159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1701 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 
349 aa  715    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  67.05 
 
 
349 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1428  biotin/lipoate A/B protein ligase  60.73 
 
 
354 aa  428  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  60.34 
 
 
358 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  61.45 
 
 
358 aa  412  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  59.31 
 
 
349 aa  410  1e-113  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  57.1 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.32 
 
 
372 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  56.16 
 
 
349 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.31 
 
 
365 aa  384  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11650  lipoate-protein ligase A  54.73 
 
 
352 aa  384  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  57.09 
 
 
261 aa  302  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  55.17 
 
 
261 aa  292  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  55.86 
 
 
257 aa  289  5.0000000000000004e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  55.4 
 
 
253 aa  239  6.999999999999999e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  49.03 
 
 
259 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  35.91 
 
 
245 aa  136  6.0000000000000005e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02600  hypothetical protein  46.67 
 
 
220 aa  122  9e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  30.74 
 
 
336 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  30 
 
 
326 aa  107  4e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  30.7 
 
 
333 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  29.91 
 
 
334 aa  103  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.37 
 
 
329 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.24 
 
 
343 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.93 
 
 
327 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.08 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  31.65 
 
 
325 aa  96.7  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  30.85 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  27.82 
 
 
329 aa  92.8  8e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  27.53 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  28.02 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0964  hypothetical protein  53.33 
 
 
91 aa  91.3  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.27883  normal  0.241278 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  29.77 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.67 
 
 
530 aa  90.1  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  32.37 
 
 
328 aa  89.4  8e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  27.78 
 
 
331 aa  89  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.88 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.88 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  29.34 
 
 
332 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  30.16 
 
 
247 aa  86.3  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  26.47 
 
 
334 aa  86.3  8e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.64 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  28.03 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.22 
 
 
345 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1506  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.54 
 
 
240 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  28.44 
 
 
337 aa  82  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.59 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1097  lipoate-protein ligase A family protein  23.64 
 
 
276 aa  80.5  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3412  hypothetical protein  44.68 
 
 
94 aa  80.1  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.010842  normal  0.533317 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  28.8 
 
 
334 aa  80.1  0.00000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  26.78 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0451  hypothetical protein  48.91 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1591  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.36 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00744993  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1624  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.36 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.997358  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.05 
 
 
332 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  26.78 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  26.78 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  26.78 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  26.78 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  26.78 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  26.78 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  26.78 
 
 
329 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  30.33 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1515  hypothetical protein  46.67 
 
 
94 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.648993  hitchhiker  0.00942142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  26.36 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2805  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.45 
 
 
278 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  26.47 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  25.94 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.36 
 
 
329 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.94 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  25 
 
 
332 aa  74.7  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  31.38 
 
 
339 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  27.59 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.59 
 
 
356 aa  73.6  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.61 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1939  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.28 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515448  unclonable  0.000000010218 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2238  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.15 
 
 
271 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.791553  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  30.05 
 
 
289 aa  72  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.28 
 
 
278 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.61 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4284  lipoate-protein ligase A, putative  24.44 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3952  lipoate-protein ligase A  24.44 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3962  lipoate-protein ligase A  24.44 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4339  putative lipoate-protein ligase A  24.44 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4228  putative lipoate-protein ligase A  24.44 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4063  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.95 
 
 
278 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.934353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4111  lipoate-protein ligase A  23.68 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4431  lipoate-protein ligase A  23.68 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.68 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.58 
 
 
357 aa  70.1  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0914  putative lipoate-protein ligase A  24.44 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.017149  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.09 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  28.77 
 
 
338 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4319  putative lipoate-protein ligase A  24.44 
 
 
278 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2355  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.86 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  28.77 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  28.77 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  28.77 
 
 
338 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  28.77 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  28.77 
 
 
338 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.632003 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>