More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1640 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 225 aa  452  1.0000000000000001e-126  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  47.09 
 
 		 226 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  46.43 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  46.82 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  49.28 
 
 		 204 aa  168  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0325  phosphoglycerate mutase family protein  37.04 
 
 		 281 aa  148  5e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0720  phosphoglycerate mutase family protein  38.36 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00316433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  41.15 
 
 		 204 aa  138  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  43.14 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  40.98 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 210 aa  135  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 208 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.26 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  41.46 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1011  phosphoglycerate mutase family protein  33.48 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  37.98 
 
 		 203 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3852  phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254463 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  37.2 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  39.27 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  35.84 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 		 207 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  39.77 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3472  phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2655  phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 		 224 aa  106  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.725658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  40.59 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 212 aa  105  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 223 aa  105  8e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.79 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3192  Phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  38.18 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.6 
 
 		 205 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  39.08 
 
 		 213 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  35.8 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  40.34 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 205 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 		 205 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 		 412 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.71 
 
 		 442 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.93 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 229 aa  88.6  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.73 
 
 		 229 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.73 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 220 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 251 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.12 
 
 		 442 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.73 
 
 		 220 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  34.73 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 		 209 aa  87.4  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.93 
 
 		 220 aa  86.3  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  34.73 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 221 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  38.24 
 
 		 215 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 411 aa  85.5  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 402 aa  85.1  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  35.23 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  46.23 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  38.2 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  35.88 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 449 aa  83.2  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  31.76 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 215 aa  80.9  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.06 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 445 aa  81.3  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>