248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1888 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  100 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  63.1 
 
 		 262 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  58.62 
 
 		 249 aa  293  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  59.84 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  63.84 
 
 		 225 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  51.79 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  50 
 
 		 254 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  55.56 
 
 		 221 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  54.12 
 
 		 246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  47.15 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  53.37 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  56.11 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  47.91 
 
 		 246 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  47.6 
 
 		 273 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  53.27 
 
 		 366 aa  218  7e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  47.69 
 
 		 305 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  51.9 
 
 		 224 aa  212  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  51.44 
 
 		 218 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  38.98 
 
 		 314 aa  201  8e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  47.88 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  47.62 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  46.67 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  44.35 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  40.15 
 
 		 270 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  39.06 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  42.67 
 
 		 243 aa  169  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  41.59 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  41.59 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  41.59 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  43.86 
 
 		 229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  44.13 
 
 		 225 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  43.06 
 
 		 218 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  35.83 
 
 		 242 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  45.35 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  45.35 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  44.02 
 
 		 225 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  44.19 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  46.11 
 
 		 200 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  46.51 
 
 		 224 aa  136  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  43.56 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  40.64 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  43.56 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  39.89 
 
 		 195 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  43.81 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  39.89 
 
 		 195 aa  132  6e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  40.62 
 
 		 192 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  44.23 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  37.71 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  41.8 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  40.19 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  41.08 
 
 		 217 aa  122  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  38.1 
 
 		 218 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  39.91 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  35.96 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  35.96 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  39.23 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  33.95 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  36.61 
 
 		 215 aa  117  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  43.52 
 
 		 208 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  36.61 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  36.61 
 
 		 215 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  36.07 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  36.07 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  36.07 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  36.07 
 
 		 215 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  35.16 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  36.17 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  40.34 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  38.5 
 
 		 214 aa  109  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  35.71 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  39.75 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  37.71 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  31.73 
 
 		 230 aa  99  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  31.47 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  32.85 
 
 		 239 aa  95.5  8e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  34.12 
 
 		 208 aa  94.4  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  28.57 
 
 		 257 aa  92.4  7e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  37.5 
 
 		 215 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  31.31 
 
 		 228 aa  89.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0618  hemolysin III-like protein  26.48 
 
 		 225 aa  89.4  6e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.160524  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1319  hemolysin III, putative  26.92 
 
 		 214 aa  89  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  31.44 
 
 		 268 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1882  hemolysin III  28.12 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3054  channel protein, hemolysin III family  33.04 
 
 		 214 aa  87.8  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.126772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  32.54 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0520  hemolysin like protein  31.47 
 
 		 217 aa  85.9  6e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0640  channel protein, hemolysin III family  36.42 
 
 		 205 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  31.66 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  30.98 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  29.17 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2594  hemolysin III family channel protein  30.51 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.268239 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  29.83 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2012  hemolysin III family channel protein  26.75 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.203186 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0078  Hly-III family protein  36.5 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3940  Hly-III related proteins  33.78 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3320  channel protein, hemolysin III family  30.43 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3058  hemolysin III family channel protein  30.43 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4191  channel protein, hemolysin III family  30.43 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3226  hemolysin III family channel protein  30.43 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  35.5 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>