More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1441 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  100 
 
 
314 aa  624  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  72.29 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  68.15 
 
 
314 aa  392  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  65.29 
 
 
315 aa  380  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  58.47 
 
 
312 aa  318  1e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  55.91 
 
 
311 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  50.32 
 
 
352 aa  305  6e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  50.8 
 
 
342 aa  301  8.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  52.37 
 
 
360 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  53.38 
 
 
323 aa  293  3e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  49.68 
 
 
315 aa  288  9e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  50.8 
 
 
361 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  52.73 
 
 
314 aa  281  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  53 
 
 
330 aa  280  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  49.04 
 
 
313 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  51.92 
 
 
315 aa  271  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  48.87 
 
 
314 aa  271  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  50.64 
 
 
313 aa  267  1e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  47.91 
 
 
313 aa  265  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  51.92 
 
 
315 aa  259  6e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  48.23 
 
 
363 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  50.16 
 
 
320 aa  256  4e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  45.54 
 
 
325 aa  253  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  50 
 
 
312 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  46.77 
 
 
363 aa  252  7e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  45.08 
 
 
316 aa  248  1e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  48.73 
 
 
315 aa  240  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  45.37 
 
 
313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  48.26 
 
 
315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  42.24 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  47.47 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  38.21 
 
 
314 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  44.13 
 
 
335 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  40.06 
 
 
354 aa  202  5e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  35.22 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  33.96 
 
 
312 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  36.68 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  34.36 
 
 
320 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.58 
 
 
315 aa  168  9e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  34.04 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  34.69 
 
 
317 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  37.97 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.02 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  33.54 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  37.7 
 
 
300 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  40.51 
 
 
319 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  35.85 
 
 
332 aa  158  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.68 
 
 
323 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  34.98 
 
 
328 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  35.94 
 
 
335 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  31.37 
 
 
316 aa  154  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.85 
 
 
313 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  31.87 
 
 
317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.86 
 
 
321 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.94 
 
 
315 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.94 
 
 
315 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  35.22 
 
 
321 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  32.82 
 
 
316 aa  150  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  38.46 
 
 
340 aa  149  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  34.59 
 
 
318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  34.26 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.4 
 
 
327 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  34.89 
 
 
321 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.4 
 
 
327 aa  147  3e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  31.66 
 
 
321 aa  146  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.49 
 
 
321 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  36.62 
 
 
332 aa  144  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  33.23 
 
 
314 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.44 
 
 
303 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  36.28 
 
 
300 aa  144  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  35.31 
 
 
323 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  30.06 
 
 
325 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  35.03 
 
 
319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  35.37 
 
 
315 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.51 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.67 
 
 
299 aa  139  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  32.39 
 
 
322 aa  139  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.49 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.91 
 
 
298 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  40.38 
 
 
325 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.09 
 
 
322 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  34.6 
 
 
418 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32 
 
 
410 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.99 
 
 
317 aa  136  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  32.49 
 
 
308 aa  136  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  34.19 
 
 
302 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  37.62 
 
 
314 aa  136  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  34.06 
 
 
318 aa  136  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  34.37 
 
 
328 aa  135  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0466  ROK family protein  31.56 
 
 
313 aa  134  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  32.48 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>