More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1870 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1870  histidine kinase  100 
 
 
453 aa  894    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0808061  normal  0.233739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  63.22 
 
 
445 aa  475  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.168426  hitchhiker  0.000491276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08520  signal transduction histidine kinase  65.87 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0435265  normal  0.631438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2598  histidine kinase  59.82 
 
 
445 aa  450  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1156  histidine kinase  54.09 
 
 
441 aa  426  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21080  signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
487 aa  268  1e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4121  histidine kinase  40.24 
 
 
425 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0708  histidine kinase  43.57 
 
 
432 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3847  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
428 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2550  sensor histidine kinase  50.36 
 
 
427 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450671  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0836  histidine kinase  40.23 
 
 
435 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.881156  hitchhiker  0.0000000748349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1334  Signal transduction histidine kinase-like protein  38.9 
 
 
425 aa  207  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134624  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4222  histidine kinase  34.92 
 
 
433 aa  194  4e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0052969  normal  0.0674921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05990  signal transduction histidine kinase  36.71 
 
 
427 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1047  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0115608  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1845  ATP-binding region ATPase domain protein  32.49 
 
 
453 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0388178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6381  histidine kinase  35.53 
 
 
424 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.836849  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08390  signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 
345 aa  160  3e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0723991  normal  0.184348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0770  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
445 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.875838  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2897  histidine kinase  29.61 
 
 
571 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1241  histidine kinase  28.97 
 
 
404 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.948889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1329  sensor histidine kinase  28.09 
 
 
475 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1605  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
431 aa  101  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430021  normal  0.604384 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 
425 aa  98.6  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1460  histidine kinase  31.62 
 
 
328 aa  99  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4792  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 
534 aa  98.2  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1279  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
464 aa  98.2  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
467 aa  97.4  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4137  histidine kinase  33.61 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9262  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.77 
 
 
457 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3908  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.441725  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0398  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
418 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.675232  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2268  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
468 aa  94.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.371039  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
419 aa  93.6  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4423  ATPase domain-containing protein  31.98 
 
 
449 aa  93.6  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.272251  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  34.98 
 
 
454 aa  92.4  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
419 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1632  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 
535 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  29.27 
 
 
505 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  29.27 
 
 
505 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0896  histidine kinase  27.92 
 
 
491 aa  91.3  3e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0295  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
418 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0299  histidine kinase  25.08 
 
 
418 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0287  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
418 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
418 aa  90.9  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2592  histidine kinase  26.39 
 
 
507 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3030  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
576 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4613  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
440 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  29.27 
 
 
523 aa  90.1  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3460  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.09 
 
 
442 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.025343  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  28.92 
 
 
505 aa  89.7  8e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  28.92 
 
 
518 aa  89.7  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.31 
 
 
447 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5446  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.94 
 
 
425 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0114827  normal  0.17199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.42 
 
 
477 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5019  histidine kinase  29.85 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.554141  normal  0.501174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1092  Signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 
441 aa  89.7  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0028584  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
366 aa  89.4  1e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5254  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
440 aa  89.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1102  histidine kinase  29.92 
 
 
473 aa  89.4  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.486214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3910  sensor histidine kinase  31.32 
 
 
435 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 
476 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4391  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.87 
 
 
407 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.61651  decreased coverage  0.00000664271 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1504  ATPase domain-containing protein  23.55 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1475  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  28.57 
 
 
505 aa  88.2  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
440 aa  88.2  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160949  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0396  histidine kinase  29.79 
 
 
469 aa  87.8  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 
466 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3525  histidine kinase  25.45 
 
 
491 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  23.59 
 
 
488 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0283  ATPase domain-containing protein  24.76 
 
 
411 aa  87.4  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143698  hitchhiker  0.000000382002 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
504 aa  87.8  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
462 aa  87.8  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  25.72 
 
 
461 aa  87.4  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  29.13 
 
 
481 aa  87.4  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1373  histidine kinase  31.23 
 
 
454 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.182248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 
466 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
480 aa  87.4  5e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0228  sensor histidine kinase  29.06 
 
 
446 aa  87  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0209  sensor histidine kinase  29.06 
 
 
446 aa  87  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0259  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.36 
 
 
460 aa  87  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.74 
 
 
463 aa  87  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0282  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
411 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000209269 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3739  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
411 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0303484 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
519 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5327  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
480 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.446982 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4962  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
448 aa  86.7  8e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480861  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  28.57 
 
 
817 aa  86.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3062  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
458 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0449  sensor histidine kinase  27.74 
 
 
494 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.445216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.09 
 
 
463 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 
515 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0610  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
494 aa  86.3  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
473 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.165906  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  33.5 
 
 
480 aa  86.3  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 
438 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>