279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1730 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  618  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.29 
 
 		 319 aa  259  3e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  50.63 
 
 		 313 aa  245  9e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  48.66 
 
 		 310 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  43.5 
 
 		 339 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  42.64 
 
 		 334 aa  225  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  43.3 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  37.63 
 
 		 340 aa  193  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  36.99 
 
 		 346 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  43.03 
 
 		 319 aa  178  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  37.15 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  41.95 
 
 		 324 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  36.56 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  39.15 
 
 		 299 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  39.29 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  40 
 
 		 326 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  37.26 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  36 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  36.93 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  37.82 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  39.94 
 
 		 309 aa  146  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  38.74 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  35.24 
 
 		 299 aa  139  7e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  33.33 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  36.28 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  37.54 
 
 		 300 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  35.5 
 
 		 304 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  34.43 
 
 		 301 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  37.09 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  37.09 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  37.09 
 
 		 299 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  36.27 
 
 		 329 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  34.11 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  35.02 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  34.11 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  31.64 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  31.79 
 
 		 323 aa  94.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  27.02 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  33.33 
 
 		 333 aa  89.4  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  28.77 
 
 		 289 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  26.1 
 
 		 324 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  26.42 
 
 		 324 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  24.52 
 
 		 334 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  25.26 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  26.1 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  25.61 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  26.99 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  26.1 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  26.1 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  26.28 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0966  thioredoxin domain-containing protein  25.85 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  26.1 
 
 		 290 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  27.08 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  27.62 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1429  thioredoxin-related  27.02 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000020457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  27.3 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  25.96 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  25.96 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  26.01 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  25.96 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  25.96 
 
 		 284 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  27.02 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  25.96 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  25.96 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  25.96 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  25.96 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  25.96 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  27.27 
 
 		 326 aa  75.5  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  28.86 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  25.08 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0558  thioredoxin domain protein  25.61 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0568  thioredoxin domain protein  24.65 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0612  thioredoxin domain-containing protein  24.65 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.557632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0553  thioredoxin domain-containing protein  24.65 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3195  Thioredoxin domain protein  23.29 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64186  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  25.52 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3007  Thioredoxin domain protein  26.95 
 
 		 286 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0551  thioredoxin domain protein  25.61 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  24.74 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  24.74 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  25.16 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1527  thioredoxin domain-containing protein  25.35 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000426652  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004149  thioredoxin domain-containing protein  26.64 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  25.08 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  27.12 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  25.44 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  26.28 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  25.51 
 
 		 329 aa  68.9  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  25.51 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2848  thioredoxin domain-containing protein  30.82 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000781433  decreased coverage  0.00000000282875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1120  Thioredoxin domain protein  24.49 
 
 		 286 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2298  thioredoxin domain-containing protein  32.38 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000886101  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  25.81 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  23.29 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  24.26 
 
 		 298 aa  67.8  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1305  thioredoxin  27.62 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.277929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  24.12 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  25.25 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  24.29 
 
 		 338 aa  67.4  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  24.73 
 
 		 281 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>