More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1944 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  79.49 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  77.55 
 
 		 211 aa  316  1e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  75.12 
 
 		 218 aa  315  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  72.45 
 
 		 245 aa  292  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  65.64 
 
 		 200 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  65.64 
 
 		 225 aa  263  8.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  64.8 
 
 		 221 aa  260  8e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  65.48 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  65.64 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  65.13 
 
 		 271 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  65.82 
 
 		 317 aa  256  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  64.1 
 
 		 215 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  64.29 
 
 		 330 aa  254  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 227 aa  248  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  61.22 
 
 		 226 aa  248  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  60.71 
 
 		 273 aa  247  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  62.05 
 
 		 218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 212 aa  242  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 197 aa  242  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 197 aa  237  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 217 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  58.67 
 
 		 215 aa  233  1.0000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  60.1 
 
 		 207 aa  232  3e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  55.9 
 
 		 199 aa  224  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  54.36 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  56.57 
 
 		 220 aa  217  7.999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  53.89 
 
 		 220 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.05 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 216 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 222 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 211 aa  84.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 218 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  29.23 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.42 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3349  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.545743 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  51.67 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8998  putative transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>