264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1972 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1972  large conductance mechanosensitive channel protein  100 
 
 		 132 aa  258  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30610  large conductance mechanosensitive channel protein  56.49 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0156749  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0832  large conductance mechanosensitive channel protein  56.72 
 
 		 201 aa  144  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0900  large conductance mechanosensitive channel protein  49.63 
 
 		 166 aa  137  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16810  mscL large conductance mechanosensitive channel protein  50 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230846  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2291  large conductance mechanosensitive channel protein  50.79 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1165  large conductance mechanosensitive channel protein  49.6 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.221389  normal  0.423534 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0070  large conductance mechanosensitive channel protein  48.8 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1924  Large-conductance mechanosensitive channel  45.93 
 
 		 168 aa  116  9e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.79206  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7238  large conductance mechanosensitive channel protein  48 
 
 		 129 aa  113  7.999999999999999e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0390041  normal  0.160628 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2197  large conductance mechanosensitive channel protein  43.41 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.270032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0624  large conductance mechanosensitive channel protein  44.53 
 
 		 176 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.29249  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1843  large conductance mechanosensitive channel protein  43.85 
 
 		 126 aa  107  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.130997  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2817  large conductance mechanosensitive channel protein  48.03 
 
 		 130 aa  107  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6488  large conductance mechanosensitive channel protein  46.4 
 
 		 169 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.182707  normal  0.360955 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2342  large conductance mechanosensitive channel protein  50.41 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2162  large-conductance mechanosensitive channel  47.15 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0038  large conductance mechanosensitive channel protein  42.22 
 
 		 136 aa  104  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1383  large conductance mechanosensitive channel protein  51 
 
 		 145 aa  104  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.190141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0902  large conductance mechanosensitive channel protein  43.22 
 
 		 134 aa  103  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0006  large conductance mechanosensitive channel protein  52.48 
 
 		 138 aa  103  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404291  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3137  large conductance mechanosensitive channel protein  48.36 
 
 		 127 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1428  large conductance mechanosensitive channel protein  40.94 
 
 		 126 aa  102  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.144967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2624  large conductance mechanosensitive channel protein  40.91 
 
 		 129 aa  102  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.462758 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0090  large conductance mechanosensitive channel protein  44.85 
 
 		 151 aa  100  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.343086  normal  0.118693 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2915  large conductance mechanosensitive channel protein  40.46 
 
 		 130 aa  100  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0317  large conductance mechanosensitive channel protein  41.94 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.209684  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1657  large-conductance mechanosensitive channel  43.9 
 
 		 125 aa  99.4  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0305  large conductance mechanosensitive channel protein  48.82 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13070  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00812185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  40.71 
 
 		 142 aa  97.1  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  41.73 
 
 		 137 aa  96.7  9e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0253  large-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23920  large conductance mechanosensitive channel protein  48.82 
 
 		 125 aa  94.4  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.814868 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8656  large conductance mechanosensitive channel protein  42.61 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2403  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000520108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3340  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000422883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1285  large-conductance mechanosensitive channel  39.68 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000347005  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4091  large conductance mechanosensitive channel protein  42.15 
 
 		 135 aa  90.5  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.845287  normal  0.456703 
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  38.85 
 
 		 138 aa  90.5  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  42.31 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0437  large-conductance mechanosensitive channel  39.37 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000628379  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  41.3 
 
 		 133 aa  90.1  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  38.13 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  41.48 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4569  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4404  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4421  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4924  large-conductance mechanosensitive channel  44.35 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4806  large-conductance mechanosensitive channel  44.44 
 
 		 133 aa  88.6  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4790  large-conductance mechanosensitive channel  43.55 
 
 		 132 aa  87.8  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5645  large conductance mechanosensitive channel protein  48.96 
 
 		 174 aa  87  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0366128  normal  0.120344 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3231  large-conductance mechanosensitive channel  37.76 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  42.42 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2606  hypothetical protein  42.52 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  42.42 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0454  large-conductance mechanosensitive channel  42.74 
 
 		 132 aa  85.9  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  42.42 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  42.42 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  38.4 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  40.43 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 199 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0225  large-conductance mechanosensitive channel  40.14 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0848  large-conductance mechanosensitive channel  42.11 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.231503  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4501  large-conductance mechanosensitive channel  44 
 
 		 133 aa  85.9  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4808  large-conductance mechanosensitive channel  41.94 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1538  large conductance mechanosensitive channel protein  38.85 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.580363  normal  0.302083 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4049  large conductance mechanosensitive channel protein  40.62 
 
 		 152 aa  84.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  41.98 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  40.85 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  40.85 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  39.26 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  37.4 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  39.26 
 
 		 139 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  39.26 
 
 		 137 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0712  large-conductance mechanosensitive channel  38.85 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  39.26 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2461  hypothetical protein  42.52 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  37.68 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  37.68 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  39.44 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  35.25 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4785  large-conductance mechanosensitive channel  41.94 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  37.68 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  38.52 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01831  large-conductance mechanosensitive channel  37.78 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.514761  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  36.43 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  35.92 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  35.92 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0618  large-conductance mechanosensitive channel  41.6 
 
 		 127 aa  82.4  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  39.69 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  35.92 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>