More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1856 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2542  Phosphomannomutase  71.92 
 
 		 488 aa  712    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1856  Phosphomannomutase  100 
 
 		 502 aa  1010    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.114337  decreased coverage  0.00605536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09120  phosphomannomutase  78.33 
 
 		 529 aa  779    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.187509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3841  Phosphomannomutase  66.13 
 
 		 497 aa  633  1e-180  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.062306 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3585  Phosphomannomutase  60.82 
 
 		 479 aa  578  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0898  phosphomannomutase  60.12 
 
 		 461 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478971  normal  0.0385997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4298  Phosphomannomutase  60.99 
 
 		 454 aa  533  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3760  Phosphomannomutase  59.55 
 
 		 453 aa  532  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.343268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6327  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  61.15 
 
 		 450 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.428689  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0961  phosphomannomutase  61.46 
 
 		 461 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.386078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03540  phosphomannomutase  56.47 
 
 		 491 aa  526  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2510  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  59.34 
 
 		 455 aa  521  1e-147  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0818  Phosphomannomutase  55.76 
 
 		 472 aa  524  1e-147  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0671  phosphomannomutase  55.62 
 
 		 475 aa  523  1e-147  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.828766  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08560  phosphomannomutase  59.68 
 
 		 487 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.749123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31020  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  60.45 
 
 		 451 aa  518  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1187  Phosphomannomutase  56.62 
 
 		 456 aa  511  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.485619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7604  Phosphomannomutase  60.29 
 
 		 449 aa  505  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.908268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0756  Phosphomannomutase  58.32 
 
 		 451 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.106468  normal  0.0777802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1387  Phosphomannomutase  59.14 
 
 		 450 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1952  phosphomannomutase  62.8 
 
 		 414 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.322718  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0465  phosphomannomutase  57.46 
 
 		 454 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441417  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4063  Phosphomannomutase  59.43 
 
 		 456 aa  490  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0919518  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0751  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  56.26 
 
 		 452 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.648752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4168  Phosphomannomutase  57.43 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.400371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5858  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  57.38 
 
 		 453 aa  475  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0925623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1737  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  56.22 
 
 		 464 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.847298  normal  0.689022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4726  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  56.73 
 
 		 465 aa  472  1e-132  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.267989  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6010  Phosphomannomutase  56.85 
 
 		 454 aa  473  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.30884  normal  0.056179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1364  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  54.84 
 
 		 465 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176475  normal  0.655061 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1425  phosphomannomutase  54.51 
 
 		 469 aa  463  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.896243  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1328  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  54.84 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.23364  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1345  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  54.84 
 
 		 465 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701993 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13286  phosphomannomutase/phosphoglucomutase  54.55 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.489635 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20740  phosphomannomutase  50.1 
 
 		 592 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00626227  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1134  phosphomannomutase  45.91 
 
 		 472 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.579862  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1768  Phosphomannomutase  49.8 
 
 		 451 aa  413  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0585  Phosphomannomutase  41.44 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.681403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4694  phosphomannomutase  38.76 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4124  phosphomannomutase  40.86 
 
 		 448 aa  323  5e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1218  phosphomannomutase  40.86 
 
 		 448 aa  318  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0459323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0863  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  40.04 
 
 		 813 aa  307  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2432  Fis family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 444 aa  300  5e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1134  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain III  38.56 
 
 		 450 aa  300  6e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0747537  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1093  Phosphomannomutase  39.55 
 
 		 448 aa  299  1e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3174  Phosphomannomutase  40.37 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3126  phosphomannomutase  38.35 
 
 		 461 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141531  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0302  phosphomannomutase  37.09 
 
 		 470 aa  294  2e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2589  Phosphomannomutase  36.63 
 
 		 447 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3151  Phosphomannomutase  37.73 
 
 		 450 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1432  Phosphomannomutase  38.04 
 
 		 453 aa  293  6e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0200  phosphomannomutase  38.37 
 
 		 449 aa  293  7e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0229  phosphomannomutase  37.58 
 
 		 449 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0458  phosphomannomutase  36.42 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235202  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03174  phosphohexose mutase  39.88 
 
 		 448 aa  291  2e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1779  phosphomannomutase ManB  37.32 
 
 		 450 aa  291  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1118  phosphomannomutase  35.45 
 
 		 454 aa  290  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000519382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1792  phosphomannomutase  37.99 
 
 		 450 aa  289  8e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2662  phosphomannomutase  37.58 
 
 		 456 aa  288  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0392975  normal  0.829535 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0895  Phosphomannomutase  37.5 
 
 		 456 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310909  hitchhiker  0.000000688858 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1600  phosphomannomutase  37.04 
 
 		 455 aa  287  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0455813  normal  0.713517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1384  phosphomannomutase  38.49 
 
 		 453 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2643  phosphomannomutase  37.5 
 
 		 457 aa  285  1.0000000000000001e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.320582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3280  Phosphomannomutase  38.14 
 
 		 454 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1317  Phosphomannomutase  36.49 
 
 		 457 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214391  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1677  phosphomannomutase  36.51 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0509  Phosphomannomutase  37.42 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0115906 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3178  phosphomannomutase  35.46 
 
 		 457 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0274  phosphomannomutase  35.5 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3037  phosphomannomutase  35.46 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.848364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1256  phosphomannomutase  35.46 
 
 		 457 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000453708  hitchhiker  0.000000000293956 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2286  phosphomannomutase  37.47 
 
 		 456 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657815 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1777  phosphomannomutase  37.27 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.615719  hitchhiker  0.00889462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1593  phosphomannomutase  36.31 
 
 		 456 aa  276  6e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.014113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2340  phosphomannomutase  36.1 
 
 		 456 aa  276  6e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1609  Phosphomannomutase  36.1 
 
 		 456 aa  275  9e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000012475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2964  phosphomannomutase  36.75 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000327344 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2330  phosphomannomutase  37.27 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0469689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2337  phosphomannomutase  36.8 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1014  phosphomannomutase  36.1 
 
 		 456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1184  phosphomannomutase  35.89 
 
 		 456 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1001  phosphomannomutase  36.34 
 
 		 453 aa  275  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.834887  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01932  Phosphomannomutase  36.44 
 
 		 454 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01954  phosphomannomutase  35.89 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0099894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01943  hypothetical protein  35.89 
 
 		 456 aa  274  3e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00870446  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2109  Phosphomannomutase  38.22 
 
 		 467 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.221501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2255  Phosphomannomutase  38.46 
 
 		 450 aa  274  3e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0395092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2982  phosphomannomutase  35.89 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000140295 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2229  phosphomannomutase  36.8 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117299  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2444  phosphomannomutase  37.06 
 
 		 456 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188854 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2851  Phosphomannomutase  36.83 
 
 		 457 aa  272  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0414  Phosphomannomutase  39.02 
 
 		 473 aa  272  1e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01868  phosphomannomutase  34.5 
 
 		 486 aa  271  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.203499  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2622  phosphomannomutase  36.62 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0111  phosphomannomutase  34.21 
 
 		 493 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0120  phosphomannomutase  35.62 
 
 		 497 aa  269  7e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1632  phosphomannomutase  35.18 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1738  phosphomannomutase  35.18 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0922588  hitchhiker  0.000796464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1525  phosphomannomutase  35.18 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1793  phosphomannomutase  34.37 
 
 		 481 aa  267  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00302913  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>