249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1550 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1550  heat-inducible transcription repressor HrcA  100 
 
 		 339 aa  676    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13430  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.5 
 
 		 341 aa  388  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.272128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2192  heat-inducible transcription repressor HrcA  62.72 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1241  heat-inducible transcription repressor  57.52 
 
 		 340 aa  370  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000248464  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3836  heat-inducible transcription repressor  57.48 
 
 		 340 aa  368  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0984898  decreased coverage  0.000187974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3456  heat-inducible transcription repressor  57.77 
 
 		 351 aa  368  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13540  heat-inducible transcription repressor  57.86 
 
 		 341 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2109  heat-inducible transcription repressor  58.81 
 
 		 339 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2210  heat-inducible transcription repressor HrcA  57.99 
 
 		 340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.867098  hitchhiker  0.00537893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1264  heat-inducible transcription repressor  56.42 
 
 		 339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00809958 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1903  heat-inducible transcription repressor  56.97 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.518414  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0838  heat-inducible transcription repressor  55.82 
 
 		 343 aa  348  7e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.197604  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3460  heat-inducible transcription repressor  54.68 
 
 		 347 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3523  heat-inducible transcription repressor  54.68 
 
 		 347 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346852  normal  0.41387 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3471  heat-inducible transcription repressor  54.68 
 
 		 347 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00335096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5456  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.72 
 
 		 340 aa  346  4e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3253  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.52 
 
 		 337 aa  345  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240463  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3837  heat-inducible transcription repressor  55.07 
 
 		 343 aa  345  5e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.833698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1748  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.99 
 
 		 351 aa  345  8.999999999999999e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.133663  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7058  heat-inducible transcription repressor  56.08 
 
 		 343 aa  344  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2701  heat-inducible transcription repressor  53.24 
 
 		 343 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0906704  normal  0.605466 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2766  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.1 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0267465  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3163  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.2 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0783  heat-inducible transcription repressor  56.97 
 
 		 339 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0540401 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1643  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.52 
 
 		 340 aa  335  5e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2289  heat-inducible transcription repressor HrcA  55.92 
 
 		 337 aa  335  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3406  heat-inducible transcription repressor HrcA  56.13 
 
 		 346 aa  334  2e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1150  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.14 
 
 		 340 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.330335 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0701  heat-inducible transcription repressor HrcA  53.13 
 
 		 337 aa  332  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12399  heat-inducible transcription repressor  53.69 
 
 		 343 aa  331  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2236  heat-inducible transcription repressor  53.87 
 
 		 337 aa  328  6e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00592229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1571  heat-inducible transcription repressor HrcA  54.84 
 
 		 340 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.27159  hitchhiker  0.00683488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1973  heat-inducible transcription repressor  51.79 
 
 		 337 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000596176 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12370  heat-inducible transcription repressor HrcA  52.91 
 
 		 337 aa  309  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0321909  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11690  heat-inducible transcription repressor HrcA  49.42 
 
 		 350 aa  291  9e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.428721  normal  0.406085 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17300  heat-inducible transcription repressor HrcA  45.65 
 
 		 336 aa  271  1e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0443  heat-inducible transcription repressor  43.55 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0786222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0901  heat-inducible transcription repressor HrcA  44.09 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2499  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.31 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3224  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.01 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00005295  hitchhiker  0.00493399 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2060  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.2 
 
 		 344 aa  200  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1648  heat-inducible transcription repressor HrcA  37.92 
 
 		 337 aa  198  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.685607  normal  0.0242929 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10320  heat shock gene repressor HrcA  35.52 
 
 		 336 aa  195  1e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.319867  unclonable  0.00000000169449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3534  heat-inducible transcription repressor HrcA  35.42 
 
 		 343 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000167088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2831  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.62 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.304325  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07690  heat shock gene repressor HrcA  39.27 
 
 		 336 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0773  heat-inducible transcription repressor  35.71 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1333  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.25 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000176294  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1406  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.02 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2007  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 		 339 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2292  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 		 339 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2081  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.55 
 
 		 343 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1553  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.7 
 
 		 343 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000153808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0031  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.31 
 
 		 342 aa  182  6e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.820963  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4301  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.95 
 
 		 345 aa  181  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1324  heat-inducible transcription repressor HrcA  29.48 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0209  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.22 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000018934  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4335  heat-inducible transcription repressor  35.12 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0583  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.94 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1181  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.35 
 
 		 343 aa  176  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3593  heat-inducible transcription repressor  34.83 
 
 		 334 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294148  hitchhiker  0.00295463 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0458  heat-inducible transcription repressor HrcA  36.06 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.482284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1800  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.33 
 
 		 348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.478668  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1650  heat-inducible transcription repressor  34.83 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.207974  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0847  heat-inducible transcription repressor  33.93 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0905  heat-inducible transcription repressor  33.93 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4390  heat-inducible transcription repressor HrcA  31.01 
 
 		 359 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1581  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.44 
 
 		 341 aa  173  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00115825  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1050  heat-inducible transcription repressor  34.93 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3966  heat-inducible transcription repressor  34.12 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0692211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3462  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.23 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000760738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0732  heat-inducible transcription repressor  34.12 
 
 		 339 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1303  heat-inducible transcription repressor  34.33 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.480706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2549  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.66 
 
 		 357 aa  169  6e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.330864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1011  heat-inducible transcription repressor  28.57 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0930  heat-inducible transcription repressor  34.1 
 
 		 342 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1036  heat-inducible transcription repressor  32.38 
 
 		 345 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.672204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12820  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.29 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2696  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.62 
 
 		 376 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.666448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0909  heat-inducible transcription repressor  34.93 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.185567  normal  0.427859 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0109  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.36 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620435  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5419  heat-inducible transcription repressor  35.1 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4476  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.08 
 
 		 354 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.457422 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2331  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3327  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0494  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1105  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 385 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.854557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3284  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.245483  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3317  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2212  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1302  heat-inducible transcription repressor  34.52 
 
 		 340 aa  166  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2439  heat-inducible transcription repressor  28.32 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000794362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0305  heat-inducible transcription repressor HrcA  32.44 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2423  heat-inducible transcription repressor  35.01 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.557325  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1000  heat-inducible transcription repressor  31.52 
 
 		 348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.897322  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1478  heat-inducible transcription repressor HrcA  34.43 
 
 		 351 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0438  heat-inducible transcription repressor HrcA  33.52 
 
 		 354 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000928252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2313  heat-inducible transcription repressor HrcA  30.32 
 
 		 345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000876043  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3487  heat-inducible transcription repressor  33.04 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000893499 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1724  heat-inducible transcription repressor  34.03 
 
 		 342 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0452003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>