More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1520 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1520  peptide deformylase  100 
 
 		 162 aa  325  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.420459  normal  0.0828575 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14050  peptide deformylase  77.16 
 
 		 162 aa  261  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.455853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2143  peptide deformylase  80.25 
 
 		 164 aa  258  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2158  peptide deformylase  76.54 
 
 		 162 aa  256  9e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1799  peptide deformylase  74.69 
 
 		 162 aa  253  8e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.341074  hitchhiker  0.00908048 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0402  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  68.55 
 
 		 162 aa  211  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00108273  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0811  peptide deformylase  63.58 
 
 		 162 aa  207  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0295  peptide deformylase  60.25 
 
 		 184 aa  197  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1592  peptide deformylase  60.38 
 
 		 161 aa  191  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0439056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2433  peptide deformylase  58.39 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27860  peptide deformylase  56.25 
 
 		 166 aa  186  1e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0522307 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16790  N-formylmethionyl-tRNA deformylase  56.1 
 
 		 163 aa  176  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0288836  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2508  peptide deformylase  51.23 
 
 		 168 aa  165  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0280865  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1279  peptide deformylase  49.07 
 
 		 180 aa  159  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00526616  normal  0.0870351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2574  peptide deformylase  48.45 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.0804397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2357  peptide deformylase  50 
 
 		 167 aa  157  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.408741  normal  0.109738 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1367  peptide deformylase  50.94 
 
 		 182 aa  157  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561221  normal  0.0670098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3001  peptide deformylase  46.58 
 
 		 181 aa  155  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00230291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2824  Peptide deformylase  50.31 
 
 		 182 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.11831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5225  peptide deformylase  47.17 
 
 		 181 aa  154  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240861  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1868  peptide deformylase  45.28 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.647129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3098  peptide deformylase  45.28 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1861  peptide deformylase  44.72 
 
 		 186 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  47.8 
 
 		 204 aa  151  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2568  peptide deformylase  44.72 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.126543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2985  peptide deformylase  45.96 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5192  peptide deformylase  47.53 
 
 		 213 aa  146  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0341702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2441  peptide deformylase  47.2 
 
 		 181 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0409247  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1718  peptide deformylase  46.91 
 
 		 183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0107997  hitchhiker  0.00219347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34550  peptide deformylase  47.95 
 
 		 183 aa  142  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1670  peptide deformylase  47.8 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.140138  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10790  peptide deformylase  46.94 
 
 		 191 aa  135  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00525841  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0427  peptide deformylase  44.71 
 
 		 195 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.62292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0583  peptide deformylase  48.52 
 
 		 178 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0732  peptide deformylase  45.2 
 
 		 197 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.587652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0569  peptide deformylase  49.72 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0581  peptide deformylase  49.72 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28634  hitchhiker  0.00744017 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0559  peptide deformylase  49.72 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.489462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0175  peptide deformylase  45.2 
 
 		 197 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.94792 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26070  peptide deformylase  42.11 
 
 		 192 aa  130  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4914  peptide deformylase  43.45 
 
 		 190 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10434  peptide deformylase  44.63 
 
 		 197 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0367345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2660  peptide deformylase  38.42 
 
 		 230 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.729564  normal  0.0430884 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0562  peptide deformylase  42.31 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5601  Peptide deformylase  44.65 
 
 		 182 aa  124  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.131759  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5928  Peptide deformylase  42.68 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.0170344 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1468  peptide deformylase  41.94 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0116921  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2436  peptide deformylase  40.35 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108704  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2532  peptide deformylase  39.62 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0014  peptide deformylase  41.82 
 
 		 230 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3120  peptide deformylase  44.9 
 
 		 177 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2273  peptide deformylase  41.61 
 
 		 177 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664016 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1726  peptide deformylase  42.42 
 
 		 221 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09550  peptide deformylase  39.05 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.255264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3885  peptide deformylase  39.74 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0724077  normal  0.763087 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2186  peptide deformylase  42.95 
 
 		 190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000219506 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5021  peptide deformylase  39.51 
 
 		 225 aa  114  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09360  peptide deformylase  42.35 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  40.74 
 
 		 175 aa  113  8.999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7321  Peptide deformylase  37.74 
 
 		 162 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0760  peptide deformylase  36.71 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0435683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1997  peptide deformylase  39.73 
 
 		 147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_666  peptide deformylase  38.93 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0240694  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  39.47 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0857  peptide deformylase  39.07 
 
 		 154 aa  110  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  40.69 
 
 		 153 aa  110  9e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0687  peptide deformylase  38.26 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.132535  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09890  peptide deformylase  37.5 
 
 		 180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132377 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1688  peptide deformylase  41.96 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1715  peptide deformylase  39.04 
 
 		 147 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2628  peptide deformylase  39.88 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.790989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3731  peptide deformylase  40.57 
 
 		 198 aa  107  5e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.535737  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0084  peptide deformylase  38.04 
 
 		 168 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.669645  decreased coverage  0.00000000000000447721 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  38.78 
 
 		 172 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1645  polypeptide deformylase  35.14 
 
 		 169 aa  107  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0567  peptide deformylase  40.67 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000525099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  38.62 
 
 		 187 aa  107  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2323  peptide deformylase  37.89 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.180908  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0245  polypeptide deformylase  36.14 
 
 		 171 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  36.02 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0087  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.68939  hitchhiker  0.00000133405 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  37.74 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0068  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00204301  unclonable  0.00000040176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0084  peptide deformylase  37.42 
 
 		 168 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.424252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0038  peptide deformylase  38.1 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0660  peptide deformylase  41.82 
 
 		 200 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0514  peptide deformylase  41.61 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.312606  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  34.67 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0854  peptide deformylase  40.91 
 
 		 215 aa  105  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1593  peptide deformylase  38.31 
 
 		 154 aa  105  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1062  peptide deformylase  38.67 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0021  peptide deformylase  35.4 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.243681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  38.6 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3690  peptide deformylase  38.67 
 
 		 156 aa  104  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  32.32 
 
 		 169 aa  103  8e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3881  peptide deformylase  38.67 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000146602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1757  peptide deformylase  37.74 
 
 		 166 aa  103  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3718  peptide deformylase  38.67 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2896  peptide deformylase  37.36 
 
 		 188 aa  103  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.277064  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0187  peptide deformylase  34.57 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000698863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>