More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1990 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 372 aa  758    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  67.65 
 
 		 378 aa  508  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  61.02 
 
 		 376 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  60.43 
 
 		 373 aa  462  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  59.41 
 
 		 375 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  59.41 
 
 		 395 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  61.35 
 
 		 375 aa  454  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  59.89 
 
 		 370 aa  455  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  60.96 
 
 		 376 aa  454  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  61.08 
 
 		 393 aa  455  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  59.95 
 
 		 371 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  60.22 
 
 		 370 aa  456  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  59.3 
 
 		 376 aa  453  1.0000000000000001e-126  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  62.02 
 
 		 372 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  60.54 
 
 		 376 aa  451  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  59.78 
 
 		 370 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  59.95 
 
 		 374 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  60.95 
 
 		 379 aa  443  1e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  59.78 
 
 		 370 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  59.78 
 
 		 370 aa  441  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  60.27 
 
 		 369 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  56.12 
 
 		 381 aa  440  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  59.67 
 
 		 370 aa  438  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  57.45 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  60.11 
 
 		 374 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  58.87 
 
 		 377 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  57.68 
 
 		 377 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  56.6 
 
 		 387 aa  431  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  60.11 
 
 		 378 aa  432  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  57.75 
 
 		 376 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  57.3 
 
 		 373 aa  431  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  59.46 
 
 		 375 aa  418  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  58.38 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  55.53 
 
 		 380 aa  408  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  56.76 
 
 		 385 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  55.61 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  54.1 
 
 		 369 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  51.63 
 
 		 382 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  42.08 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  26.8 
 
 		 383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  26.76 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 346 aa  91.7  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  24.37 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  26.48 
 
 		 338 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  23.97 
 
 		 361 aa  88.6  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  27.53 
 
 		 410 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  26.81 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.83 
 
 		 357 aa  86.3  8e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  23.98 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0063  aminotransferase, class V  24.79 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  25.28 
 
 		 371 aa  82.8  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  25.46 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  25.46 
 
 		 385 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  24.79 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  25.61 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  25.27 
 
 		 357 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  27.32 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  23.37 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  25.26 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0295  phosphoserine aminotransferase  24.8 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000953711  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  26.42 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  25 
 
 		 355 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1231  phosphoserine aminotransferase  24.32 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.140889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  24.43 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  25.32 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  25.06 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  26.11 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0617  phosphoserine aminotransferase  25.59 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.890804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  25.84 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  26.08 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  23.12 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  25.99 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  24.54 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6961  phosphoserine aminotransferase  25.81 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  24.67 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  25.58 
 
 		 391 aa  71.2  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3299  phosphoserine aminotransferase  22.7 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 390 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  24.66 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2969  phosphoserine aminotransferase  22.43 
 
 		 360 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3193  phosphoserine aminotransferase  24.41 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  25.38 
 
 		 391 aa  70.9  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  24.41 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  25.65 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28230  phosphoserine aminotransferase  23.48 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81935  normal  0.292864 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1988  phosphoserine aminotransferase  23.26 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3625  phosphoserine aminotransferase  26.08 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0111727 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  25.74 
 
 		 384 aa  70.1  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3023  phosphoserine aminotransferase  22.97 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  25.68 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  25.32 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3487  phosphoserine aminotransferase  24.42 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3383  phosphoserine aminotransferase  21.27 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000050178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  23.84 
 
 		 356 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  25.41 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3285  phosphoserine aminotransferase  23.24 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.334978  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2772  aminotransferase  24.79 
 
 		 358 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.22169e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4107  phosphoserine aminotransferase  23.58 
 
 		 390 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>