34.6 
 
 		 430 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  36.18 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  37.07 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 413 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  37.38 
 
 		 436 aa  223  4e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  36.97 
 
 		 412 aa  219  8.999999999999998e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  38.11 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  36.97 
 
 		 446 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  31.93 
 
 		 410 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  36.41 
 
 		 431 aa  209  6e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  36.61 
 
 		 415 aa  208  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 413 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 418 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 447 aa  206  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 474 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  32.63 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 426 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2010  transporter, putative  35.5 
 
 		 429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2679  major facilitator superfamily MFS_1  35.01 
 
 		 453 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000322743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2627  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 410 aa  194  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  37.69 
 
 		 428 aa  193  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 409 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  28.99 
 
 		 410 aa  192  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  35.28 
 
 		 440 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  32.91 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.7 
 
 		 424 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 401 aa  186  6e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1620  major facilitator superfamily MFS_1  30.34 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  33.33 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0297  major facilitator superfamily MFS_1  34.85 
 
 		 423 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0210722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  30.65 
 
 		 419 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>