293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1455 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  100 
 
 		 74 aa  148  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  52.7 
 
 		 110 aa  72  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  50 
 
 		 189 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  37.68 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  60.42 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  50 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  38.1 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  38.1 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  38.1 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  51.92 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  44.12 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  46.38 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  36.51 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  36.51 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  36.51 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  38.71 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.15 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  36.51 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  37.68 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  45.31 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  50 
 
 		 89 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  56 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  36.51 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  37.1 
 
 		 81 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  46 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  36.62 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  44.83 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  40.38 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  42.25 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  38.46 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  34.92 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  38.24 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  38.33 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  47.06 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  47.06 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  36 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  45.1 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  47.06 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  52.94 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  49.02 
 
 		 820 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  45.1 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  43.14 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  34.92 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  38.1 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50 
 
 		 834 aa  54.7  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  34.92 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  36.76 
 
 		 86 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  33.82 
 
 		 99 aa  53.9  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  36.23 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  32.86 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  43.14 
 
 		 75 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  48.08 
 
 		 115 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  42 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  44 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  42 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  36.51 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  36.51 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  42 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  36.51 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  31.43 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  42 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  42 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  40 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  42 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  42 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  34.38 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  40 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  41.67 
 
 		 89 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  36.67 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  42 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  38 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  36.51 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  33.82 
 
 		 78 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  29.69 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48 
 
 		 837 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  34.38 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  48.98 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  38.46 
 
 		 85 aa  51.6  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>