113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1838 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1838  SpoIID/LytB domain protein  100 
 
 		 871 aa  1749    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.353956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  25.92 
 
 		 625 aa  94.4  7e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14021  sporulation protein SpoIID  31.06 
 
 		 432 aa  89.4  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.388371  normal  0.301012 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3325  SpoIID/LytB domain protein  27.27 
 
 		 377 aa  85.9  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0346902  normal  0.223607 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1118  SpoIID/LytB domain protein  27.93 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.819333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3247  SpoIID/LytB domain protein  32.23 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3879  SpoIID/LytB domain  28.16 
 
 		 664 aa  83.2  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00907037 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0423  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.03 
 
 		 874 aa  82.8  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1696  sporulation protein and related proteins-like  27.55 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.600188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0642  SpoIID/LytB domain-containing protein  32 
 
 		 388 aa  80.1  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0335731  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3515  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.15 
 
 		 417 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0527  SpoIID/LytB domain protein  31.06 
 
 		 546 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000920143  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15341  sporulation protein SpoIID  28.81 
 
 		 391 aa  77.4  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00436171  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15491  sporulation protein SpoIID  29.61 
 
 		 391 aa  76.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1446  sporulation protein SpoIID-like  30.1 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1440  SpoIID/LytB domain-containing protein  24.87 
 
 		 762 aa  74.7  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0244  SpoIID/LytB domain protein  29.76 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0106  SpoIID/LytB domain-containing protein  36.69 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2135  SpoIID/LytB domain-containing protein  34.58 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2359  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.28 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000614702  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0160  SpoIID/LytB domain protein  25.3 
 
 		 735 aa  72.4  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1802  SpoIID/LytB domain-containing protein  29.24 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.806202  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2625  SpoIID/LytB domain protein  30.41 
 
 		 368 aa  70.5  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4218  sporulation protein SpoIID-like  29.71 
 
 		 384 aa  70.1  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000195999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0960  SpoIID/LytB domain-containing protein  27.95 
 
 		 570 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000216534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0035  SpoIID/LytB domain-containing protein  26.53 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000486765  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1179  SpoIID/LytB domain protein  25.29 
 
 		 658 aa  70.1  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0850  stage II sporulation-related protein  27.8 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1714  SpoIID/LytB domain-containing protein  24.23 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151227  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5043  SpoIID/LytB domain protein  28.75 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0919  sporulation protein SpoIID  33.64 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1742  SpoIID/LytB domain protein  28.2 
 
 		 1032 aa  67  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.334202  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17751  sporulation protein SpoIID  32.34 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2831  SpoIID/LytB domain protein  31.84 
 
 		 380 aa  65.1  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.835206  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4162  stage II sporulation protein D  31.9 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000996783  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15091  sporulation protein SpoIID  29.13 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4515  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.84 
 
 		 381 aa  64.3  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1767  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.37 
 
 		 450 aa  63.9  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.312294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0689  SpoIID/LytB domain-containing protein  60.87 
 
 		 326 aa  64.3  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.531894  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3287  stage II sporulation protein D  32.17 
 
 		 342 aa  63.9  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2281  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.08 
 
 		 563 aa  63.2  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00377918  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0278  SpoIID/LytB domain protein  30.15 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4925  SpoIID/LytB domain protein  50.98 
 
 		 558 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.995863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2616  SpoIID/LytB domain-containing protein  28.28 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0920  SpoIID/LytB domain protein  26.78 
 
 		 437 aa  62  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0663861  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3479  SpoIID/LytB domain-containing protein  30.41 
 
 		 852 aa  62  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00505256  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1794  SpoIID/LytB domain protein  28 
 
 		 720 aa  61.6  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160859 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2687  SpoIID/LytB domain protein  28.8 
 
 		 383 aa  60.8  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2187  SpoIID/LytB domain protein  26.92 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2621  stage II sporulation-related protein  25.51 
 
 		 321 aa  60.1  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1608  SpoIID/LytB domain protein  29.44 
 
 		 363 aa  60.1  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21150  SpoIID/LytB domain protein  62.16 
 
 		 316 aa  60.1  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000468923  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1392  SpoIID/LytB domain protein  28.03 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2144  stage II sporulation protein D-like  28.16 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5084  sporulation stage II protein D  59.09 
 
 		 339 aa  59.3  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1362  SpoIID/LytB domain protein  28.03 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3399  stage II sporulation protein D  30.99 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2012  stage II sporulation protein D-like  39.06 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.703242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5407  stage II sporulation protein D  30.11 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3805  sporulation stage II protein D  30.77 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2374  sporulation protein and related proteins  63.16 
 
 		 326 aa  57.8  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000760464 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3147  SpoIID/LytB domain-containing protein  53.33 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5543  stage II sporulation protein D  30.34 
 
 		 339 aa  57  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00744425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1780  SpoIID/LytB domain protein  24.76 
 
 		 369 aa  57  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000174571 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5411  stage II sporulation protein D  58.14 
 
 		 339 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0080939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5136  stage II sporulation protein D  58.14 
 
 		 339 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4968  stage II sporulation protein D  29.57 
 
 		 339 aa  56.6  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0719716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4986  stage II sporulation protein D  58.14 
 
 		 339 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.579357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5528  stage II sporulation protein D  58.14 
 
 		 339 aa  56.6  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2158  stage II sporulation protein D  29.2 
 
 		 340 aa  56.6  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5462  stage II sporulation protein D  58.14 
 
 		 339 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000156076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5377  stage II sporulation protein D  58.14 
 
 		 339 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000599037 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2839  stage II sporulation protein D  33.12 
 
 		 345 aa  55.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0700  SpoIID/LytB domain-containing protein  32.88 
 
 		 503 aa  55.5  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05351  sporulation protein SpoIID  51.11 
 
 		 472 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0630  SpoIID/LytB domain protein  25.7 
 
 		 381 aa  55.1  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2545  stage II sporulation-related protein  54.76 
 
 		 291 aa  55.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2013  SpoIID/LytB domain protein  27.17 
 
 		 376 aa  54.7  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.588704  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4787  SpoIID/LytB domain protein  47.92 
 
 		 313 aa  54.7  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17760  sporulation stage II protein D  29.3 
 
 		 319 aa  54.3  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.377102  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2108  sporulation protein and related proteins  55.26 
 
 		 326 aa  53.9  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1304  SpoIID/LytB domain protein  52.38 
 
 		 291 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0430869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2437  SpoIID/LytB domain protein  25.59 
 
 		 369 aa  54.3  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.712007  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1405  SpoIID/LytB domain protein  52.38 
 
 		 291 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2448  stage II sporulation protein D  54.05 
 
 		 340 aa  52.8  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0712  SpoIID/LytB domain protein  35.42 
 
 		 586 aa  52.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0218  stage II sporulation protein D  27.15 
 
 		 358 aa  52  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0533  stage II sporulation protein D-like  48.94 
 
 		 489 aa  52  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0085  stage II sporulation protein D  27.68 
 
 		 314 aa  52  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.622828  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10950  SpoIID/LytB domain protein  33.33 
 
 		 708 aa  51.2  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0118961  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3764  Stage II sporulation D domain protein  30.97 
 
 		 305 aa  50.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1268  SpoIID/LytB domain-containing protein  43.48 
 
 		 321 aa  50.8  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0506  SpoIID/LytB domain-containing protein  23.98 
 
 		 366 aa  50.8  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.133427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0757  amidase enhancer  33.33 
 
 		 555 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3624  SpoIID/LytB domain protein  44.44 
 
 		 459 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000549962  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0918  SpoIID/LytB domain-containing protein  31.25 
 
 		 536 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.478605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2376  stage II sporulation protein D  27.97 
 
 		 291 aa  49.7  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440786  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2597  SpoIID/LytB domain protein  29.94 
 
 		 493 aa  49.7  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0117  SpoIID/LytB domain-containing protein  52.63 
 
 		 317 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0180  SpoIID/LytB domain-containing protein  33.79 
 
 		 533 aa  48.5  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>