More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1442 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_24290  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  60.37 
 
 
599 aa  711  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.954614  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1122  AMP-dependent synthetase and ligase  59.33 
 
 
606 aa  693  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  55.3 
 
 
622 aa  665  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2003  AMP-dependent synthetase and ligase  61.47 
 
 
606 aa  734  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0649106  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15760  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  66.94 
 
 
606 aa  813  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120658  normal  0.270208 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3241  AMP-dependent synthetase and ligase  54.35 
 
 
599 aa  636  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00258779  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0962  AMP-dependent synthetase and ligase  59.13 
 
 
604 aa  693  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.182465  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2594  AMP-dependent synthetase and ligase  57.24 
 
 
608 aa  650  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1398  AMP-dependent synthetase and ligase  61.79 
 
 
602 aa  734  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1442  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
603 aa  1224  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.526185  normal  0.152333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1901  AMP-dependent synthetase and ligase  58.96 
 
 
606 aa  668  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122495  hitchhiker  3.27223e-05 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3051  AMP-dependent synthetase and ligase  57 
 
 
605 aa  662  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00585755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2070  AMP-dependent synthetase and ligase  63.06 
 
 
600 aa  746  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.432369  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14230  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  52.33 
 
 
602 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4468  AMP-dependent synthetase and ligase  52.42 
 
 
597 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2696  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.68 
 
 
597 aa  618  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1547  AMP-dependent synthetase and ligase  51.92 
 
 
619 aa  606  1e-172  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.174488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1305  AMP-dependent synthetase and ligase  52.58 
 
 
593 aa  605  1e-172  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273141  normal  0.793709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3277  AMP-dependent synthetase and ligase  52.75 
 
 
599 aa  603  1e-171  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1548  AMP-dependent synthetase and ligase  52.13 
 
 
602 aa  604  1e-171  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.110931 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3509  AMP-dependent synthetase and ligase  53.26 
 
 
599 aa  601  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.0246515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3330  AMP-dependent synthetase and ligase  53.24 
 
 
616 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  51 
 
 
595 aa  588  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3113  AMP-dependent synthetase and ligase  52.24 
 
 
600 aa  588  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3131  AMP-dependent synthetase and ligase  50.83 
 
 
599 aa  585  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1031  long-chain fatty-acid-CoA ligase  50.99 
 
 
598 aa  585  1e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6067  AMP-dependent synthetase and ligase  51.31 
 
 
615 aa  581  1e-164  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13790  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  48.52 
 
 
611 aa  568  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0545474  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2680  AMP-dependent synthetase and ligase  49.75 
 
 
601 aa  569  1e-161  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.487535  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  51 
 
 
599 aa  566  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.658552  normal  0.476459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1383  AMP-dependent synthetase and ligase  47.6 
 
 
602 aa  557  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.321435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1204  AMP-dependent synthetase and ligase  48.52 
 
 
609 aa  555  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.110372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4869  AMP-dependent synthetase and ligase  47.19 
 
 
600 aa  553  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.424656  normal  0.600956 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24920  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  51.16 
 
 
599 aa  552  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.485954 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1274  AMP-dependent synthetase and ligase  48.52 
 
 
609 aa  542  1e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.55356e-10 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1304  AMP-dependent synthetase and ligase  49.66 
 
 
591 aa  539  1e-152  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1040  AMP-dependent synthetase and ligase  47.85 
 
 
597 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.270253  normal  0.341952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2962  AMP-dependent synthetase and ligase  50.96 
 
 
601 aa  529  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.746636  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3046  AMP-dependent synthetase and ligase  50.27 
 
 
607 aa  530  1e-149  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3549  AMP-dependent synthetase and ligase  47.83 
 
 
602 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.821705  normal  0.444689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3282  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 
597 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12215  long-chain fatty-acid-CoA ligase fadD15  48.25 
 
 
600 aa  524  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3344  AMP-dependent synthetase and ligase  49.13 
 
 
597 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.260522  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3293  AMP-dependent synthetase and ligase  48.95 
 
 
597 aa  518  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.236935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1174  AMP-dependent synthetase and ligase  47.02 
 
 
597 aa  521  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.393726  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1820  AMP-dependent synthetase and ligase  47.52 
 
 
604 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.591607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3623  AMP-dependent synthetase and ligase  46.26 
 
 
596 aa  515  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01120  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  47.63 
 
 
606 aa  504  1e-141  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2411  AMP-dependent synthetase and ligase  47.02 
 
 
612 aa  497  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183417  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0949  AMP-binding enzyme  42.12 
 
 
603 aa  494  1e-138  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05330  AMP-forming long-chain acyl-CoA synthetase  44.99 
 
 
612 aa  494  1e-138  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0976  AMP-dependent synthetase and ligase  47.54 
 
 
615 aa  494  1e-138  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00986526  normal  0.875047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2560  AMP-dependent synthetase and ligase  45.83 
 
 
632 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83853  hitchhiker  2.76011e-05 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1925  long-chain acyl-CoA synthetase  41.5 
 
 
618 aa  476  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  44.57 
 
 
607 aa  477  1e-133  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0812  AMP-binding enzyme  41.95 
 
 
679 aa  439  1e-122  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0592  long-chain acyl-CoA synthetase  41.33 
 
 
677 aa  426  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0860  AMP-binding enzyme  40.86 
 
 
682 aa  424  1e-117  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0401  long-chain acyl-CoA synthetase  39.97 
 
 
701 aa  421  1e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0944  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
622 aa  417  1e-115  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1932  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 
590 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.333973  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1021  AMP-dependent synthetase and ligase  38.64 
 
 
607 aa  384  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.336741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 
633 aa  370  1e-101  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1299  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
609 aa  368  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3729  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
594 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0968  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 
607 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114084  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1519  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 
610 aa  365  1e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.924461  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3196  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
622 aa  365  2e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1529  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 
605 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.275012  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 
649 aa  363  6e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1619  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 
604 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0702243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1524  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 
604 aa  361  2e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1594  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
617 aa  359  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.129447  normal  0.216287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2886  AMP-dependent synthetase and ligase  36.32 
 
 
633 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1487  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
610 aa  359  8e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0972  long-chain fatty-acid-CoA ligase  37.01 
 
 
610 aa  359  9e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2345  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 
604 aa  358  2e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0981  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 
606 aa  356  7e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0925  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 
606 aa  353  6e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0984  AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 
606 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.423354  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1391  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
610 aa  351  2e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3595  long-chain-fatty-acid--CoA ligase (acyl-CoA synthetase)  33.9 
 
 
587 aa  350  5e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2618  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
610 aa  349  9e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3514  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
612 aa  348  1e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3960  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 
635 aa  341  2e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.522834  normal  0.0456544 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1388  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 
602 aa  340  6e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0314  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
597 aa  338  2e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.90287e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0377  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 
652 aa  337  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2081  AMP-dependent synthetase and ligase  33.16 
 
 
598 aa  336  6e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.39737  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1894  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 
613 aa  334  2e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.391707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  33.39 
 
 
603 aa  334  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.42642e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3607  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
602 aa  334  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.12071  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2120  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
672 aa  333  5e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.342483  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2186  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
669 aa  332  8e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.197211  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
602 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.438737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 
602 aa  332  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0482312  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1135  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.97 
 
 
610 aa  330  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.420204  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4679  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 
596 aa  330  5e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.155196  normal  0.22473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2236  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 
660 aa  328  2e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.83669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3732  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
590 aa  326  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>