More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1346 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1346  twitching motility protein  100 
 
 		 566 aa  1158    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17750  pilus retraction protein PilT  73.51 
 
 		 397 aa  566  1e-160  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1823  twitching motility protein  76.23 
 
 		 378 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.227924  normal  0.842745 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3027  twitching motility protein  68.18 
 
 		 382 aa  511  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1321  twitching motility protein  72.52 
 
 		 362 aa  502  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0136212 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1126  twitching motility protein  62.96 
 
 		 430 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1165  pilus retraction ATPase PilT  63.66 
 
 		 367 aa  410  1e-113  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.591926  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4827  twitching motility protein  55.87 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.465197  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1035  twitching motility protein  54.13 
 
 		 360 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0874  twitching motility protein  52.96 
 
 		 360 aa  385  1e-105  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3256  twitching motility protein  54.13 
 
 		 360 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1883  twitching motility protein  53.76 
 
 		 351 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000175789  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1492  twitching motility protein PilT  52.79 
 
 		 365 aa  378  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144768  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1394  pilus retraction protein PilT  56.08 
 
 		 365 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1632  twitching motility protein  55.69 
 
 		 366 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0657  twitching motility protein  53.3 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0657  twitching motility protein  53.58 
 
 		 366 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1553  twitching motility protein  57.89 
 
 		 339 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0623  twitching motility protein  53.3 
 
 		 366 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2594  twitching motility protein  55.39 
 
 		 366 aa  373  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3527  twitching motility protein  53.94 
 
 		 344 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.318184  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0668  twitching motility protein  55.69 
 
 		 365 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.157686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2215  twitching motility protein  53.6 
 
 		 368 aa  375  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2681  twitching motility protein  55.99 
 
 		 368 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0951  twitching motility protein  54.6 
 
 		 372 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0536  twitching motility protein  51.66 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2419  pilus retraction ATPase PilT  52.54 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0375  pilus retraction protein PilT  50.28 
 
 		 372 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0264  twitching motility protein PilT  51.59 
 
 		 349 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3878  twitching motility protein  55.11 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0576559  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2107  twitching motility protein  52.57 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0441  twitching motility protein  51.59 
 
 		 349 aa  369  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000176811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3221  twitching motility protein  54.65 
 
 		 356 aa  369  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1724  twitching motility protein  53.91 
 
 		 360 aa  365  1e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1969  twitching motility protein  50.42 
 
 		 374 aa  365  1e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1505  twitching motility protein  51.73 
 
 		 349 aa  365  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.831858  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2859  twitching motility protein  53.64 
 
 		 345 aa  365  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00311104  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0593  twitching motility protein  54.35 
 
 		 370 aa  364  3e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.499274  normal  0.0167916 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1106  twitching motility protein  52.72 
 
 		 351 aa  363  3e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321082  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0278  twitching motility protein  54.8 
 
 		 347 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0067  twitching motility protein  53.43 
 
 		 356 aa  363  4e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.78052e-25 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  52.99 
 
 		 344 aa  362  8e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0084  twitching motility protein  54.74 
 
 		 357 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2070  twitching motility protein  48.49 
 
 		 362 aa  362  8e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4696  twitching motility protein  50.98 
 
 		 374 aa  362  9e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.787911 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1138  twitching motility protein  53.64 
 
 		 345 aa  362  1e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2513  twitching motility protein  53.98 
 
 		 365 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0396  twitching motility protein  54.18 
 
 		 347 aa  361  2e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.203182 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0264  twitching motility protein  50.98 
 
 		 403 aa  361  2e-98  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1654  twitching motility protein  54.19 
 
 		 363 aa  361  2e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3400  pilus retraction protein PilT  52.85 
 
 		 356 aa  360  3e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2681  twitching motility protein  52.87 
 
 		 349 aa  360  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.172502  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0293  twitching motility protein  52.37 
 
 		 350 aa  360  3e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5045  twitching motility protein  54.88 
 
 		 344 aa  360  4e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.597487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0267  pilus retraction protein PilT  53.25 
 
 		 350 aa  360  4e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0969  twitching motility protein  52.92 
 
 		 365 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1995  hypothetical protein  52.69 
 
 		 344 aa  360  5e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0478  pilus retraction protein PilT  54.41 
 
 		 344 aa  359  6e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1195  pilus retraction ATPase PilT  51.78 
 
 		 345 aa  359  7e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.035221  normal  0.726938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4813  twitching motility protein  53.87 
 
 		 347 aa  359  9e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0412  twitching motility protein  53.87 
 
 		 347 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0420  twitching motility protein  53.87 
 
 		 347 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2148  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  52.21 
 
 		 374 aa  358  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1750  twitching motility protein  51.48 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1391  twitching motility protein  48.06 
 
 		 375 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.899661  normal  0.0234159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1194  pilus retraction ATPase PilT  51.78 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0809497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1265  pilus retraction ATPase PilT  51.78 
 
 		 345 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00395146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3182  twitching motility protein  52.73 
 
 		 345 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000300358  normal  0.0171368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3039  twitching motility protein  52.73 
 
 		 345 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00110048  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1339  twitching motility protein  52.73 
 
 		 345 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0176269  hitchhiker  0.0000000675214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1128  twitching motility protein  53.03 
 
 		 345 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0169735  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2476  twitching motility protein  53.33 
 
 		 345 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3351  twitching motility protein PilT  52.42 
 
 		 345 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1068  twitching motility protein  53.25 
 
 		 347 aa  357  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.365161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1688  twitching motility protein  54.18 
 
 		 347 aa  356  5e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0436  twitching motility protein PilT  52.55 
 
 		 356 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1744  twitching motility protein  52.69 
 
 		 362 aa  356  5.999999999999999e-97  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3760  Pili biogenesis ATPase  53.87 
 
 		 347 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112866  normal  0.149271 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3053  twitching motility protein  52.46 
 
 		 360 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2686  twitching motility protein  52.73 
 
 		 345 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1333  twitching motility protein  53.54 
 
 		 345 aa  355  1e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0112575 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3662  twitching motility protein PilT  51.74 
 
 		 347 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.69581  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3024  twitching motility protein  52.42 
 
 		 345 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00035663  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3703  twitching motility protein  52.27 
 
 		 347 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05980  Tfp pilus assembly protein, pilus retraction ATPase PilT  53.94 
 
 		 360 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1188  twitching motility protein  49.71 
 
 		 358 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.231991  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1841  twitching motility protein  49 
 
 		 349 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.616267  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1917  twitching motility protein  51.87 
 
 		 360 aa  353  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.979204 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3640  twitching motility protein PilT  54.71 
 
 		 344 aa  353  5e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4149  twitching motility protein  52.54 
 
 		 344 aa  353  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.84862 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1737  twitching motility protein PilT  52.29 
 
 		 350 aa  352  8e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00977471  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2413  twitching motility protein  52.38 
 
 		 351 aa  352  1e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1233  twitching motility protein PilT  51.65 
 
 		 344 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000670856  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2020  twitching motility protein PilT  52.57 
 
 		 350 aa  352  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0637  twitching motility protein  53.25 
 
 		 347 aa  352  1e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1537  twitching motility protein PilT  50.45 
 
 		 344 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2102  twitching motility protein  51.75 
 
 		 348 aa  349  6e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.927915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2918  twitching motility protein  52.5 
 
 		 347 aa  349  7e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2506  twitching motility protein  52.5 
 
 		 347 aa  349  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2682  twitching motility protein  53.12 
 
 		 347 aa  349  8e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.310327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>